MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017476	T	7	7	861	867	0 %	100 %	0 %	0 %	385824842
2	NC_017476	T	7	7	3886	3892	0 %	100 %	0 %	0 %	385824843
3	NC_017476	T	6	6	4885	4890	0 %	100 %	0 %	0 %	385824845
4	NC_017476	T	7	7	5444	5450	0 %	100 %	0 %	0 %	385824847
5	NC_017476	T	6	6	5491	5496	0 %	100 %	0 %	0 %	385824847
6	NC_017476	T	6	6	5831	5836	0 %	100 %	0 %	0 %	385824847
7	NC_017476	T	6	6	6594	6599	0 %	100 %	0 %	0 %	385824848
8	NC_017476	A	6	6	7013	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	385824848
9	NC_017476	T	6	6	7126	7131	0 %	100 %	0 %	0 %	385824848
10	NC_017476	T	6	6	7608	7613	0 %	100 %	0 %	0 %	385824849
11	NC_017476	T	7	7	7729	7735	0 %	100 %	0 %	0 %	385824849
12	NC_017476	T	6	6	8190	8195	0 %	100 %	0 %	0 %	385824850
13	NC_017476	T	7	7	9894	9900	0 %	100 %	0 %	0 %	385824851
14	NC_017476	T	6	6	10393	10398	0 %	100 %	0 %	0 %	385824851
15	NC_017476	T	7	7	10674	10680	0 %	100 %	0 %	0 %	385824851
16	NC_017476	A	6	6	13086	13091	100 %	0 %	0 %	0 %	385824852
17	NC_017476	A	6	6	16009	16014	100 %	0 %	0 %	0 %	385824855
18	NC_017476	A	6	6	16773	16778	100 %	0 %	0 %	0 %	385824856
19	NC_017476	T	6	6	16901	16906	0 %	100 %	0 %	0 %	385824856
20	NC_017476	T	6	6	18451	18456	0 %	100 %	0 %	0 %	385824857
21	NC_017476	T	6	6	18923	18928	0 %	100 %	0 %	0 %	385824859
22	NC_017476	T	7	7	18973	18979	0 %	100 %	0 %	0 %	385824859
23	NC_017476	A	6	6	19215	19220	100 %	0 %	0 %	0 %	385824859
24	NC_017476	A	10	10	22155	22164	100 %	0 %	0 %	0 %	385824864
25	NC_017476	T	6	6	22639	22644	0 %	100 %	0 %	0 %	385824866
26	NC_017476	T	6	6	23342	23347	0 %	100 %	0 %	0 %	385824866
27	NC_017476	A	7	7	23401	23407	100 %	0 %	0 %	0 %	385824867
28	NC_017476	A	7	7	26501	26507	100 %	0 %	0 %	0 %	385824870
29	NC_017476	T	6	6	28339	28344	0 %	100 %	0 %	0 %	385824873
30	NC_017476	C	6	6	28558	28563	0 %	0 %	0 %	100 %	385824873
31	NC_017476	A	6	6	29563	29568	100 %	0 %	0 %	0 %	385824873
32	NC_017476	T	6	6	29671	29676	0 %	100 %	0 %	0 %	385824873
33	NC_017476	T	7	7	29951	29957	0 %	100 %	0 %	0 %	385824874
34	NC_017476	T	7	7	31742	31748	0 %	100 %	0 %	0 %	385824874
35	NC_017476	A	6	6	32224	32229	100 %	0 %	0 %	0 %	385824874
36	NC_017476	T	7	7	32388	32394	0 %	100 %	0 %	0 %	385824874
37	NC_017476	T	6	6	34292	34297	0 %	100 %	0 %	0 %	385824875
38	NC_017476	A	6	6	34641	34646	100 %	0 %	0 %	0 %	385824876
39	NC_017476	A	6	6	35187	35192	100 %	0 %	0 %	0 %	385824876
40	NC_017476	A	6	6	35396	35401	100 %	0 %	0 %	0 %	385824876
41	NC_017476	A	7	7	36038	36044	100 %	0 %	0 %	0 %	385824877
42	NC_017476	T	6	6	40231	40236	0 %	100 %	0 %	0 %	385824886
43	NC_017476	T	7	7	40769	40775	0 %	100 %	0 %	0 %	385824887
44	NC_017476	T	6	6	41431	41436	0 %	100 %	0 %	0 %	385824888
45	NC_017476	T	6	6	41545	41550	0 %	100 %	0 %	0 %	385824888
46	NC_017476	T	6	6	43406	43411	0 %	100 %	0 %	0 %	385824888
47	NC_017476	T	6	6	43944	43949	0 %	100 %	0 %	0 %	385824888
48	NC_017476	A	7	7	46029	46035	100 %	0 %	0 %	0 %	385824888
49	NC_017476	A	7	7	46801	46807	100 %	0 %	0 %	0 %	385824889
50	NC_017476	T	6	6	47002	47007	0 %	100 %	0 %	0 %	385824890
51	NC_017476	A	6	6	49474	49479	100 %	0 %	0 %	0 %	385824893
52	NC_017476	T	6	6	50598	50603	0 %	100 %	0 %	0 %	385824895
53	NC_017476	T	6	6	51646	51651	0 %	100 %	0 %	0 %	385824896
54	NC_017476	T	6	6	52336	52341	0 %	100 %	0 %	0 %	385824897
55	NC_017476	A	6	6	52398	52403	100 %	0 %	0 %	0 %	385824897
56	NC_017476	A	7	7	52434	52440	100 %	0 %	0 %	0 %	385824897
57	NC_017476	T	6	6	53043	53048	0 %	100 %	0 %	0 %	385824897
58	NC_017476	A	7	7	53070	53076	100 %	0 %	0 %	0 %	385824897
59	NC_017476	A	6	6	53336	53341	100 %	0 %	0 %	0 %	385824898
60	NC_017476	A	6	6	55169	55174	100 %	0 %	0 %	0 %	385824900
61	NC_017476	A	7	7	56393	56399	100 %	0 %	0 %	0 %	385824904

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.