MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017476	ACGTG	2	10	1482	1491	20 %	20 %	40 %	20 %	385824842
2	NC_017476	CTTTG	2	10	3387	3396	0 %	60 %	20 %	20 %	385824843
3	NC_017476	TAGTT	2	10	3430	3439	20 %	60 %	20 %	0 %	385824843
4	NC_017476	TTTTG	2	10	4974	4983	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017476	TGGAT	2	10	5569	5578	20 %	40 %	40 %	0 %	385824847
6	NC_017476	TCAGC	2	10	6681	6690	20 %	20 %	20 %	40 %	385824848
7	NC_017476	TTGGC	2	10	6731	6740	0 %	40 %	40 %	20 %	385824848
8	NC_017476	TGGTT	2	10	9484	9493	0 %	60 %	40 %	0 %	385824851
9	NC_017476	TGACA	2	10	9585	9594	40 %	20 %	20 %	20 %	385824851
10	NC_017476	TCATC	2	10	12867	12876	20 %	40 %	0 %	40 %	385824852
11	NC_017476	TGTTT	2	10	16919	16928	0 %	80 %	20 %	0 %	385824856
12	NC_017476	GAAAG	2	10	18324	18333	60 %	0 %	40 %	0 %	385824857
13	NC_017476	TGGGA	2	10	23158	23167	20 %	20 %	60 %	0 %	385824866
14	NC_017476	CAGTA	2	10	25356	25365	40 %	20 %	20 %	20 %	385824869
15	NC_017476	TAAAA	2	10	38512	38521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017476	CTAGG	2	10	39451	39460	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017476	ATTCA	2	10	40524	40533	40 %	40 %	0 %	20 %	385824886
18	NC_017476	TGGCC	2	10	40858	40867	0 %	20 %	40 %	40 %	385824887
19	NC_017476	TGTTT	2	10	40957	40966	0 %	80 %	20 %	0 %	385824887
20	NC_017476	ACCTT	2	10	42588	42597	20 %	40 %	0 %	40 %	385824888
21	NC_017476	TTCCA	2	10	46310	46319	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017476	TCAAG	2	10	46441	46450	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017476	ATTCA	2	10	48297	48306	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017476	ATCCA	2	10	50163	50172	40 %	20 %	0 %	40 %	385824894
25	NC_017476	CAAAG	2	10	50288	50297	60 %	0 %	20 %	20 %	385824894
26	NC_017476	CTACC	2	10	51143	51152	20 %	20 %	0 %	60 %	385824896
27	NC_017476	CGTCA	2	10	53461	53470	20 %	20 %	20 %	40 %	385824898
28	NC_017476	CTAGC	2	10	54178	54187	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017476	AAAAG	2	10	56036	56045	80 %	0 %	20 %	0 %	385824903

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.