MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 379

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017479	TGG	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839614
2	NC_017479	GGC	2	6	1355	1360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839614
3	NC_017479	CTT	2	6	1366	1371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839614
4	NC_017479	GGT	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839614
5	NC_017479	GAA	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839614
6	NC_017479	GTA	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839614
7	NC_017479	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839614
8	NC_017479	GTT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839614
9	NC_017479	AAT	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839614
10	NC_017479	TTA	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
11	NC_017479	TAT	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
12	NC_017479	AAC	2	6	3617	3622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839615
13	NC_017479	ATT	2	6	3745	3750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
14	NC_017479	TGC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839615
15	NC_017479	ATT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
16	NC_017479	ATG	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839615
17	NC_017479	GCA	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839615
18	NC_017479	AAC	2	6	3977	3982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839615
19	NC_017479	ACA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839615
20	NC_017479	TTA	2	6	4237	4242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
21	NC_017479	CTG	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839615
22	NC_017479	TGG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839615
23	NC_017479	TCA	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839615
24	NC_017479	TGG	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839615
25	NC_017479	GAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839615
26	NC_017479	TAA	2	6	4343	4348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839615
27	NC_017479	ATT	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
28	NC_017479	TAA	2	6	4381	4386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839615
29	NC_017479	ATT	2	6	4591	4596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839616
30	NC_017479	AAG	2	6	4678	4683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839616
31	NC_017479	AAG	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839616
32	NC_017479	AAG	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839616
33	NC_017479	ATT	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839616
34	NC_017479	TAT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839616
35	NC_017479	TGA	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839616
36	NC_017479	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839616
37	NC_017479	ACA	2	6	7597	7602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839617
38	NC_017479	ACC	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839617
39	NC_017479	ATT	2	6	7759	7764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839617
40	NC_017479	GTT	2	6	7851	7856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839617
41	NC_017479	GAA	2	6	7893	7898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839617
42	NC_017479	GTC	2	6	8075	8080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839617
43	NC_017479	ACA	2	6	8129	8134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839617
44	NC_017479	AAC	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839617
45	NC_017479	GAA	3	9	8254	8262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839617
46	NC_017479	AAT	2	6	8263	8268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839617
47	NC_017479	ATA	2	6	8340	8345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839617
48	NC_017479	ATG	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839617
49	NC_017479	CAA	2	6	9578	9583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839618
50	NC_017479	TGA	2	6	9590	9595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
51	NC_017479	AGT	2	6	9665	9670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
52	NC_017479	AAC	2	6	9715	9720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839618
53	NC_017479	TGA	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
54	NC_017479	ATA	2	6	10015	10020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839618
55	NC_017479	TGA	2	6	10127	10132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
56	NC_017479	TCT	2	6	10165	10170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839618
57	NC_017479	ACT	2	6	10190	10195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839618
58	NC_017479	CAA	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839618
59	NC_017479	GCG	2	6	10226	10231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839618
60	NC_017479	TAT	2	6	10241	10246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839618
61	NC_017479	TGA	2	6	10330	10335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839618
62	NC_017479	AAG	2	6	10367	10372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839618
63	NC_017479	CGA	2	6	10373	10378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839618
64	NC_017479	TGG	2	6	10440	10445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839618
65	NC_017479	CAA	2	6	10449	10454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839618
66	NC_017479	GAA	2	6	10485	10490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839618
67	NC_017479	ATT	2	6	10570	10575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839618
68	NC_017479	TAT	2	6	11065	11070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839619
69	NC_017479	ACT	2	6	11150	11155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839619
70	NC_017479	CAA	2	6	11194	11199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839619
71	NC_017479	GCA	2	6	11207	11212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839619
72	NC_017479	GCC	2	6	11287	11292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839619
73	NC_017479	GAC	2	6	11353	11358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839619
74	NC_017479	ATA	2	6	11388	11393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839619
75	NC_017479	CAA	2	6	11399	11404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839619
76	NC_017479	ATT	2	6	11529	11534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839619
77	NC_017479	AAG	2	6	11676	11681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839619
78	NC_017479	ACT	2	6	12652	12657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839620
79	NC_017479	CAA	2	6	13252	13257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839620
80	NC_017479	GAT	2	6	13423	13428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839620
81	NC_017479	TTA	2	6	13462	13467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839620
82	NC_017479	CTG	2	6	13504	13509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839620
83	NC_017479	GTT	2	6	13551	13556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839620
84	NC_017479	GTG	2	6	13564	13569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839620
85	NC_017479	ACG	2	6	13629	13634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839620
86	NC_017479	TTA	2	6	13720	13725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839620
87	NC_017479	ATT	2	6	13734	13739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839620
88	NC_017479	CAG	2	6	13783	13788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839620
89	NC_017479	ACA	2	6	13973	13978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839620
90	NC_017479	GAT	2	6	14025	14030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839620
91	NC_017479	CGA	2	6	14094	14099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839620
92	NC_017479	CAG	2	6	14116	14121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839620
93	NC_017479	GTC	2	6	14128	14133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839620
94	NC_017479	ATC	2	6	14204	14209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839620
95	NC_017479	ATG	2	6	14231	14236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839620
96	NC_017479	ACA	2	6	14322	14327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839620
97	NC_017479	ACA	2	6	14329	14334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839620
98	NC_017479	AGC	2	6	14523	14528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839620
99	NC_017479	ACG	2	6	15980	15985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839621
100	NC_017479	TAT	2	6	16095	16100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839621
101	NC_017479	TAG	2	6	16144	16149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839621
102	NC_017479	TTG	2	6	16159	16164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839621
103	NC_017479	CGA	2	6	16187	16192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839621
104	NC_017479	GCC	2	6	16197	16202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839621
105	NC_017479	AAC	2	6	16246	16251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839621
106	NC_017479	TAA	2	6	16277	16282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839621
107	NC_017479	TGG	2	6	16313	16318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839621
108	NC_017479	AAT	2	6	16443	16448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839621
109	NC_017479	CGA	2	6	16454	16459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839621
110	NC_017479	TTA	2	6	16605	16610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839621
111	NC_017479	GTT	2	6	16833	16838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839621
112	NC_017479	GGA	2	6	16847	16852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385839621
113	NC_017479	TCG	2	6	16883	16888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839621
114	NC_017479	CAT	2	6	17106	17111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839622
115	NC_017479	ATA	3	9	17131	17139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839622
116	NC_017479	TTA	2	6	17229	17234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839622
117	NC_017479	ATC	2	6	17264	17269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839622
118	NC_017479	TAA	2	6	17270	17275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839622
119	NC_017479	TTA	2	6	17293	17298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839622
120	NC_017479	TAT	2	6	17314	17319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839622
121	NC_017479	TAG	2	6	17323	17328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839622
122	NC_017479	GAA	2	6	17418	17423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839622
123	NC_017479	TGA	2	6	17573	17578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839622
124	NC_017479	AGG	2	6	17616	17621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385839622
125	NC_017479	TTG	2	6	18455	18460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839623
126	NC_017479	CTG	2	6	18468	18473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839623
127	NC_017479	TGA	2	6	18490	18495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839623
128	NC_017479	AGT	2	6	18526	18531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839623
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376	NC_017479	GGA	2	6	44105	44110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385839641
377	NC_017479	CAA	2	6	44165	44170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839641
378	NC_017479	CAT	2	6	44233	44238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839641
379	NC_017479	CAT	2	6	44371	44376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839641

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.