MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017479	TGGT	2	8	433	440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017479	CTTG	2	8	456	463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017479	GCCG	2	8	610	617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017479	TGAT	2	8	796	803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017479	TCAA	2	8	845	852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017479	ATTC	2	8	969	976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017479	TTTA	2	8	1256	1263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017479	GAAA	3	12	2264	2275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017479	TAAC	2	8	2320	2327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017479	TGAG	2	8	2342	2349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017479	AGTA	2	8	2356	2363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017479	CAAT	2	8	2643	2650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017479	TTTA	2	8	3068	3075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017479	TAAA	2	8	3511	3518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017479	AGTA	2	8	3692	3699	50 %	25 %	25 %	0 %	385839615
16	NC_017479	ATAA	2	8	3939	3946	75 %	25 %	0 %	0 %	385839615
17	NC_017479	AAAT	2	8	4112	4119	75 %	25 %	0 %	0 %	385839615
18	NC_017479	AATG	2	8	4505	4512	50 %	25 %	25 %	0 %	385839616
19	NC_017479	ATTA	2	8	4569	4576	50 %	50 %	0 %	0 %	385839616
20	NC_017479	AAAT	2	8	4612	4619	75 %	25 %	0 %	0 %	385839616
21	NC_017479	AAAT	2	8	4838	4845	75 %	25 %	0 %	0 %	385839616
22	NC_017479	GGTT	2	8	4969	4976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017479	CAAT	2	8	5114	5121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017479	TTTA	2	8	5539	5546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017479	AAAT	2	8	6660	6667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017479	ATTT	2	8	7023	7030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017479	TCAG	2	8	7268	7275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017479	CTTT	2	8	7438	7445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017479	TGAT	2	8	7655	7662	25 %	50 %	25 %	0 %	385839617
30	NC_017479	ATTT	2	8	9640	9647	25 %	75 %	0 %	0 %	385839618
31	NC_017479	AGCG	2	8	10503	10510	25 %	0 %	50 %	25 %	385839618
32	NC_017479	AGCA	2	8	10756	10763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017479	GTGG	2	8	11133	11140	0 %	25 %	75 %	0 %	385839619
34	NC_017479	TTAA	2	8	11294	11301	50 %	50 %	0 %	0 %	385839619
35	NC_017479	GAAC	2	8	11512	11519	50 %	0 %	25 %	25 %	385839619
36	NC_017479	CAAA	2	8	11607	11614	75 %	0 %	0 %	25 %	385839619
37	NC_017479	GAAA	2	8	12364	12371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017479	AAGG	2	8	12639	12646	50 %	0 %	50 %	0 %	385839620
39	NC_017479	AAAG	2	8	12755	12762	75 %	0 %	25 %	0 %	385839620
40	NC_017479	AGAA	2	8	12835	12842	75 %	0 %	25 %	0 %	385839620
41	NC_017479	CGCA	2	8	12928	12935	25 %	0 %	25 %	50 %	385839620
42	NC_017479	GCAA	2	8	13021	13028	50 %	0 %	25 %	25 %	385839620
43	NC_017479	TGGT	2	8	13068	13075	0 %	50 %	50 %	0 %	385839620
44	NC_017479	AGTT	2	8	13772	13779	25 %	50 %	25 %	0 %	385839620
45	NC_017479	ATTA	2	8	14380	14387	50 %	50 %	0 %	0 %	385839620
46	NC_017479	ATCA	2	8	14767	14774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017479	AAGC	2	8	15213	15220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017479	ATTC	2	8	15712	15719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017479	GAAA	2	8	16526	16533	75 %	0 %	25 %	0 %	385839621
50	NC_017479	TTAA	2	8	16542	16549	50 %	50 %	0 %	0 %	385839621
51	NC_017479	AAAG	2	8	16616	16623	75 %	0 %	25 %	0 %	385839621
52	NC_017479	TGGT	2	8	16819	16826	0 %	50 %	50 %	0 %	385839621
53	NC_017479	AGAT	2	8	17179	17186	50 %	25 %	25 %	0 %	385839622
54	NC_017479	ATTA	2	8	17241	17248	50 %	50 %	0 %	0 %	385839622
55	NC_017479	CAGT	2	8	17780	17787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017479	TTCA	2	8	17839	17846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017479	AATT	2	8	18478	18485	50 %	50 %	0 %	0 %	385839623
58	NC_017479	GATT	2	8	19066	19073	25 %	50 %	25 %	0 %	385839623
59	NC_017479	TATT	2	8	19267	19274	25 %	75 %	0 %	0 %	385839623
60	NC_017479	CCAG	2	8	19323	19330	25 %	0 %	25 %	50 %	385839624
61	NC_017479	GTTA	2	8	19545	19552	25 %	50 %	25 %	0 %	385839624
62	NC_017479	AATT	2	8	19901	19908	50 %	50 %	0 %	0 %	385839624
63	NC_017479	AAAT	2	8	20009	20016	75 %	25 %	0 %	0 %	385839624
64	NC_017479	AAAT	2	8	20033	20040	75 %	25 %	0 %	0 %	385839624
65	NC_017479	TTGT	2	8	20577	20584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017479	ATTT	2	8	20814	20821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017479	TCGG	2	8	21725	21732	0 %	25 %	50 %	25 %	385839625
68	NC_017479	TCCG	2	8	21908	21915	0 %	25 %	25 %	50 %	385839625
69	NC_017479	TGGT	2	8	21936	21943	0 %	50 %	50 %	0 %	385839625
70	NC_017479	CAGT	2	8	22222	22229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017479	TTCA	2	8	22280	22287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017479	CCTT	2	8	22457	22464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017479	ATCA	2	8	22582	22589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017479	TTTA	2	8	22715	22722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017479	CATC	2	8	23229	23236	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017479	TTTC	2	8	23331	23338	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017479	AGCA	2	8	23812	23819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017479	CTTA	3	12	24041	24052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017479	CTGA	2	8	24724	24731	25 %	25 %	25 %	25 %	385839626
80	NC_017479	AACT	2	8	24761	24768	50 %	25 %	0 %	25 %	385839626
81	NC_017479	GTCG	2	8	24859	24866	0 %	25 %	50 %	25 %	385839626
82	NC_017479	GATC	2	8	25081	25088	25 %	25 %	25 %	25 %	385839626
83	NC_017479	AAAG	2	8	25461	25468	75 %	0 %	25 %	0 %	385839626
84	NC_017479	CTTG	2	8	25966	25973	0 %	50 %	25 %	25 %	385839627
85	NC_017479	TTGA	2	8	26274	26281	25 %	50 %	25 %	0 %	385839627
86	NC_017479	GTTA	2	8	26651	26658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017479	TTGA	2	8	26832	26839	25 %	50 %	25 %	0 %	385839628
88	NC_017479	TTTA	2	8	27155	27162	25 %	75 %	0 %	0 %	385839628
89	NC_017479	ATGG	2	8	27295	27302	25 %	25 %	50 %	0 %	385839628
90	NC_017479	TTTC	2	8	27447	27454	0 %	75 %	0 %	25 %	385839628
91	NC_017479	TTTA	2	8	28547	28554	25 %	75 %	0 %	0 %	385839629
92	NC_017479	AATT	2	8	28669	28676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017479	AAAG	2	8	28909	28916	75 %	0 %	25 %	0 %	385839630
94	NC_017479	ATTT	2	8	29080	29087	25 %	75 %	0 %	0 %	385839630
95	NC_017479	TATC	2	8	29131	29138	25 %	50 %	0 %	25 %	385839630
96	NC_017479	AATG	2	8	29184	29191	50 %	25 %	25 %	0 %	385839630
97	NC_017479	GGTC	2	8	29613	29620	0 %	25 %	50 %	25 %	385839631
98	NC_017479	CAAT	2	8	29803	29810	50 %	25 %	0 %	25 %	385839631
99	NC_017479	ATTG	2	8	29934	29941	25 %	50 %	25 %	0 %	385839631
100	NC_017479	ATCA	2	8	30376	30383	50 %	25 %	0 %	25 %	385839632
101	NC_017479	AGTT	2	8	30603	30610	25 %	50 %	25 %	0 %	385839632
102	NC_017479	ATTT	2	8	31236	31243	25 %	75 %	0 %	0 %	385839633
103	NC_017479	TTTA	2	8	31522	31529	25 %	75 %	0 %	0 %	385839633
104	NC_017479	AACA	2	8	31617	31624	75 %	0 %	0 %	25 %	385839633
105	NC_017479	TAAA	2	8	31821	31828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017479	GAAA	2	8	32291	32298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017479	TAAG	2	8	32329	32336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017479	ACAA	2	8	33676	33683	75 %	0 %	0 %	25 %	385839634
109	NC_017479	TTGA	2	8	33684	33691	25 %	50 %	25 %	0 %	385839634
110	NC_017479	GCTA	2	8	33884	33891	25 %	25 %	25 %	25 %	385839634
111	NC_017479	ACTT	2	8	33906	33913	25 %	50 %	0 %	25 %	385839634
112	NC_017479	TACG	2	8	33935	33942	25 %	25 %	25 %	25 %	385839634
113	NC_017479	AACA	2	8	34281	34288	75 %	0 %	0 %	25 %	385839634
114	NC_017479	ATCA	2	8	34781	34788	50 %	25 %	0 %	25 %	385839635
115	NC_017479	GATG	2	8	34927	34934	25 %	25 %	50 %	0 %	385839635
116	NC_017479	GACC	2	8	35311	35318	25 %	0 %	25 %	50 %	385839635
117	NC_017479	TAGT	2	8	35452	35459	25 %	50 %	25 %	0 %	385839635
118	NC_017479	GGCC	2	8	35747	35754	0 %	0 %	50 %	50 %	385839636
119	NC_017479	GTGG	2	8	36022	36029	0 %	25 %	75 %	0 %	385839636
120	NC_017479	CCAG	2	8	36814	36821	25 %	0 %	25 %	50 %	385839636
121	NC_017479	CTAG	2	8	36840	36847	25 %	25 %	25 %	25 %	385839636
122	NC_017479	CTAG	2	8	37168	37175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017479	CAGG	2	8	38016	38023	25 %	0 %	50 %	25 %	385839637
124	NC_017479	TTTC	2	8	38146	38153	0 %	75 %	0 %	25 %	385839637
125	NC_017479	GTAG	2	8	38394	38401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017479	TCTT	2	8	39033	39040	0 %	75 %	0 %	25 %	385839638
127	NC_017479	AGAT	2	8	39358	39365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017479	AGCT	2	8	40225	40232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017479	TAAA	2	8	41679	41686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017479	TACT	2	8	41726	41733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017479	TTCC	2	8	42007	42014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017479	GGGC	2	8	42652	42659	0 %	0 %	75 %	25 %	385839640
133	NC_017479	CACT	2	8	42825	42832	25 %	25 %	0 %	50 %	385839640
134	NC_017479	ATCT	2	8	43074	43081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017479	TAAC	2	8	43714	43721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017479	TGGC	2	8	43860	43867	0 %	25 %	50 %	25 %	385839641
137	NC_017479	TGGT	2	8	44303	44310	0 %	50 %	50 %	0 %	385839641
138	NC_017479	CTTG	2	8	44326	44333	0 %	50 %	25 %	25 %	385839641

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.