MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 1541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017477	TTGAA	2	10	3123	3132	40 %	40 %	20 %	0 %	385824951
2	NC_017477	TTGCA	2	10	5055	5064	20 %	40 %	20 %	20 %	385824952
3	NC_017477	AAGGT	2	10	5907	5916	40 %	20 %	40 %	0 %	385824952
4	NC_017477	CAGAC	2	10	7105	7114	40 %	0 %	20 %	40 %	385824953
5	NC_017477	TTTGA	2	10	10191	10200	20 %	60 %	20 %	0 %	385824957
6	NC_017477	CTAAT	2	10	10630	10639	40 %	40 %	0 %	20 %	385824957
7	NC_017477	AGTGA	2	10	10758	10767	40 %	20 %	40 %	0 %	385824957
8	NC_017477	TATAA	2	10	11047	11056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017477	AAAAT	2	10	11553	11562	80 %	20 %	0 %	0 %	385824958
10	NC_017477	CTATA	2	10	15006	15015	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017477	ACTGG	2	10	16878	16887	20 %	20 %	40 %	20 %	385824962
12	NC_017477	TTTTA	2	10	17196	17205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017477	TTTAA	2	10	17506	17515	40 %	60 %	0 %	0 %	385824963
14	NC_017477	TTAGT	2	10	17954	17963	20 %	60 %	20 %	0 %	385824963
15	NC_017477	ACGTA	2	10	19270	19279	40 %	20 %	20 %	20 %	385824963
16	NC_017477	AAAAT	2	10	19413	19422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017477	TAACT	2	10	19428	19437	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017477	TAAAT	2	10	21916	21925	60 %	40 %	0 %	0 %	385824965
19	NC_017477	TATTT	2	10	23621	23630	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017477	GCTAA	2	10	23677	23686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017477	TAATA	2	10	25423	25432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017477	AGAAA	2	10	25490	25499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017477	CTTTG	2	10	26255	26264	0 %	60 %	20 %	20 %	385824969
24	NC_017477	ATCAG	2	10	29241	29250	40 %	20 %	20 %	20 %	385824972
25	NC_017477	AAATC	2	10	29640	29649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017477	TCTGA	2	10	32434	32443	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017477	CTCTT	2	10	33866	33875	0 %	60 %	0 %	40 %	385824976
28	NC_017477	TCCAG	2	10	34598	34607	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017477	AGCCC	2	10	34670	34679	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017477	TTGAT	2	10	35291	35300	20 %	60 %	20 %	0 %	385824978
31	NC_017477	AGAAA	2	10	37101	37110	80 %	0 %	20 %	0 %	385824980
32	NC_017477	CTTTG	2	10	39367	39376	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017477	CTTTT	2	10	39643	39652	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017477	ACTTT	2	10	41529	41538	20 %	60 %	0 %	20 %	385824982
35	NC_017477	CTTTG	2	10	43830	43839	0 %	60 %	20 %	20 %	385824983
36	NC_017477	TTGGT	2	10	47224	47233	0 %	60 %	40 %	0 %	385824985
37	NC_017477	AGGAA	2	10	50164	50173	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017477	AAAGG	2	10	50296	50305	60 %	0 %	40 %	0 %	385824988
39	NC_017477	AAACT	2	10	50919	50928	60 %	20 %	0 %	20 %	385824990
40	NC_017477	GAGAA	2	10	54805	54814	60 %	0 %	40 %	0 %	385824992
41	NC_017477	GCACT	2	10	57085	57094	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017477	TATTT	2	10	57228	57237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017477	ATATT	2	10	57304	57313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017477	CAAAA	2	10	58118	58127	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017477	CATTA	2	10	58915	58924	40 %	40 %	0 %	20 %	385824994
46	NC_017477	TACAA	2	10	59718	59727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017477	TTTAG	2	10	60032	60041	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017477	TTACA	2	10	66845	66854	40 %	40 %	0 %	20 %	385824998
49	NC_017477	TGAAT	2	10	68001	68010	40 %	40 %	20 %	0 %	385824999
50	NC_017477	GTGAA	2	10	70936	70945	40 %	20 %	40 %	0 %	385825002
51	NC_017477	AGTAC	2	10	71905	71914	40 %	20 %	20 %	20 %	385825003
52	NC_017477	TTCCT	2	10	72245	72254	0 %	60 %	0 %	40 %	385825003
53	NC_017477	GAAAT	2	10	73522	73531	60 %	20 %	20 %	0 %	385825003
54	NC_017477	ATGGG	2	10	76940	76949	20 %	20 %	60 %	0 %	385825005
55	NC_017477	GAAAT	2	10	77980	77989	60 %	20 %	20 %	0 %	385825006
56	NC_017477	ATGCA	2	10	80968	80977	40 %	20 %	20 %	20 %	385825008
57	NC_017477	AAATT	2	10	81306	81315	60 %	40 %	0 %	0 %	385825008
58	NC_017477	ATAAA	2	10	81366	81375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017477	GTTTT	2	10	82400	82409	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017477	CCTTG	2	10	83320	83329	0 %	40 %	20 %	40 %	385825011
61	NC_017477	ATAGC	2	10	84453	84462	40 %	20 %	20 %	20 %	385825012
62	NC_017477	CATTT	2	10	84759	84768	20 %	60 %	0 %	20 %	385825012
63	NC_017477	CAGCC	2	10	85833	85842	20 %	0 %	20 %	60 %	385825013
64	NC_017477	CTTTT	2	10	87267	87276	0 %	80 %	0 %	20 %	385825014
65	NC_017477	TGTAT	2	10	88618	88627	20 %	60 %	20 %	0 %	385825015
66	NC_017477	TTTTC	2	10	88757	88766	0 %	80 %	0 %	20 %	385825015
67	NC_017477	ATCTT	2	10	89324	89333	20 %	60 %	0 %	20 %	385825016
68	NC_017477	GTCTT	2	10	91506	91515	0 %	60 %	20 %	20 %	385825018
69	NC_017477	TAAAT	2	10	91800	91809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017477	AGTAA	2	10	91966	91975	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017477	CTTGA	2	10	92216	92225	20 %	40 %	20 %	20 %	385825019
72	NC_017477	TGACT	2	10	92422	92431	20 %	40 %	20 %	20 %	385825019
73	NC_017477	TTCAA	2	10	92960	92969	40 %	40 %	0 %	20 %	385825020
74	NC_017477	CAGAT	2	10	95030	95039	40 %	20 %	20 %	20 %	385825021
75	NC_017477	TAAAT	2	10	95502	95511	60 %	40 %	0 %	0 %	385825021
76	NC_017477	GTGAT	2	10	98755	98764	20 %	40 %	40 %	0 %	385825024
77	NC_017477	ATAAA	2	10	99374	99383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017477	AGATA	2	10	99605	99614	60 %	20 %	20 %	0 %	385825025
79	NC_017477	CCATA	2	10	99879	99888	40 %	20 %	0 %	40 %	385825025
80	NC_017477	GATTC	2	10	100134	100143	20 %	40 %	20 %	20 %	385825026
81	NC_017477	AAGAA	2	10	100245	100254	80 %	0 %	20 %	0 %	385825026
82	NC_017477	TTGCA	2	10	101459	101468	20 %	40 %	20 %	20 %	385825027
83	NC_017477	AAATT	2	10	102158	102167	60 %	40 %	0 %	0 %	385825028
84	NC_017477	AGATG	2	10	106868	106877	40 %	20 %	40 %	0 %	385825033
85	NC_017477	CAAAA	2	10	108827	108836	80 %	0 %	0 %	20 %	385825035
86	NC_017477	TAATG	2	10	110166	110175	40 %	40 %	20 %	0 %	385825036
87	NC_017477	AGAGT	2	10	110777	110786	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017477	AAAAG	2	10	112892	112901	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017477	TACGG	2	10	114233	114242	20 %	20 %	40 %	20 %	385825041
90	NC_017477	TTAAG	2	10	114244	114253	40 %	40 %	20 %	0 %	385825041
91	NC_017477	CAATA	2	10	115423	115432	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017477	TTCTT	2	10	116706	116715	0 %	80 %	0 %	20 %	385825043
93	NC_017477	TTAAG	2	10	116780	116789	40 %	40 %	20 %	0 %	385825043
94	NC_017477	AATAC	2	10	116855	116864	60 %	20 %	0 %	20 %	385825044
95	NC_017477	GTAAA	2	10	117265	117274	60 %	20 %	20 %	0 %	385825044
96	NC_017477	GTGAT	2	10	119442	119451	20 %	40 %	40 %	0 %	385825047
97	NC_017477	TTTTA	2	10	119573	119582	20 %	80 %	0 %	0 %	385825048
98	NC_017477	AGCGA	2	10	119796	119805	40 %	0 %	40 %	20 %	385825048
99	NC_017477	ATAAA	2	10	120887	120896	80 %	20 %	0 %	0 %	385825048
100	NC_017477	CTTTT	2	10	122561	122570	0 %	80 %	0 %	20 %	385825050
101	NC_017477	TTGAT	2	10	124258	124267	20 %	60 %	20 %	0 %	385825052
102	NC_017477	AGATC	2	10	124738	124747	40 %	20 %	20 %	20 %	385825052
103	NC_017477	CTATA	2	10	126065	126074	40 %	40 %	0 %	20 %	385825054
104	NC_017477	ATGAT	2	10	127779	127788	40 %	40 %	20 %	0 %	385825056
105	NC_017477	AGACA	2	10	127801	127810	60 %	0 %	20 %	20 %	385825056
106	NC_017477	TTATC	2	10	128555	128564	20 %	60 %	0 %	20 %	385825057
107	NC_017477	GAATA	2	10	129909	129918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017477	TCGAT	2	10	134356	134365	20 %	40 %	20 %	20 %	385825061
109	NC_017477	CTCTA	2	10	137267	137276	20 %	40 %	0 %	40 %	385825064
110	NC_017477	TAAAT	2	10	138175	138184	60 %	40 %	0 %	0 %	385825064
111	NC_017477	AAAGA	2	10	140929	140938	80 %	0 %	20 %	0 %	385825067
112	NC_017477	AGTAA	2	10	142561	142570	60 %	20 %	20 %	0 %	385825068
113	NC_017477	GCATG	2	10	142582	142591	20 %	20 %	40 %	20 %	385825068
114	NC_017477	GTTTA	2	10	142675	142684	20 %	60 %	20 %	0 %	385825068
115	NC_017477	TTAAA	2	10	144811	144820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017477	GAAAA	2	10	144994	145003	80 %	0 %	20 %	0 %	385825069
117	NC_017477	CGATT	2	10	145082	145091	20 %	40 %	20 %	20 %	385825069
118	NC_017477	AAAGA	2	10	145797	145806	80 %	0 %	20 %	0 %	385825070
119	NC_017477	AAGTT	2	10	153209	153218	40 %	40 %	20 %	0 %	385825078
120	NC_017477	ATTTT	2	10	155036	155045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017477	TGATA	2	10	155771	155780	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017477	TAAAT	2	10	157069	157078	60 %	40 %	0 %	0 %	385825083
123	NC_017477	TACTT	2	10	157223	157232	20 %	60 %	0 %	20 %	385825083
124	NC_017477	AATTT	2	10	161545	161554	40 %	60 %	0 %	0 %	385825087
125	NC_017477	AAGAA	2	10	161857	161866	80 %	0 %	20 %	0 %	385825088
126	NC_017477	TTGAA	2	10	164069	164078	40 %	40 %	20 %	0 %	385825089
127	NC_017477	ATAGA	2	10	165091	165100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017477	TCAAG	2	10	166005	166014	40 %	20 %	20 %	20 %	385825090
129	NC_017477	ACTTA	2	10	166169	166178	40 %	40 %	0 %	20 %	385825090
130	NC_017477	AAGAA	2	10	168114	168123	80 %	0 %	20 %	0 %	385825092
131	NC_017477	TAAAG	2	10	168652	168661	60 %	20 %	20 %	0 %	385825092
132	NC_017477	TATAA	2	10	171297	171306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017477	TTACT	2	10	171717	171726	20 %	60 %	0 %	20 %	385825095
134	NC_017477	AATAA	2	10	172428	172437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017477	AGCAA	2	10	172828	172837	60 %	0 %	20 %	20 %	385825096
136	NC_017477	CAAAA	2	10	173088	173097	80 %	0 %	0 %	20 %	385825096
137	NC_017477	ATTAC	2	10	176561	176570	40 %	40 %	0 %	20 %	385825098
138	NC_017477	CTTAA	2	10	179724	179733	40 %	40 %	0 %	20 %	385825100
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