MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 29582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017477	TAA	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824948
2	NC_017477	AAG	2	6	197	202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824948
3	NC_017477	AAG	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824948
4	NC_017477	TGG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824948
5	NC_017477	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824948
6	NC_017477	TAA	2	6	627	632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824948
7	NC_017477	TAG	2	6	656	661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824948
8	NC_017477	AGG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824948
9	NC_017477	TTC	2	6	706	711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824948
10	NC_017477	GAC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824948
11	NC_017477	CAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824948
12	NC_017477	AAG	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824948
13	NC_017477	ACT	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824948
14	NC_017477	AAG	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824948
15	NC_017477	TTG	2	6	1169	1174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824948
16	NC_017477	AGC	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824948
17	NC_017477	TAA	2	6	1370	1375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017477	TTA	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017477	CTA	3	9	1472	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017477	AGG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017477	AAT	2	6	1588	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824949
22	NC_017477	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824949
23	NC_017477	CTA	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824949
24	NC_017477	GAT	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824949
25	NC_017477	CAT	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824949
26	NC_017477	ATT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824949
27	NC_017477	GTC	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824949
28	NC_017477	CAA	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824949
29	NC_017477	TCA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824949
30	NC_017477	ATT	2	6	2137	2142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824949
31	NC_017477	TAG	2	6	2156	2161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824949
32	NC_017477	ACA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824949
33	NC_017477	TCT	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824949
34	NC_017477	TAA	2	6	2391	2396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824949
35	NC_017477	GAA	3	9	2473	2481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824949
36	NC_017477	ATT	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824949
37	NC_017477	AGA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017477	TCT	2	6	2960	2965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824950
39	NC_017477	GGT	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824950
40	NC_017477	AGA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824950
41	NC_017477	GAA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824951
42	NC_017477	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824951
43	NC_017477	AGA	2	6	3497	3502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824951
44	NC_017477	CAA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824951
45	NC_017477	AGA	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824951
46	NC_017477	GAT	3	9	3809	3817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824951
47	NC_017477	TTA	2	6	3840	3845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824951
48	NC_017477	ACT	2	6	3887	3892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824951
49	NC_017477	GAT	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824951
50	NC_017477	ATC	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824951
51	NC_017477	AGT	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824951
52	NC_017477	TTA	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824951
53	NC_017477	CAA	2	6	4137	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824951
54	NC_017477	CTG	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824951
55	NC_017477	AGA	2	6	4237	4242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824952
56	NC_017477	GCA	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824952
57	NC_017477	TAG	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
58	NC_017477	ACC	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824952
59	NC_017477	ATT	2	6	4409	4414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824952
60	NC_017477	ATA	2	6	4416	4421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824952
61	NC_017477	GAT	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
62	NC_017477	GTC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824952
63	NC_017477	TGG	2	6	4582	4587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824952
64	NC_017477	CGG	2	6	4594	4599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824952
65	NC_017477	TGG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824952
66	NC_017477	GTA	2	6	4646	4651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
67	NC_017477	GTA	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
68	NC_017477	GAA	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824952
69	NC_017477	CGA	2	6	4834	4839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824952
70	NC_017477	AAG	2	6	4992	4997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824952
71	NC_017477	TGA	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
72	NC_017477	ACT	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824952
73	NC_017477	GAT	2	6	5213	5218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824952
74	NC_017477	TGT	2	6	5257	5262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824952
75	NC_017477	TTG	2	6	5406	5411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824952
76	NC_017477	CTG	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824952
77	NC_017477	ATC	2	6	5771	5776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824952
78	NC_017477	CGA	2	6	5935	5940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824952
79	NC_017477	AAC	2	6	6027	6032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824952
80	NC_017477	TCG	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824952
81	NC_017477	AGG	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824952
82	NC_017477	CTT	2	6	6281	6286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824953
83	NC_017477	CGT	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824953
84	NC_017477	AAG	2	6	6411	6416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824953
85	NC_017477	TTG	2	6	6427	6432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824953
86	NC_017477	GAT	2	6	6669	6674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824953
87	NC_017477	AGT	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824953
88	NC_017477	ACA	2	6	6756	6761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824953
89	NC_017477	CCA	2	6	6768	6773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824953
90	NC_017477	TAC	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824953
91	NC_017477	TGG	2	6	6878	6883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824953
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93	NC_017477	AAT	2	6	7170	7175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824953
94	NC_017477	TGG	2	6	7219	7224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824953
95	NC_017477	TAC	2	6	7275	7280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824953
96	NC_017477	CAC	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824953
97	NC_017477	AAG	2	6	7291	7296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824953
98	NC_017477	TTA	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824953
99	NC_017477	AAG	2	6	7329	7334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824953
100	NC_017477	ATT	2	6	7404	7409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824953
101	NC_017477	TGA	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824953
102	NC_017477	ATT	2	6	7617	7622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824953
103	NC_017477	TGA	2	6	7658	7663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824953
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110	NC_017477	TCT	2	6	8056	8061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824953
111	NC_017477	TCG	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824953
112	NC_017477	AAT	2	6	8166	8171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824953
113	NC_017477	GAA	2	6	8263	8268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824953
114	NC_017477	CGG	2	6	8417	8422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824953
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121	NC_017477	TAA	3	9	8728	8736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017477	ATT	2	6	8819	8824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017477	AGG	2	6	8870	8875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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