MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei LC2W plasmid pLC2W

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017475	A	7	7	763	769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017475	A	6	6	1702	1707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017475	A	6	6	1774	1779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017475	T	6	6	1925	1930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017475	A	6	6	2147	2152	100 %	0 %	0 %	0 %	385821661
6	NC_017475	A	6	6	2414	2419	100 %	0 %	0 %	0 %	385821661
7	NC_017475	A	6	6	4574	4579	100 %	0 %	0 %	0 %	385821662
8	NC_017475	T	6	6	6744	6749	0 %	100 %	0 %	0 %	385821665
9	NC_017475	T	7	7	7579	7585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017475	T	7	7	8207	8213	0 %	100 %	0 %	0 %	385821669
11	NC_017475	T	6	6	8850	8855	0 %	100 %	0 %	0 %	385821670
12	NC_017475	T	6	6	9059	9064	0 %	100 %	0 %	0 %	385821670
13	NC_017475	T	6	6	9605	9610	0 %	100 %	0 %	0 %	385821670
14	NC_017475	A	6	6	9954	9959	100 %	0 %	0 %	0 %	385821671
15	NC_017475	A	6	6	10814	10819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017475	A	6	6	10975	10980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017475	A	6	6	10982	10987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017475	T	6	6	11028	11033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017475	T	7	7	11172	11178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017475	T	6	6	11259	11264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017475	A	7	7	11857	11863	100 %	0 %	0 %	0 %	385821672
22	NC_017475	T	6	6	12022	12027	0 %	100 %	0 %	0 %	385821672
23	NC_017475	A	7	7	12503	12509	100 %	0 %	0 %	0 %	385821672
24	NC_017475	A	7	7	14294	14300	100 %	0 %	0 %	0 %	385821672
25	NC_017475	A	6	6	14575	14580	100 %	0 %	0 %	0 %	385821673
26	NC_017475	T	6	6	14683	14688	0 %	100 %	0 %	0 %	385821673
27	NC_017475	G	6	6	15688	15693	0 %	0 %	100 %	0 %	385821673
28	NC_017475	A	6	6	15907	15912	100 %	0 %	0 %	0 %	385821673
29	NC_017475	A	6	6	16282	16287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017475	T	6	6	16354	16359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017475	T	6	6	16396	16401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017475	T	7	7	16648	16654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017475	A	6	6	16695	16700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017475	A	6	6	16775	16780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017475	A	7	7	17135	17141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017475	T	7	7	17745	17751	0 %	100 %	0 %	0 %	385821676
37	NC_017475	T	7	7	19915	19921	0 %	100 %	0 %	0 %	385821679
38	NC_017475	T	6	6	21140	21145	0 %	100 %	0 %	0 %	385821683
39	NC_017475	T	7	7	22215	22221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017475	T	6	6	22269	22274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017475	T	6	6	22973	22978	0 %	100 %	0 %	0 %	385821685
42	NC_017475	T	7	7	23238	23244	0 %	100 %	0 %	0 %	385821686
43	NC_017475	A	6	6	23266	23271	100 %	0 %	0 %	0 %	385821686
44	NC_017475	T	7	7	23874	23880	0 %	100 %	0 %	0 %	385821686
45	NC_017475	T	6	6	23911	23916	0 %	100 %	0 %	0 %	385821686
46	NC_017475	A	6	6	23973	23978	100 %	0 %	0 %	0 %	385821686
47	NC_017475	T	6	6	24384	24389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017475	A	6	6	24409	24414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017475	A	7	7	24419	24425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017475	A	6	6	24663	24668	100 %	0 %	0 %	0 %	385821687
51	NC_017475	A	6	6	25711	25716	100 %	0 %	0 %	0 %	385821688
52	NC_017475	T	6	6	26835	26840	0 %	100 %	0 %	0 %	385821690
53	NC_017475	A	6	6	27963	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017475	A	6	6	29307	29312	100 %	0 %	0 %	0 %	385821693
55	NC_017475	T	7	7	29507	29513	0 %	100 %	0 %	0 %	385821694
56	NC_017475	T	7	7	29963	29969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017475	T	7	7	30146	30152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017475	A	6	6	30194	30199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017475	T	7	7	30279	30285	0 %	100 %	0 %	0 %	385821695
60	NC_017475	A	6	6	32365	32370	100 %	0 %	0 %	0 %	385821695
61	NC_017475	A	6	6	32903	32908	100 %	0 %	0 %	0 %	385821695
62	NC_017475	A	6	6	34764	34769	100 %	0 %	0 %	0 %	385821695
63	NC_017475	A	6	6	34878	34883	100 %	0 %	0 %	0 %	385821695
64	NC_017475	T	6	6	35109	35114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017475	A	7	7	35155	35161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017475	A	7	7	35539	35545	100 %	0 %	0 %	0 %	385821696
67	NC_017475	A	6	6	36078	36083	100 %	0 %	0 %	0 %	385821697
68	NC_017475	A	6	6	36816	36821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017475	C	6	6	37079	37084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_017475	A	6	6	37085	37090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017475	A	6	6	37732	37737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.