MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017476	GATCAA	2	12	3071	3082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385824843
2	NC_017476	GCTCAA	2	12	11448	11459	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385824852
3	NC_017476	TTCTGC	2	12	12353	12364	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385824852
4	NC_017476	ATGCAG	2	12	17970	17981	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385824857
5	NC_017476	CTGGTG	2	12	18017	18028	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385824857
6	NC_017476	GTTGCG	2	12	30098	30109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385824874
7	NC_017476	TGGGCT	2	12	30172	30183	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385824874
8	NC_017476	ATAATC	2	12	30243	30254	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385824874
9	NC_017476	GTTATT	2	12	32724	32735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385824874
10	NC_017476	CCCATC	2	12	34245	34256	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385824875
11	NC_017476	TGCCGA	2	12	34330	34341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385824875
12	NC_017476	TGGAAA	2	12	39061	39072	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385824884
13	NC_017476	CGGCAG	2	12	39963	39974	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385824886
14	NC_017476	GAAGCC	2	12	40411	40422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824886
15	NC_017476	CGATAA	2	12	40642	40653	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017476	ATCTTT	2	12	44033	44044	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385824888
17	NC_017476	CTCTAA	2	12	45734	45745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824888
18	NC_017476	ATTTTT	2	12	46108	46119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017476	AAATGA	2	12	56142	56153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.