MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN2

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017480	ACC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017480	GTT	2	6	117	122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017480	CCA	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017480	AGT	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017480	TTG	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017480	CAT	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017480	TTG	2	6	490	495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017480	TGC	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017480	CTG	2	6	750	755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017480	TAG	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017480	ATC	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
12	NC_017480	TTG	2	6	854	859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839805
13	NC_017480	TAA	2	6	863	868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839805
14	NC_017480	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839805
15	NC_017480	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
16	NC_017480	CGT	2	6	1008	1013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839805
17	NC_017480	TCG	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839805
18	NC_017480	ACT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
19	NC_017480	TTG	2	6	1118	1123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839805
20	NC_017480	AAT	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839805
21	NC_017480	ATC	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
22	NC_017480	TTG	2	6	1385	1390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839805
23	NC_017480	TTC	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839805
24	NC_017480	CTT	2	6	1971	1976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839805
25	NC_017480	ATC	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
26	NC_017480	GGC	2	6	2007	2012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839805
27	NC_017480	CCT	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385839805
28	NC_017480	TGT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839805
29	NC_017480	CTG	2	6	2219	2224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017480	AGG	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017480	AAG	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017480	ATT	2	6	2452	2457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017480	GTG	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017480	GAA	2	6	2777	2782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017480	TTC	2	6	2993	2998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017480	CAC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839806
37	NC_017480	TTG	2	6	3256	3261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839806
38	NC_017480	TGT	2	6	3350	3355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839806
39	NC_017480	GTG	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839806
40	NC_017480	TTC	2	6	3382	3387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839806
41	NC_017480	GCC	2	6	3449	3454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839806
42	NC_017480	ACT	2	6	3455	3460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839806
43	NC_017480	ATA	2	6	3808	3813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017480	TCT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017480	CCG	2	6	3887	3892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017480	TGC	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017480	CTT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017480	CTG	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839807
49	NC_017480	CCA	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839807
50	NC_017480	TCA	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839807
51	NC_017480	GGT	2	6	4361	4366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839807
52	NC_017480	TAA	2	6	4387	4392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839807
53	NC_017480	CGC	2	6	4400	4405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839807
54	NC_017480	TTG	2	6	4408	4413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839807
55	NC_017480	TCA	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839807
56	NC_017480	TGT	2	6	4529	4534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839807
57	NC_017480	TTA	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839807
58	NC_017480	CTT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839807
59	NC_017480	TTG	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839807
60	NC_017480	TGG	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017480	AAC	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017480	GTT	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017480	AAT	2	6	5656	5661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017480	ATT	2	6	5763	5768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017480	AGC	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017480	CTT	2	6	5915	5920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017480	TTC	2	6	6000	6005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017480	TTA	2	6	6058	6063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017480	TTG	2	6	6069	6074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017480	TTA	2	6	6175	6180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839808
71	NC_017480	GCT	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839808
72	NC_017480	TCA	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839808
73	NC_017480	CAA	2	6	6281	6286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839808
74	NC_017480	GTT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839808
75	NC_017480	CAT	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839808
76	NC_017480	TTC	2	6	6649	6654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839808
77	NC_017480	GTT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839808
78	NC_017480	TAG	2	6	6736	6741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839808
79	NC_017480	GTT	2	6	6791	6796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839808
80	NC_017480	TAA	2	6	6828	6833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839808
81	NC_017480	TAA	2	6	6876	6881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839808
82	NC_017480	AAT	2	6	6905	6910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839808
83	NC_017480	TTG	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017480	TTG	2	6	7012	7017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017480	TCA	2	6	7046	7051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839809
86	NC_017480	GCC	2	6	7065	7070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839809
87	NC_017480	CTT	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839809
88	NC_017480	GTT	2	6	7425	7430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839809
89	NC_017480	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017480	TAC	2	6	7695	7700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017480	GAC	2	6	7719	7724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017480	AGT	2	6	7748	7753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017480	CTC	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017480	ATT	2	6	7823	7828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017480	AAT	2	6	7985	7990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017480	ATT	3	9	8028	8036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017480	GAA	2	6	8088	8093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017480	ATG	2	6	8118	8123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839810
99	NC_017480	CGG	2	6	8126	8131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839810
100	NC_017480	GAA	2	6	8202	8207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839810
101	NC_017480	TGA	2	6	8339	8344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839810
102	NC_017480	AGA	2	6	8354	8359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839810
103	NC_017480	GGT	2	6	8502	8507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839810
104	NC_017480	TCT	2	6	8667	8672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839810
105	NC_017480	GAA	2	6	8685	8690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839810
106	NC_017480	GCC	2	6	8789	8794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839810
107	NC_017480	TTG	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839810
108	NC_017480	TGA	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017480	AAG	2	6	8984	8989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017480	TTC	2	6	9034	9039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839811
111	NC_017480	CTA	2	6	9195	9200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839811
112	NC_017480	GAA	2	6	9209	9214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839811
113	NC_017480	TCA	2	6	9234	9239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839811
114	NC_017480	GCA	2	6	9250	9255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839811
115	NC_017480	ACC	2	6	9435	9440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839811
116	NC_017480	TTC	2	6	9538	9543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017480	AGG	2	6	9597	9602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017480	AGA	2	6	9618	9623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017480	ATC	2	6	9758	9763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
120	NC_017480	GTG	2	6	9851	9856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839812
121	NC_017480	TCA	2	6	9900	9905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
122	NC_017480	TCA	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
123	NC_017480	CAT	2	6	10012	10017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
124	NC_017480	TAC	2	6	10256	10261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
125	NC_017480	ATC	2	6	10262	10267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
126	NC_017480	TAG	2	6	10457	10462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839812
127	NC_017480	TGG	2	6	10612	10617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017480	ATC	2	6	10722	10727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017480	TGT	2	6	10734	10739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017480	GGT	2	6	10757	10762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017480	GAT	2	6	10763	10768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017480	TAG	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017480	TTA	2	6	10803	10808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017480	ATT	2	6	10961	10966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839813
135	NC_017480	TCA	2	6	11014	11019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839813
136	NC_017480	CTA	2	6	11165	11170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839813
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259	NC_017480	TCT	2	6	20249	20254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.