MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017476	TG	3	6	1094	1099	0 %	50 %	50 %	0 %	385824842
2	NC_017476	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	385824843
3	NC_017476	CA	3	6	3575	3580	50 %	0 %	0 %	50 %	385824843
4	NC_017476	CG	3	6	3843	3848	0 %	0 %	50 %	50 %	385824843
5	NC_017476	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017476	TG	3	6	5964	5969	0 %	50 %	50 %	0 %	385824847
7	NC_017476	CT	3	6	6039	6044	0 %	50 %	0 %	50 %	385824847
8	NC_017476	CT	3	6	6079	6084	0 %	50 %	0 %	50 %	385824847
9	NC_017476	TG	3	6	6167	6172	0 %	50 %	50 %	0 %	385824847
10	NC_017476	GA	3	6	8450	8455	50 %	0 %	50 %	0 %	385824851
11	NC_017476	GA	3	6	9347	9352	50 %	0 %	50 %	0 %	385824851
12	NC_017476	AT	3	6	10877	10882	50 %	50 %	0 %	0 %	385824852
13	NC_017476	AT	3	6	11441	11446	50 %	50 %	0 %	0 %	385824852
14	NC_017476	GA	3	6	11736	11741	50 %	0 %	50 %	0 %	385824852
15	NC_017476	GT	3	6	12592	12597	0 %	50 %	50 %	0 %	385824852
16	NC_017476	AC	3	6	12639	12644	50 %	0 %	0 %	50 %	385824852
17	NC_017476	AT	3	6	14294	14299	50 %	50 %	0 %	0 %	385824853
18	NC_017476	CG	3	6	15032	15037	0 %	0 %	50 %	50 %	385824855
19	NC_017476	CA	3	6	15253	15258	50 %	0 %	0 %	50 %	385824855
20	NC_017476	GT	3	6	15956	15961	0 %	50 %	50 %	0 %	385824855
21	NC_017476	AT	3	6	16520	16525	50 %	50 %	0 %	0 %	385824855
22	NC_017476	GC	4	8	16853	16860	0 %	0 %	50 %	50 %	385824856
23	NC_017476	AC	3	6	19325	19330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017476	GC	3	6	19405	19410	0 %	0 %	50 %	50 %	385824860
25	NC_017476	CA	3	6	19498	19503	50 %	0 %	0 %	50 %	385824860
26	NC_017476	TC	3	6	19564	19569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017476	AC	3	6	19646	19651	50 %	0 %	0 %	50 %	385824861
28	NC_017476	GC	3	6	19842	19847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017476	GC	3	6	25235	25240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017476	CA	3	6	26091	26096	50 %	0 %	0 %	50 %	385824869
31	NC_017476	TA	3	6	27738	27743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017476	GT	3	6	29884	29889	0 %	50 %	50 %	0 %	385824874
33	NC_017476	TA	3	6	30635	30640	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
34	NC_017476	AT	3	6	31213	31218	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
35	NC_017476	TA	3	6	38073	38078	50 %	50 %	0 %	0 %	385824883
36	NC_017476	TC	3	6	38469	38474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017476	AT	6	12	38554	38565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017476	TA	3	6	40942	40947	50 %	50 %	0 %	0 %	385824887
39	NC_017476	GA	3	6	41013	41018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017476	CT	3	6	41037	41042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017476	AG	3	6	43466	43471	50 %	0 %	50 %	0 %	385824888
42	NC_017476	AT	3	6	43587	43592	50 %	50 %	0 %	0 %	385824888
43	NC_017476	TG	3	6	45396	45401	0 %	50 %	50 %	0 %	385824888
44	NC_017476	AT	3	6	46049	46054	50 %	50 %	0 %	0 %	385824888
45	NC_017476	AT	4	8	46170	46177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017476	TA	3	6	46698	46703	50 %	50 %	0 %	0 %	385824889
47	NC_017476	GT	3	6	48422	48427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017476	CA	3	6	49230	49235	50 %	0 %	0 %	50 %	385824893
49	NC_017476	CA	3	6	49518	49523	50 %	0 %	0 %	50 %	385824893
50	NC_017476	AC	3	6	50404	50409	50 %	0 %	0 %	50 %	385824894
51	NC_017476	GT	3	6	51088	51093	0 %	50 %	50 %	0 %	385824896
52	NC_017476	AG	4	8	51256	51263	50 %	0 %	50 %	0 %	385824896
53	NC_017476	TA	3	6	51868	51873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017476	AC	3	6	54020	54025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017476	GC	3	6	54343	54348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017476	GC	3	6	57297	57302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.