MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei LC2W plasmid pLC2W

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017475	TAAAA	2	10	1780	1789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017475	CAAAT	2	10	3244	3253	60 %	20 %	0 %	20 %	385821662
3	NC_017475	CCATG	2	10	4051	4060	20 %	20 %	20 %	40 %	385821662
4	NC_017475	GAAGT	2	10	5165	5174	40 %	20 %	40 %	0 %	385821663
5	NC_017475	TAAAT	2	10	11509	11518	60 %	40 %	0 %	0 %	385821672
6	NC_017475	GATTG	2	10	14027	14036	20 %	40 %	40 %	0 %	385821672
7	NC_017475	TACTG	2	10	18887	18896	20 %	40 %	20 %	20 %	385821677
8	NC_017475	CTTTT	2	10	20269	20278	0 %	80 %	0 %	20 %	385821680
9	NC_017475	GCTAG	2	10	22127	22136	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017475	CATCA	2	10	22677	22686	40 %	20 %	0 %	40 %	385821685
11	NC_017475	TGACG	2	10	22844	22853	20 %	20 %	40 %	20 %	385821685
12	NC_017475	CAATG	2	10	24999	25008	40 %	20 %	20 %	20 %	385821687
13	NC_017475	CTTTG	2	10	26017	26026	0 %	60 %	20 %	20 %	385821689
14	NC_017475	TGGAT	2	10	26142	26151	20 %	40 %	40 %	0 %	385821689
15	NC_017475	TGAAT	2	10	28008	28017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017475	ACTTG	2	10	29863	29872	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017475	TGGAA	2	10	29995	30004	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017475	AAGGT	2	10	33717	33726	40 %	20 %	40 %	0 %	385821695
19	NC_017475	GGCCA	2	10	35447	35456	20 %	0 %	40 %	40 %	385821696
20	NC_017475	TGAAT	2	10	35781	35790	40 %	40 %	20 %	0 %	385821697
21	NC_017475	GCCTA	2	10	36853	36862	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017475	TTTTA	2	10	37793	37802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.