MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 1602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017474	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	385821701
2	NC_017474	CAACG	2	10	1771	1780	40 %	0 %	20 %	40 %	385821702
3	NC_017474	GAAGA	2	10	5070	5079	60 %	0 %	40 %	0 %	385821705
4	NC_017474	GGCAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	385821705
5	NC_017474	GACAA	2	10	5830	5839	60 %	0 %	20 %	20 %	385821705
6	NC_017474	GAAAA	2	10	7915	7924	80 %	0 %	20 %	0 %	385821706
7	NC_017474	GACAA	2	10	9041	9050	60 %	0 %	20 %	20 %	385821706
8	NC_017474	CATTT	2	10	10155	10164	20 %	60 %	0 %	20 %	385821707
9	NC_017474	CAAAA	2	10	14937	14946	80 %	0 %	0 %	20 %	385821713
10	NC_017474	ATTGA	2	10	20035	20044	40 %	40 %	20 %	0 %	385821719
11	NC_017474	CAACC	2	10	21362	21371	40 %	0 %	0 %	60 %	385821721
12	NC_017474	TGGCT	2	10	22959	22968	0 %	40 %	40 %	20 %	385821723
13	NC_017474	GCTTT	2	10	24511	24520	0 %	60 %	20 %	20 %	385821724
14	NC_017474	CAGCG	2	10	25158	25167	20 %	0 %	40 %	40 %	385821724
15	NC_017474	GCCCG	2	10	26062	26071	0 %	0 %	40 %	60 %	385821724
16	NC_017474	TCCTG	2	10	28083	28092	0 %	40 %	20 %	40 %	385821727
17	NC_017474	GGCTA	2	10	28576	28585	20 %	20 %	40 %	20 %	385821727
18	NC_017474	TTGTT	2	10	28872	28881	0 %	80 %	20 %	0 %	385821728
19	NC_017474	AAGCC	2	10	33296	33305	40 %	0 %	20 %	40 %	385821732
20	NC_017474	CAAAG	2	10	34144	34153	60 %	0 %	20 %	20 %	385821733
21	NC_017474	TTTCT	2	10	41215	41224	0 %	80 %	0 %	20 %	385821741
22	NC_017474	GTTTG	2	10	44524	44533	0 %	60 %	40 %	0 %	385821745
23	NC_017474	GAAAA	2	10	46873	46882	80 %	0 %	20 %	0 %	385821750
24	NC_017474	TTGAA	2	10	47298	47307	40 %	40 %	20 %	0 %	385821750
25	NC_017474	ATAAA	2	10	47444	47453	80 %	20 %	0 %	0 %	385821750
26	NC_017474	TCAAT	2	10	48309	48318	40 %	40 %	0 %	20 %	385821751
27	NC_017474	ATGAA	2	10	50627	50636	60 %	20 %	20 %	0 %	385821753
28	NC_017474	TTTCT	2	10	52790	52799	0 %	80 %	0 %	20 %	385821756
29	NC_017474	TTCTT	2	10	53738	53747	0 %	80 %	0 %	20 %	385821757
30	NC_017474	TGTTT	2	10	56892	56901	0 %	80 %	20 %	0 %	385821759
31	NC_017474	GCGCC	2	10	58396	58405	0 %	0 %	40 %	60 %	385821760
32	NC_017474	CAGTT	2	10	60868	60877	20 %	40 %	20 %	20 %	385821761
33	NC_017474	TTGAT	2	10	67902	67911	20 %	60 %	20 %	0 %	385821770
34	NC_017474	TTGCT	2	10	67995	68004	0 %	60 %	20 %	20 %	385821770
35	NC_017474	CGTTT	2	10	69895	69904	0 %	60 %	20 %	20 %	385821772
36	NC_017474	TAAGT	2	10	73754	73763	40 %	40 %	20 %	0 %	385821777
37	NC_017474	TCATC	2	10	75303	75312	20 %	40 %	0 %	40 %	385821779
38	NC_017474	GAAGC	2	10	79599	79608	40 %	0 %	40 %	20 %	385821782
39	NC_017474	TGGCA	2	10	79766	79775	20 %	20 %	40 %	20 %	385821782
40	NC_017474	GTTTC	2	10	82547	82556	0 %	60 %	20 %	20 %	385821785
41	NC_017474	TGTGC	2	10	83673	83682	0 %	40 %	40 %	20 %	385821786
42	NC_017474	TGCTT	2	10	84744	84753	0 %	60 %	20 %	20 %	385821787
43	NC_017474	ATCCA	2	10	85207	85216	40 %	20 %	0 %	40 %	385821788
44	NC_017474	AACCA	2	10	85582	85591	60 %	0 %	0 %	40 %	385821788
45	NC_017474	TAGTT	2	10	89081	89090	20 %	60 %	20 %	0 %	385821792
46	NC_017474	AGATA	2	10	91371	91380	60 %	20 %	20 %	0 %	385821793
47	NC_017474	CCAAC	2	10	91830	91839	40 %	0 %	0 %	60 %	385821794
48	NC_017474	TCCCA	2	10	92877	92886	20 %	20 %	0 %	60 %	385821795
49	NC_017474	GCTTT	2	10	96518	96527	0 %	60 %	20 %	20 %	385821798
50	NC_017474	ATTGA	2	10	99772	99781	40 %	40 %	20 %	0 %	385821800
51	NC_017474	CAAAA	2	10	102447	102456	80 %	0 %	0 %	20 %	385821805
52	NC_017474	ATTTC	2	10	102973	102982	20 %	60 %	0 %	20 %	385821805
53	NC_017474	GAAGA	2	10	107035	107044	60 %	0 %	40 %	0 %	385821809
54	NC_017474	GAAAA	2	10	107053	107062	80 %	0 %	20 %	0 %	385821809
55	NC_017474	CAAAG	2	10	107119	107128	60 %	0 %	20 %	20 %	385821809
56	NC_017474	CGGCC	2	10	110826	110835	0 %	0 %	40 %	60 %	385821812
57	NC_017474	CTCAA	2	10	111409	111418	40 %	20 %	0 %	40 %	385821812
58	NC_017474	ACCAA	2	10	111680	111689	60 %	0 %	0 %	40 %	385821812
59	NC_017474	CAAGT	2	10	112640	112649	40 %	20 %	20 %	20 %	385821813
60	NC_017474	GACCC	2	10	114088	114097	20 %	0 %	20 %	60 %	385821814
61	NC_017474	ACCAA	2	10	114676	114685	60 %	0 %	0 %	40 %	385821815
62	NC_017474	TTGGC	2	10	116192	116201	0 %	40 %	40 %	20 %	385821815
63	NC_017474	GAAAA	2	10	119596	119605	80 %	0 %	20 %	0 %	385821819
64	NC_017474	ATTGC	2	10	126657	126666	20 %	40 %	20 %	20 %	385821825
65	NC_017474	TGATC	2	10	127487	127496	20 %	40 %	20 %	20 %	385821826
66	NC_017474	CATGC	2	10	128617	128626	20 %	20 %	20 %	40 %	385821827
67	NC_017474	CGATC	2	10	135368	135377	20 %	20 %	20 %	40 %	385821834
68	NC_017474	AAAGC	2	10	141322	141331	60 %	0 %	20 %	20 %	385821842
69	NC_017474	CATAA	2	10	141391	141400	60 %	20 %	0 %	20 %	385821842
70	NC_017474	GGGAT	2	10	142484	142493	20 %	20 %	60 %	0 %	385821843
71	NC_017474	GCTCA	2	10	142819	142828	20 %	20 %	20 %	40 %	385821843
72	NC_017474	TTTTC	2	10	146798	146807	0 %	80 %	0 %	20 %	385821848
73	NC_017474	CAAGC	2	10	148188	148197	40 %	0 %	20 %	40 %	385821849
74	NC_017474	AATGA	2	10	149488	149497	60 %	20 %	20 %	0 %	385821850
75	NC_017474	CCAAC	2	10	150056	150065	40 %	0 %	0 %	60 %	385821851
76	NC_017474	GCCTT	2	10	151948	151957	0 %	40 %	20 %	40 %	385821853
77	NC_017474	GTAAG	2	10	156084	156093	40 %	20 %	40 %	0 %	385821857
78	NC_017474	CACAA	2	10	157518	157527	60 %	0 %	0 %	40 %	385821858
79	NC_017474	TGAAT	2	10	159507	159516	40 %	40 %	20 %	0 %	385821860
80	NC_017474	ATCAA	2	10	160959	160968	60 %	20 %	0 %	20 %	385821862
81	NC_017474	CCGTT	2	10	165178	165187	0 %	40 %	20 %	40 %	385821865
82	NC_017474	CCAAC	2	10	167587	167596	40 %	0 %	0 %	60 %	385821867
83	NC_017474	GAACC	2	10	168838	168847	40 %	0 %	20 %	40 %	385821867
84	NC_017474	TGAAG	2	10	170236	170245	40 %	20 %	40 %	0 %	385821868
85	NC_017474	CAGCC	2	10	171148	171157	20 %	0 %	20 %	60 %	385821868
86	NC_017474	TGGTT	2	10	172466	172475	0 %	60 %	40 %	0 %	385821871
87	NC_017474	CTGAA	2	10	174346	174355	40 %	20 %	20 %	20 %	385821873
88	NC_017474	GTTGA	2	10	176624	176633	20 %	40 %	40 %	0 %	385821874
89	NC_017474	CGTTG	2	10	178849	178858	0 %	40 %	40 %	20 %	385821876
90	NC_017474	AGATG	2	10	179825	179834	40 %	20 %	40 %	0 %	385821877
91	NC_017474	TTCAT	2	10	182312	182321	20 %	60 %	0 %	20 %	385821881
92	NC_017474	GGCAT	2	10	185128	185137	20 %	20 %	40 %	20 %	385821886
93	NC_017474	CGGCA	2	10	185732	185741	20 %	0 %	40 %	40 %	385821887
94	NC_017474	GCCAA	2	10	190718	190727	40 %	0 %	20 %	40 %	385821895
95	NC_017474	CTGGG	2	10	193484	193493	0 %	20 %	60 %	20 %	385821899
96	NC_017474	ACTTC	2	10	195646	195655	20 %	40 %	0 %	40 %	385821901
97	NC_017474	GTAGA	2	10	196046	196055	40 %	20 %	40 %	0 %	385821902
98	NC_017474	GCTTG	2	10	197851	197860	0 %	40 %	40 %	20 %	385821904
99	NC_017474	CGTCA	2	10	201814	201823	20 %	20 %	20 %	40 %	385821908
100	NC_017474	TCAAT	2	10	201938	201947	40 %	40 %	0 %	20 %	385821908
101	NC_017474	AAATC	2	10	208819	208828	60 %	20 %	0 %	20 %	385821914
102	NC_017474	TGGAA	2	10	209884	209893	40 %	20 %	40 %	0 %	385821915
103	NC_017474	CAGAA	2	10	210388	210397	60 %	0 %	20 %	20 %	385821915
104	NC_017474	ATTTG	2	10	213613	213622	20 %	60 %	20 %	0 %	385821918
105	NC_017474	AAATG	2	10	217042	217051	60 %	20 %	20 %	0 %	385821920
106	NC_017474	CAAAA	2	10	217562	217571	80 %	0 %	0 %	20 %	385821920
107	NC_017474	ACTGG	2	10	217754	217763	20 %	20 %	40 %	20 %	385821921
108	NC_017474	CCATG	2	10	218958	218967	20 %	20 %	20 %	40 %	385821922
109	NC_017474	GAGTC	2	10	220724	220733	20 %	20 %	40 %	20 %	385821924
110	NC_017474	ACTCA	2	10	221697	221706	40 %	20 %	0 %	40 %	385821925
111	NC_017474	ATTTG	2	10	222343	222352	20 %	60 %	20 %	0 %	385821926
112	NC_017474	TTTGA	2	10	226236	226245	20 %	60 %	20 %	0 %	385821928
113	NC_017474	CGTTT	2	10	229556	229565	0 %	60 %	20 %	20 %	385821931
114	NC_017474	ATTTG	2	10	230971	230980	20 %	60 %	20 %	0 %	385821933
115	NC_017474	CAGTG	2	10	232212	232221	20 %	20 %	40 %	20 %	385821934
116	NC_017474	ATTCA	2	10	233002	233011	40 %	40 %	0 %	20 %	385821934
117	NC_017474	GAAGC	2	10	233049	233058	40 %	0 %	40 %	20 %	385821934
118	NC_017474	CTGGA	2	10	236149	236158	20 %	20 %	40 %	20 %	385821936
119	NC_017474	AGTTG	2	10	240538	240547	20 %	40 %	40 %	0 %	385821941
120	NC_017474	TCCAG	2	10	241253	241262	20 %	20 %	20 %	40 %	385821942
121	NC_017474	TGATT	2	10	241317	241326	20 %	60 %	20 %	0 %	385821942
122	NC_017474	TGTCA	2	10	241561	241570	20 %	40 %	20 %	20 %	385821942
123	NC_017474	TGATC	2	10	245365	245374	20 %	40 %	20 %	20 %	385821945
124	NC_017474	AACTT	2	10	247384	247393	40 %	40 %	0 %	20 %	385821946
125	NC_017474	CAAAC	2	10	251051	251060	60 %	0 %	0 %	40 %	385821950
126	NC_017474	GATCG	2	10	252311	252320	20 %	20 %	40 %	20 %	385821952
127	NC_017474	AGATC	2	10	254416	254425	40 %	20 %	20 %	20 %	385821953
128	NC_017474	GCACT	2	10	254649	254658	20 %	20 %	20 %	40 %	385821953
129	NC_017474	ATTCG	2	10	262172	262181	20 %	40 %	20 %	20 %	385821958
130	NC_017474	ATGCT	2	10	264128	264137	20 %	40 %	20 %	20 %	385821961
131	NC_017474	ATGGC	2	10	264257	264266	20 %	20 %	40 %	20 %	385821961
132	NC_017474	GATCG	2	10	265376	265385	20 %	20 %	40 %	20 %	385821962
133	NC_017474	TTGCT	2	10	266281	266290	0 %	60 %	20 %	20 %	385821963
134	NC_017474	ACATG	2	10	267154	267163	40 %	20 %	20 %	20 %	385821964
135	NC_017474	ATGGC	2	10	267487	267496	20 %	20 %	40 %	20 %	385821965
136	NC_017474	AATCG	2	10	269705	269714	40 %	20 %	20 %	20 %	385821967
137	NC_017474	TTGGG	2	10	272397	272406	0 %	40 %	60 %	0 %	385821970
138	NC_017474	CGTCA	2	10	275474	275483	20 %	20 %	20 %	40 %	385821972
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142	NC_017474	GATTG	2	10	283439	283448	20 %	40 %	40 %	0 %	385821980
143	NC_017474	TGTTT	2	10	284747	284756	0 %	80 %	20 %	0 %	385821981
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146	NC_017474	TCTGA	2	10	288256	288265	20 %	40 %	20 %	20 %	385821984
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149	NC_017474	TTGAA	2	10	292590	292599	40 %	40 %	20 %	0 %	385821987
150	NC_017474	ACTTG	2	10	294379	294388	20 %	40 %	20 %	20 %	385821988
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152	NC_017474	GTTGG	2	10	296194	296203	0 %	40 %	60 %	0 %	385821991
153	NC_017474	AGGCA	2	10	302711	302720	40 %	0 %	40 %	20 %	385821997
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156	NC_017474	AGTTG	2	10	305768	305777	20 %	40 %	40 %	0 %	385822001
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