MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017477	TTGAAT	2	12	2324	2335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385824949
2	NC_017477	AGACTA	2	12	5298	5309	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385824952
3	NC_017477	TAACTC	2	12	7741	7752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824953
4	NC_017477	ATTTTA	2	12	9728	9739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824955
5	NC_017477	AGGCGG	2	12	13018	13029	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385824958
6	NC_017477	GGTAAA	2	12	13174	13185	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385824959
7	NC_017477	TAATTG	2	12	14548	14559	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385824960
8	NC_017477	AGAAGC	2	12	14837	14848	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385824960
9	NC_017477	GAAGTA	2	12	14859	14870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385824960
10	NC_017477	TAAAAT	2	12	22423	22434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824965
11	NC_017477	GCTTAA	2	12	29220	29231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385824972
12	NC_017477	CTTAAG	2	12	32453	32464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385824975
13	NC_017477	TCACCG	2	12	35466	35477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385824978
14	NC_017477	GATATG	2	12	41326	41337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824982
15	NC_017477	TTAGTT	2	12	41474	41485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385824982
16	NC_017477	GTTGAA	2	12	44462	44473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824983
17	NC_017477	CTAAAA	2	12	45355	45366	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385824984
18	NC_017477	AAAAGA	2	12	50884	50895	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385824990
19	NC_017477	ACTATG	2	12	50985	50996	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385824990
20	NC_017477	TCAAAT	2	12	52188	52199	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385824991
21	NC_017477	AAACTA	2	12	54621	54632	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385824992
22	NC_017477	TGATTA	2	12	59378	59389	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385824994
23	NC_017477	CTGAAT	2	12	61860	61871	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385824995
24	NC_017477	TAATAG	2	12	61917	61928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385824995
25	NC_017477	AATTTG	2	12	67943	67954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385824999
26	NC_017477	TTACAA	2	12	70857	70868	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385825002
27	NC_017477	TTGATG	2	12	72409	72420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385825003
28	NC_017477	AAAGAG	2	12	74337	74348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385825003
29	NC_017477	AGCTGC	2	12	77642	77653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385825006
30	NC_017477	TTGGTT	2	12	81016	81027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385825008
31	NC_017477	TTTAGA	2	12	82832	82843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385825010
32	NC_017477	TCACTA	2	12	83688	83699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385825011
33	NC_017477	ACCAAT	2	12	85226	85237	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385825012
34	NC_017477	TTTAAT	2	12	85582	85593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385825013
35	NC_017477	CCTTAG	2	12	87448	87459	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385825014
36	NC_017477	TGAATT	2	12	92545	92556	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385825019
37	NC_017477	TAAAAA	2	12	94863	94874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385825021
38	NC_017477	CTCAAA	2	12	95219	95230	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385825021
39	NC_017477	ATTCCA	2	12	95710	95721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385825021
40	NC_017477	TAAAAA	2	12	96295	96306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385825022
41	NC_017477	TGGATC	2	12	103751	103762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385825030
42	NC_017477	TAAAAT	2	12	105058	105069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385825031
43	NC_017477	ATTAAA	2	12	106692	106703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385825033
44	NC_017477	TATCTT	2	12	106792	106803	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385825033
45	NC_017477	ATTTTA	2	12	107479	107490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385825034
46	NC_017477	TACGAT	2	12	108438	108449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385825035
47	NC_017477	AAAGTG	2	12	109748	109759	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385825036
48	NC_017477	AAATCC	2	12	111306	111317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385825037
49	NC_017477	TGTTCA	2	12	113778	113789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385825040
50	NC_017477	CTGAAA	2	12	113992	114003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385825041
51	NC_017477	TATCAA	2	12	115890	115901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385825042
52	NC_017477	TAAAAA	2	12	116725	116736	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385825043
53	NC_017477	CCAATT	2	12	117323	117334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385825044
54	NC_017477	TTAAAG	2	12	120718	120729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385825048
55	NC_017477	TTAGTA	2	12	124885	124896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385825052
56	NC_017477	TTTAGC	2	12	129723	129734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385825057
57	NC_017477	AGTGAT	2	12	130269	130280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385825058
58	NC_017477	GTAATT	2	12	132499	132510	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385825060
59	NC_017477	AAAGTA	2	12	142268	142279	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385825068
60	NC_017477	CTTTGC	2	12	146678	146689	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385825070
61	NC_017477	GGTGTT	2	12	150411	150422	0 %	50 %	50 %	0 %	385825074
62	NC_017477	AGAAAA	2	12	152217	152228	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385825076
63	NC_017477	TTGAAA	2	12	153371	153382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385825078
64	NC_017477	ATCACT	2	12	166768	166779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385825090
65	NC_017477	TTGGTC	2	12	167836	167847	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385825091
66	NC_017477	TCATTA	2	12	169113	169124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385825093
67	NC_017477	ATACTT	2	12	169785	169796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385825093
68	NC_017477	AGTGCA	2	12	172814	172825	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385825096
69	NC_017477	AATCTA	2	12	174696	174707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385825096
70	NC_017477	GCAGAA	2	12	174752	174763	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385825096
71	NC_017477	GATACT	2	12	175037	175048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385825096
72	NC_017477	ATTTCA	2	12	175969	175980	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385825097
73	NC_017477	TTAAGG	2	12	176609	176620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385825098
74	NC_017477	AGCTGG	2	12	177114	177125	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385825098
75	NC_017477	AGATGT	2	12	177509	177520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385825099
76	NC_017477	CAAGTT	2	12	182697	182708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385825101
77	NC_017477	TAAGGA	2	12	184095	184106	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385825102
78	NC_017477	AAGATG	2	12	184343	184354	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385825102
79	NC_017477	CAAAAG	2	12	186694	186705	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385825103
80	NC_017477	TTACAA	2	12	187513	187524	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385825104
81	NC_017477	AAAATA	2	12	188839	188850	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385825104
82	NC_017477	GTTAGA	2	12	190297	190308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385825106
83	NC_017477	CTAATA	2	12	192723	192734	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385825108
84	NC_017477	AAAAGA	2	12	197984	197995	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385825111
85	NC_017477	TACAAT	2	12	198569	198580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385825111
86	NC_017477	CAATTA	2	12	206598	206609	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385825121
87	NC_017477	TTTAAA	2	12	207167	207178	50 %	50 %	0 %	0 %	385825121
88	NC_017477	TTTAAT	2	12	208327	208338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385825122
89	NC_017477	GTTTAA	2	12	214937	214948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385825127
90	NC_017477	TTCTTT	2	12	223544	223555	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385825135
91	NC_017477	TATTTT	2	12	227060	227071	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385825139
92	NC_017477	ATTTTA	2	12	229466	229477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385825141
93	NC_017477	GAATTG	2	12	229604	229615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385825141
94	NC_017477	GGAATA	2	12	232227	232238	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385825145
95	NC_017477	CATATT	2	12	233569	233580	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385825146
96	NC_017477	TAATTG	2	12	235051	235062	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385825148
97	NC_017477	AGATAA	2	12	237300	237311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385825150
98	NC_017477	TGGAGT	2	12	239640	239651	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385825153
99	NC_017477	TCTTCC	2	12	240946	240957	0 %	50 %	0 %	50 %	385825154
100	NC_017477	TAAAGA	2	12	244127	244138	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385825157
101	NC_017477	CAATTG	2	12	247637	247648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385825161
102	NC_017477	ATTGAA	2	12	250778	250789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385825163
103	NC_017477	ATTTGA	2	12	253192	253203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385825165
104	NC_017477	AGAAAA	2	12	255249	255260	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385825166
105	NC_017477	CGCTTC	2	12	259862	259873	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385825170
106	NC_017477	AAATTA	2	12	263636	263647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385825173
107	NC_017477	CACCGT	2	12	266144	266155	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385825175
108	NC_017477	GCATCC	2	12	268105	268116	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385825177
109	NC_017477	TTTTCG	2	12	269613	269624	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385825178
110	NC_017477	GATTAA	2	12	270618	270629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385825179
111	NC_017477	CAGGTC	2	12	272123	272134	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385825180
112	NC_017477	TAAAAG	2	12	273264	273275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385825182
113	NC_017477	TGAAGT	2	12	276144	276155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385825185
114	NC_017477	TGCTAA	2	12	284333	284344	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385825193
115	NC_017477	TCTTTC	2	12	284474	284485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385825193
116	NC_017477	TATTGT	2	12	284996	285007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385825193
117	NC_017477	TCCAGA	2	12	286360	286371	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385825196
118	NC_017477	AAATTT	2	12	286407	286418	50 %	50 %	0 %	0 %	385825196
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