MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017479	T	6	6	2567	2572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017479	A	6	6	4553	4558	100 %	0 %	0 %	0 %	385839616
3	NC_017479	T	7	7	5982	5988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017479	A	6	6	6737	6742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017479	T	6	6	6982	6987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017479	T	6	6	7101	7106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017479	A	6	6	7148	7153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017479	A	6	6	7486	7491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017479	T	6	6	8290	8295	0 %	100 %	0 %	0 %	385839617
10	NC_017479	A	7	7	8392	8398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017479	A	6	6	8599	8604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017479	A	6	6	8656	8661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017479	A	6	6	9228	9233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017479	A	7	7	9677	9683	100 %	0 %	0 %	0 %	385839618
15	NC_017479	A	8	8	10322	10329	100 %	0 %	0 %	0 %	385839618
16	NC_017479	A	7	7	10603	10609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017479	T	6	6	11279	11284	0 %	100 %	0 %	0 %	385839619
18	NC_017479	A	6	6	11328	11333	100 %	0 %	0 %	0 %	385839619
19	NC_017479	A	7	7	11656	11662	100 %	0 %	0 %	0 %	385839619
20	NC_017479	A	6	6	11751	11756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017479	T	6	6	12007	12012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017479	T	6	6	12236	12241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017479	A	6	6	12701	12706	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
24	NC_017479	A	6	6	13093	13098	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
25	NC_017479	A	6	6	13112	13117	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
26	NC_017479	A	7	7	13150	13156	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
27	NC_017479	A	6	6	13230	13235	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
28	NC_017479	A	6	6	14593	14598	100 %	0 %	0 %	0 %	385839620
29	NC_017479	T	6	6	14968	14973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017479	A	7	7	15252	15258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017479	T	7	7	15451	15457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017479	T	9	9	15524	15532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017479	T	6	6	15559	15564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017479	A	6	6	15683	15688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017479	A	7	7	16046	16052	100 %	0 %	0 %	0 %	385839621
36	NC_017479	A	6	6	16702	16707	100 %	0 %	0 %	0 %	385839621
37	NC_017479	A	6	6	17203	17208	100 %	0 %	0 %	0 %	385839622
38	NC_017479	T	6	6	18175	18180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017479	A	6	6	18345	18350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017479	A	7	7	18825	18831	100 %	0 %	0 %	0 %	385839623
41	NC_017479	T	7	7	18843	18849	0 %	100 %	0 %	0 %	385839623
42	NC_017479	T	7	7	19230	19236	0 %	100 %	0 %	0 %	385839623
43	NC_017479	T	7	7	19276	19282	0 %	100 %	0 %	0 %	385839623
44	NC_017479	T	7	7	19531	19537	0 %	100 %	0 %	0 %	385839624
45	NC_017479	A	6	6	19882	19887	100 %	0 %	0 %	0 %	385839624
46	NC_017479	A	7	7	20055	20061	100 %	0 %	0 %	0 %	385839624
47	NC_017479	A	7	7	20241	20247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017479	A	6	6	20510	20515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017479	T	6	6	20570	20575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017479	T	6	6	20829	20834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017479	T	6	6	20924	20929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017479	T	6	6	21006	21011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017479	A	6	6	21122	21127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017479	A	6	6	27115	27120	100 %	0 %	0 %	0 %	385839628
55	NC_017479	T	6	6	28980	28985	0 %	100 %	0 %	0 %	385839630
56	NC_017479	T	6	6	29563	29568	0 %	100 %	0 %	0 %	385839631
57	NC_017479	A	7	7	29689	29695	100 %	0 %	0 %	0 %	385839631
58	NC_017479	A	7	7	30519	30525	100 %	0 %	0 %	0 %	385839632
59	NC_017479	A	6	6	31107	31112	100 %	0 %	0 %	0 %	385839633
60	NC_017479	A	7	7	35659	35665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017479	A	6	6	37660	37665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017479	G	6	6	38886	38891	0 %	0 %	100 %	0 %	385839638
63	NC_017479	T	6	6	39232	39237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017479	T	6	6	39389	39394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017479	T	6	6	39692	39697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017479	T	7	7	39938	39944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017479	A	6	6	40007	40012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017479	A	6	6	40253	40258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017479	T	6	6	40920	40925	0 %	100 %	0 %	0 %	385839639
70	NC_017479	T	6	6	40942	40947	0 %	100 %	0 %	0 %	385839639
71	NC_017479	A	6	6	42398	42403	100 %	0 %	0 %	0 %	385839640
72	NC_017479	A	7	7	42457	42463	100 %	0 %	0 %	0 %	385839640
73	NC_017479	A	7	7	42725	42731	100 %	0 %	0 %	0 %	385839640
74	NC_017479	T	7	7	43039	43045	0 %	100 %	0 %	0 %	385839640
75	NC_017479	T	6	6	43050	43055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.