MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017479	AACTC	2	10	2038	2047	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017479	AATTT	2	10	3388	3397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017479	GAAAT	2	10	4926	4935	60 %	20 %	20 %	0 %	385839616
4	NC_017479	AATTT	2	10	5861	5870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017479	TATAC	2	10	8369	8378	40 %	40 %	0 %	20 %	385839617
6	NC_017479	TATGA	2	10	8379	8388	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017479	CTAAA	2	10	8939	8948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017479	CAAAT	2	10	9343	9352	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017479	ATGAC	2	10	11544	11553	40 %	20 %	20 %	20 %	385839619
10	NC_017479	CAAAG	2	10	12516	12525	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017479	CGGAT	2	10	13162	13171	20 %	20 %	40 %	20 %	385839620
12	NC_017479	TAAAA	2	10	14587	14596	80 %	20 %	0 %	0 %	385839620
13	NC_017479	TATAA	2	10	14836	14845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017479	TTTTG	2	10	17493	17502	0 %	80 %	20 %	0 %	385839622
15	NC_017479	CTTTT	2	10	22823	22832	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017479	TGTCC	2	10	23010	23019	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017479	CCTCA	2	10	23675	23684	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017479	AGTCA	2	10	23992	24001	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017479	AATTT	2	10	24253	24262	40 %	60 %	0 %	0 %	385839626
20	NC_017479	ATGTT	2	10	27390	27399	20 %	60 %	20 %	0 %	385839628
21	NC_017479	GATTC	2	10	29484	29493	20 %	40 %	20 %	20 %	385839631
22	NC_017479	TTGCC	2	10	33319	33328	0 %	40 %	20 %	40 %	385839634
23	NC_017479	CTTTT	2	10	39346	39355	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017479	TTAAA	2	10	39713	39722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017479	ATTAG	2	10	40022	40031	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017479	TATAA	2	10	40134	40143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017479	TACGA	2	10	40960	40969	40 %	20 %	20 %	20 %	385839639

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.