MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017476	TG	3	6	1094	1099	0 %	50 %	50 %	0 %	385824842
2	NC_017476	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	385824843
3	NC_017476	CA	3	6	3575	3580	50 %	0 %	0 %	50 %	385824843
4	NC_017476	CG	3	6	3843	3848	0 %	0 %	50 %	50 %	385824843
5	NC_017476	TG	3	6	5964	5969	0 %	50 %	50 %	0 %	385824847
6	NC_017476	CT	3	6	6039	6044	0 %	50 %	0 %	50 %	385824847
7	NC_017476	CT	3	6	6079	6084	0 %	50 %	0 %	50 %	385824847
8	NC_017476	TG	3	6	6167	6172	0 %	50 %	50 %	0 %	385824847
9	NC_017476	GA	3	6	8450	8455	50 %	0 %	50 %	0 %	385824851
10	NC_017476	GA	3	6	9347	9352	50 %	0 %	50 %	0 %	385824851
11	NC_017476	AT	3	6	10877	10882	50 %	50 %	0 %	0 %	385824852
12	NC_017476	AT	3	6	11441	11446	50 %	50 %	0 %	0 %	385824852
13	NC_017476	GA	3	6	11736	11741	50 %	0 %	50 %	0 %	385824852
14	NC_017476	GT	3	6	12592	12597	0 %	50 %	50 %	0 %	385824852
15	NC_017476	AC	3	6	12639	12644	50 %	0 %	0 %	50 %	385824852
16	NC_017476	AT	3	6	14294	14299	50 %	50 %	0 %	0 %	385824853
17	NC_017476	CG	3	6	15032	15037	0 %	0 %	50 %	50 %	385824855
18	NC_017476	CA	3	6	15253	15258	50 %	0 %	0 %	50 %	385824855
19	NC_017476	GT	3	6	15956	15961	0 %	50 %	50 %	0 %	385824855
20	NC_017476	AT	3	6	16520	16525	50 %	50 %	0 %	0 %	385824855
21	NC_017476	GC	4	8	16853	16860	0 %	0 %	50 %	50 %	385824856
22	NC_017476	GC	3	6	19405	19410	0 %	0 %	50 %	50 %	385824860
23	NC_017476	CA	3	6	19498	19503	50 %	0 %	0 %	50 %	385824860
24	NC_017476	AC	3	6	19646	19651	50 %	0 %	0 %	50 %	385824861
25	NC_017476	CA	3	6	26091	26096	50 %	0 %	0 %	50 %	385824869
26	NC_017476	GT	3	6	29884	29889	0 %	50 %	50 %	0 %	385824874
27	NC_017476	TA	3	6	30635	30640	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
28	NC_017476	AT	3	6	31213	31218	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
29	NC_017476	TA	3	6	38073	38078	50 %	50 %	0 %	0 %	385824883
30	NC_017476	TA	3	6	40942	40947	50 %	50 %	0 %	0 %	385824887
31	NC_017476	AG	3	6	43466	43471	50 %	0 %	50 %	0 %	385824888
32	NC_017476	AT	3	6	43587	43592	50 %	50 %	0 %	0 %	385824888
33	NC_017476	TG	3	6	45396	45401	0 %	50 %	50 %	0 %	385824888
34	NC_017476	AT	3	6	46049	46054	50 %	50 %	0 %	0 %	385824888
35	NC_017476	TA	3	6	46698	46703	50 %	50 %	0 %	0 %	385824889
36	NC_017476	CA	3	6	49230	49235	50 %	0 %	0 %	50 %	385824893
37	NC_017476	CA	3	6	49518	49523	50 %	0 %	0 %	50 %	385824893
38	NC_017476	AC	3	6	50404	50409	50 %	0 %	0 %	50 %	385824894
39	NC_017476	GT	3	6	51088	51093	0 %	50 %	50 %	0 %	385824896
40	NC_017476	AG	4	8	51256	51263	50 %	0 %	50 %	0 %	385824896

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.