MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 5926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017477	AGTA	2	8	358	365	50 %	25 %	25 %	0 %	385824948
2	NC_017477	ATGC	2	8	1273	1280	25 %	25 %	25 %	25 %	385824948
3	NC_017477	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017477	GATC	2	8	1751	1758	25 %	25 %	25 %	25 %	385824949
5	NC_017477	AAAG	2	8	1828	1835	75 %	0 %	25 %	0 %	385824949
6	NC_017477	GAAA	2	8	3036	3043	75 %	0 %	25 %	0 %	385824950
7	NC_017477	ATTT	2	8	3088	3095	25 %	75 %	0 %	0 %	385824950
8	NC_017477	ATTT	2	8	3233	3240	25 %	75 %	0 %	0 %	385824951
9	NC_017477	AATT	2	8	3282	3289	50 %	50 %	0 %	0 %	385824951
10	NC_017477	AATG	2	8	3436	3443	50 %	25 %	25 %	0 %	385824951
11	NC_017477	AATT	2	8	3529	3536	50 %	50 %	0 %	0 %	385824951
12	NC_017477	TAAA	2	8	4260	4267	75 %	25 %	0 %	0 %	385824952
13	NC_017477	ACGA	2	8	4428	4435	50 %	0 %	25 %	25 %	385824952
14	NC_017477	GAAA	2	8	4695	4702	75 %	0 %	25 %	0 %	385824952
15	NC_017477	TCGT	2	8	4785	4792	0 %	50 %	25 %	25 %	385824952
16	NC_017477	AAAG	2	8	4916	4923	75 %	0 %	25 %	0 %	385824952
17	NC_017477	TCGA	2	8	5340	5347	25 %	25 %	25 %	25 %	385824952
18	NC_017477	TTAT	2	8	5552	5559	25 %	75 %	0 %	0 %	385824952
19	NC_017477	GCAA	2	8	5614	5621	50 %	0 %	25 %	25 %	385824952
20	NC_017477	ATCT	2	8	6474	6481	25 %	50 %	0 %	25 %	385824953
21	NC_017477	ATTG	2	8	6648	6655	25 %	50 %	25 %	0 %	385824953
22	NC_017477	ACTT	2	8	6715	6722	25 %	50 %	0 %	25 %	385824953
23	NC_017477	CTTA	2	8	7012	7019	25 %	50 %	0 %	25 %	385824953
24	NC_017477	GCAA	2	8	7196	7203	50 %	0 %	25 %	25 %	385824953
25	NC_017477	GAAT	2	8	7210	7217	50 %	25 %	25 %	0 %	385824953
26	NC_017477	AATT	2	8	7444	7451	50 %	50 %	0 %	0 %	385824953
27	NC_017477	GCAA	2	8	7559	7566	50 %	0 %	25 %	25 %	385824953
28	NC_017477	AAAG	2	8	7922	7929	75 %	0 %	25 %	0 %	385824953
29	NC_017477	GTTC	2	8	8250	8257	0 %	50 %	25 %	25 %	385824953
30	NC_017477	TTAC	2	8	8908	8915	25 %	50 %	0 %	25 %	385824954
31	NC_017477	AAAG	2	8	8945	8952	75 %	0 %	25 %	0 %	385824954
32	NC_017477	GATC	2	8	8957	8964	25 %	25 %	25 %	25 %	385824954
33	NC_017477	TTTA	2	8	10606	10613	25 %	75 %	0 %	0 %	385824957
34	NC_017477	TGCT	2	8	11007	11014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017477	AAGC	2	8	11028	11035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017477	AGGA	2	8	11100	11107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017477	ATTA	2	8	11227	11234	50 %	50 %	0 %	0 %	385824958
38	NC_017477	TATT	2	8	12351	12358	25 %	75 %	0 %	0 %	385824958
39	NC_017477	ATTA	2	8	12472	12479	50 %	50 %	0 %	0 %	385824958
40	NC_017477	GAAA	2	8	12760	12767	75 %	0 %	25 %	0 %	385824958
41	NC_017477	TTAC	2	8	13903	13910	25 %	50 %	0 %	25 %	385824960
42	NC_017477	AATT	2	8	14209	14216	50 %	50 %	0 %	0 %	385824960
43	NC_017477	CTGA	2	8	14400	14407	25 %	25 %	25 %	25 %	385824960
44	NC_017477	TGAG	2	8	14491	14498	25 %	25 %	50 %	0 %	385824960
45	NC_017477	CCTT	2	8	14776	14783	0 %	50 %	0 %	50 %	385824960
46	NC_017477	ATTA	2	8	14997	15004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017477	AAAT	2	8	15080	15087	75 %	25 %	0 %	0 %	385824961
48	NC_017477	TGGT	2	8	15326	15333	0 %	50 %	50 %	0 %	385824961
49	NC_017477	AAAT	2	8	15605	15612	75 %	25 %	0 %	0 %	385824961
50	NC_017477	GAAG	2	8	15645	15652	50 %	0 %	50 %	0 %	385824961
51	NC_017477	AAAG	2	8	16282	16289	75 %	0 %	25 %	0 %	385824962
52	NC_017477	AAAT	2	8	16338	16345	75 %	25 %	0 %	0 %	385824962
53	NC_017477	TTTC	2	8	16572	16579	0 %	75 %	0 %	25 %	385824962
54	NC_017477	TGAA	2	8	16978	16985	50 %	25 %	25 %	0 %	385824962
55	NC_017477	TAGC	2	8	17471	17478	25 %	25 %	25 %	25 %	385824963
56	NC_017477	TGAT	2	8	17832	17839	25 %	50 %	25 %	0 %	385824963
57	NC_017477	TCAA	2	8	18661	18668	50 %	25 %	0 %	25 %	385824963
58	NC_017477	CCAA	2	8	19121	19128	50 %	0 %	0 %	50 %	385824963
59	NC_017477	ATTT	2	8	19647	19654	25 %	75 %	0 %	0 %	385824964
60	NC_017477	TAGG	2	8	19706	19713	25 %	25 %	50 %	0 %	385824964
61	NC_017477	ATAA	2	8	19780	19787	75 %	25 %	0 %	0 %	385824964
62	NC_017477	ACCT	2	8	20535	20542	25 %	25 %	0 %	50 %	385824964
63	NC_017477	CATC	2	8	20697	20704	25 %	25 %	0 %	50 %	385824964
64	NC_017477	TAAT	2	8	21246	21253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017477	TAAA	2	8	21528	21535	75 %	25 %	0 %	0 %	385824965
66	NC_017477	ATTT	2	8	22114	22121	25 %	75 %	0 %	0 %	385824965
67	NC_017477	AGGA	2	8	22329	22336	50 %	0 %	50 %	0 %	385824965
68	NC_017477	TTAA	2	8	22409	22416	50 %	50 %	0 %	0 %	385824965
69	NC_017477	AGAT	2	8	22689	22696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017477	CTTG	2	8	22933	22940	0 %	50 %	25 %	25 %	385824966
71	NC_017477	CATT	2	8	22981	22988	25 %	50 %	0 %	25 %	385824966
72	NC_017477	TTTA	2	8	23099	23106	25 %	75 %	0 %	0 %	385824966
73	NC_017477	ATTG	2	8	23281	23288	25 %	50 %	25 %	0 %	385824966
74	NC_017477	TTCA	2	8	23668	23675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017477	AGTT	2	8	23841	23848	25 %	50 %	25 %	0 %	385824967
76	NC_017477	CAAT	2	8	24734	24741	50 %	25 %	0 %	25 %	385824968
77	NC_017477	TTAA	2	8	24807	24814	50 %	50 %	0 %	0 %	385824968
78	NC_017477	TATT	2	8	25031	25038	25 %	75 %	0 %	0 %	385824968
79	NC_017477	GAAT	2	8	25112	25119	50 %	25 %	25 %	0 %	385824968
80	NC_017477	TTAT	2	8	25214	25221	25 %	75 %	0 %	0 %	385824968
81	NC_017477	TTAA	2	8	25266	25273	50 %	50 %	0 %	0 %	385824968
82	NC_017477	AAAG	2	8	25841	25848	75 %	0 %	25 %	0 %	385824969
83	NC_017477	TGAT	2	8	25896	25903	25 %	50 %	25 %	0 %	385824969
84	NC_017477	AATA	2	8	26724	26731	75 %	25 %	0 %	0 %	385824970
85	NC_017477	GATG	2	8	28676	28683	25 %	25 %	50 %	0 %	385824972
86	NC_017477	TTGG	2	8	28872	28879	0 %	50 %	50 %	0 %	385824972
87	NC_017477	TATC	2	8	29982	29989	25 %	50 %	0 %	25 %	385824973
88	NC_017477	AGAT	2	8	31167	31174	50 %	25 %	25 %	0 %	385824974
89	NC_017477	TGTT	2	8	31260	31267	0 %	75 %	25 %	0 %	385824974
90	NC_017477	TAAA	2	8	31566	31573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017477	TTTG	2	8	31590	31597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017477	TATT	2	8	31659	31666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017477	TCAC	2	8	32030	32037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017477	TTCT	2	8	32038	32045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017477	CAAT	2	8	32258	32265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017477	AGTT	2	8	32485	32492	25 %	50 %	25 %	0 %	385824975
97	NC_017477	TTGT	2	8	32668	32675	0 %	75 %	25 %	0 %	385824975
98	NC_017477	CCAA	2	8	32806	32813	50 %	0 %	0 %	50 %	385824975
99	NC_017477	CATC	2	8	33002	33009	25 %	25 %	0 %	50 %	385824975
100	NC_017477	AAAG	2	8	33958	33965	75 %	0 %	25 %	0 %	385824976
101	NC_017477	AGTA	2	8	34582	34589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017477	AATT	2	8	34877	34884	50 %	50 %	0 %	0 %	385824978
103	NC_017477	TGCA	2	8	34937	34944	25 %	25 %	25 %	25 %	385824978
104	NC_017477	ATGA	2	8	35125	35132	50 %	25 %	25 %	0 %	385824978
105	NC_017477	GGAT	2	8	35403	35410	25 %	25 %	50 %	0 %	385824978
106	NC_017477	ACCA	2	8	35619	35626	50 %	0 %	0 %	50 %	385824979
107	NC_017477	TTTC	2	8	35714	35721	0 %	75 %	0 %	25 %	385824979
108	NC_017477	AGTT	2	8	35948	35955	25 %	50 %	25 %	0 %	385824979
109	NC_017477	TTTC	2	8	36477	36484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017477	TAAT	2	8	36718	36725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017477	ATAA	2	8	36861	36868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017477	TTAA	2	8	37525	37532	50 %	50 %	0 %	0 %	385824980
113	NC_017477	AATT	2	8	37574	37581	50 %	50 %	0 %	0 %	385824980
114	NC_017477	TACC	2	8	37851	37858	25 %	25 %	0 %	50 %	385824980
115	NC_017477	CAGA	2	8	38020	38027	50 %	0 %	25 %	25 %	385824980
116	NC_017477	ACTC	2	8	38214	38221	25 %	25 %	0 %	50 %	385824980
117	NC_017477	TTTA	2	8	38483	38490	25 %	75 %	0 %	0 %	385824980
118	NC_017477	GGTT	2	8	39253	39260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017477	CAAT	2	8	39682	39689	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017477	ATGG	2	8	40664	40671	25 %	25 %	50 %	0 %	385824981
121	NC_017477	TTTG	2	8	41514	41521	0 %	75 %	25 %	0 %	385824982
122	NC_017477	TTCG	2	8	41703	41710	0 %	50 %	25 %	25 %	385824982
123	NC_017477	AATG	2	8	41757	41764	50 %	25 %	25 %	0 %	385824982
124	NC_017477	TGAA	2	8	41954	41961	50 %	25 %	25 %	0 %	385824982
125	NC_017477	CTTT	2	8	42203	42210	0 %	75 %	0 %	25 %	385824982
126	NC_017477	TTGC	2	8	42269	42276	0 %	50 %	25 %	25 %	385824982
127	NC_017477	GCAT	2	8	42279	42286	25 %	25 %	25 %	25 %	385824982
128	NC_017477	AATT	2	8	42809	42816	50 %	50 %	0 %	0 %	385824982
129	NC_017477	TGGT	2	8	42989	42996	0 %	50 %	50 %	0 %	385824982
130	NC_017477	GGTT	2	8	43716	43723	0 %	50 %	50 %	0 %	385824983
131	NC_017477	AAAG	2	8	43931	43938	75 %	0 %	25 %	0 %	385824983
132	NC_017477	TTCT	2	8	44616	44623	0 %	75 %	0 %	25 %	385824983
133	NC_017477	GTAA	2	8	45064	45071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017477	TTGC	2	8	45092	45099	0 %	50 %	25 %	25 %	385824984
135	NC_017477	TAAT	2	8	45490	45497	50 %	50 %	0 %	0 %	385824984
136	NC_017477	TAAT	2	8	46324	46331	50 %	50 %	0 %	0 %	385824984
137	NC_017477	AAGA	2	8	46616	46623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017477	TTGT	2	8	46686	46693	0 %	75 %	25 %	0 %	385824985
139	NC_017477	AAGA	2	8	46992	46999	75 %	0 %	25 %	0 %	385824985
140	NC_017477	CTTA	2	8	47483	47490	25 %	50 %	0 %	25 %	385824985
141	NC_017477	TTTG	2	8	47603	47610	0 %	75 %	25 %	0 %	385824985
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