MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017479	TGGT	2	8	433	440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017479	CTTG	2	8	456	463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017479	GCCG	2	8	610	617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017479	TGAT	2	8	796	803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017479	TCAA	2	8	845	852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017479	ATTC	2	8	969	976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017479	TTTA	2	8	1256	1263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017479	GAAA	3	12	2264	2275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017479	TAAC	2	8	2320	2327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017479	TGAG	2	8	2342	2349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017479	AGTA	2	8	2356	2363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017479	CAAT	2	8	2643	2650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017479	TTTA	2	8	3068	3075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017479	TAAA	2	8	3511	3518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017479	GGTT	2	8	4969	4976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017479	CAAT	2	8	5114	5121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017479	TTTA	2	8	5539	5546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017479	AAAT	2	8	6660	6667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017479	ATTT	2	8	7023	7030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017479	TCAG	2	8	7268	7275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017479	CTTT	2	8	7438	7445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017479	AGCA	2	8	10756	10763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017479	GAAA	2	8	12364	12371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017479	ATCA	2	8	14767	14774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017479	AAGC	2	8	15213	15220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017479	ATTC	2	8	15712	15719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017479	CAGT	2	8	17780	17787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017479	TTCA	2	8	17839	17846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017479	TTGT	2	8	20577	20584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017479	ATTT	2	8	20814	20821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017479	CAGT	2	8	22222	22229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017479	TTCA	2	8	22280	22287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017479	CCTT	2	8	22457	22464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017479	ATCA	2	8	22582	22589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017479	TTTA	2	8	22715	22722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017479	CATC	2	8	23229	23236	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017479	TTTC	2	8	23331	23338	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017479	AGCA	2	8	23812	23819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017479	CTTA	3	12	24041	24052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017479	GTTA	2	8	26651	26658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017479	AATT	2	8	28669	28676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017479	TAAA	2	8	31821	31828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017479	GAAA	2	8	32291	32298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017479	TAAG	2	8	32329	32336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017479	CTAG	2	8	37168	37175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017479	GTAG	2	8	38394	38401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017479	AGAT	2	8	39358	39365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017479	AGCT	2	8	40225	40232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017479	TAAA	2	8	41679	41686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017479	TACT	2	8	41726	41733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017479	TTCC	2	8	42007	42014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017479	ATCT	2	8	43074	43081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017479	TAAC	2	8	43714	43721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.