MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017477	CAAACC	2	12	25572	25583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017477	CACGAA	2	12	31934	31945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017477	TAAAAT	2	12	34798	34809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017477	ATATTT	2	12	39003	39014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017477	ACTTGC	2	12	39625	39636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017477	ACTAAT	2	12	56936	56947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017477	TAAGAA	2	12	57107	57118	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017477	TATGGT	2	12	57612	57623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017477	AATTAA	2	12	66329	66340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017477	AATTAA	2	12	107195	107206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017477	CTTTTT	2	12	126614	126625	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017477	TCTAAG	2	12	203570	203581	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017477	ATTGCT	2	12	204327	204338	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017477	ATAGCA	2	12	204381	204392	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017477	TATAAA	2	12	233820	233831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017477	GAAAAA	2	12	273054	273065	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017477	TCTAAT	2	12	280268	280279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017477	TTCTTT	2	12	305369	305380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017477	CTTTTT	2	12	306919	306930	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017477	ACTTTC	2	12	397900	397911	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017477	TAGTTT	2	12	412842	412853	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017477	TCTAGT	2	12	413483	413494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017477	TCAAAT	2	12	413726	413737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017477	TAATGG	2	12	414169	414180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017477	AATAAA	2	12	417769	417780	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017477	CCCTTA	2	12	433053	433064	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017477	TGAAGT	2	12	433423	433434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017477	AAAATA	2	12	462882	462893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017477	AGTCAA	2	12	464003	464014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017477	ACAAAA	2	12	468661	468672	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017477	AATTAA	2	12	468739	468750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017477	ATAAAT	2	12	475866	475877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017477	ATATTA	2	12	476402	476413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017477	TTATGA	2	12	522155	522166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017477	TCATAA	2	12	532128	532139	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017477	CGGAGC	2	12	549426	549437	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017477	AGCGAA	2	12	550648	550659	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017477	TTTAAC	2	12	565916	565927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017477	GGAACT	2	12	569304	569315	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017477	TTCTAA	2	12	572100	572111	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017477	TTTTTA	2	12	582847	582858	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017477	TAAAAA	2	12	596588	596599	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017477	ATTTAA	2	12	622523	622534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017477	TATTTT	2	12	625907	625918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017477	ACTAAT	2	12	666111	666122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017477	ATTTTA	2	12	704901	704912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017477	ATGCAC	2	12	777561	777572	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017477	TAATTT	2	12	782405	782416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017477	ATTAAG	2	12	843114	843125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017477	ATGAAA	2	12	846663	846674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017477	AATGCA	2	12	880042	880053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017477	TTTTAT	2	12	906893	906904	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017477	ATTTAT	2	12	920942	920953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017477	TTATAT	2	12	1009013	1009024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017477	AAATTA	2	12	1011711	1011722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017477	AATTGG	2	12	1044432	1044443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017477	ATTTTA	2	12	1054744	1054755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017477	AATCAA	2	12	1070284	1070295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017477	TAAATA	2	12	1090739	1090750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017477	TTCTAA	2	12	1093751	1093762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017477	AATTTT	2	12	1109432	1109443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017477	AATAAA	2	12	1127305	1127316	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017477	TCTAAT	2	12	1150196	1150207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017477	TCAAAT	2	12	1198973	1198984	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017477	AAAACC	2	12	1200551	1200562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017477	TTAAAA	2	12	1207848	1207859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017477	ATATTA	2	12	1245514	1245525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017477	TAAAAA	2	12	1263099	1263110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017477	ATAATT	2	12	1284323	1284334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017477	CATATT	2	12	1300952	1300963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017477	ATTTCA	2	12	1314710	1314721	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017477	TAAAAA	2	12	1319114	1319125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017477	TATTTT	2	12	1340220	1340231	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017477	TTAAAT	2	12	1409792	1409803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017477	GCTTTA	2	12	1437562	1437573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017477	AAATGT	2	12	1439907	1439918	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017477	TTATTT	2	12	1442531	1442542	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017477	GCTTAT	2	12	1447936	1447947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017477	TACCTA	2	12	1467189	1467200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017477	ATTCTT	2	12	1560155	1560166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017477	CTTCAT	2	12	1570698	1570709	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017477	TGAGAT	2	12	1576676	1576687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017477	AAGCAC	2	12	1577198	1577209	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017477	TAATTT	2	12	1611790	1611801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017477	TTTTTG	2	12	1643558	1643569	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017477	GCTCCG	2	12	1652852	1652863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017477	TAATTT	2	12	1662444	1662455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017477	ATGATA	2	12	1664467	1664478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017477	TTCGCT	2	12	1666100	1666111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017477	GCTCCG	2	12	1667322	1667333	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017477	ATATAA	2	12	1696225	1696236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017477	AAATTA	2	12	1735164	1735175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017477	ACTTTA	2	12	1756692	1756703	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017477	CAAGAG	2	12	1770063	1770074	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017477	ACCGCT	2	12	1773490	1773501	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017477	ATTTTA	2	12	1814092	1814103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017477	ATTCAT	2	12	1816733	1816744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017477	AAAAGA	2	12	1833327	1833338	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017477	ACCGCT	2	12	1835822	1835833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017477	TACCTT	2	12	1843810	1843821	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017477	TTCGCT	2	12	1869036	1869047	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017477	GCTCCG	2	12	1870258	1870269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017477	AATTAA	2	12	1874703	1874714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017477	GAAATA	2	12	1906725	1906736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017477	TAAGGT	2	12	1934571	1934582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017477	AAACTT	2	12	1966172	1966183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.