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Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 41143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017474	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017474	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017474	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821701
4	NC_017474	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821701
5	NC_017474	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821701
6	NC_017474	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821701
7	NC_017474	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821701
8	NC_017474	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821701
9	NC_017474	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821701
10	NC_017474	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821701
11	NC_017474	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821701
12	NC_017474	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821701
13	NC_017474	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821701
14	NC_017474	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821701
15	NC_017474	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821701
16	NC_017474	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821701
17	NC_017474	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821701
18	NC_017474	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017474	AGG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017474	ATG	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821702
21	NC_017474	AAC	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821702
22	NC_017474	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821702
23	NC_017474	TCA	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821702
24	NC_017474	CAT	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821702
25	NC_017474	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821702
26	NC_017474	GAA	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821702
27	NC_017474	CAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821702
28	NC_017474	GCG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821702
29	NC_017474	AGA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821702
30	NC_017474	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821702
31	NC_017474	CAA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017474	TGA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017474	ATA	3	9	2861	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017474	GAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017474	TAG	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017474	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017474	ATA	3	9	3077	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017474	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017474	AGT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017474	GAC	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017474	ACA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821703
42	NC_017474	GAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821703
43	NC_017474	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821703
44	NC_017474	TGC	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821704
45	NC_017474	ACA	2	6	3856	3861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821704
46	NC_017474	TCA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821704
47	NC_017474	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821704
48	NC_017474	GCG	2	6	4191	4196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821704
49	NC_017474	AGC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821704
50	NC_017474	AGC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821704
51	NC_017474	ATC	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821704
52	NC_017474	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821704
53	NC_017474	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821704
54	NC_017474	AGC	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821704
55	NC_017474	GAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821704
56	NC_017474	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821704
57	NC_017474	CAA	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821704
58	NC_017474	CAC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821704
59	NC_017474	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821704
60	NC_017474	ACC	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821704
61	NC_017474	ATC	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821704
62	NC_017474	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821704
63	NC_017474	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017474	AGG	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017474	GGC	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
66	NC_017474	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
67	NC_017474	AGC	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821705
68	NC_017474	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821705
69	NC_017474	TGA	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
70	NC_017474	ATA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821705
71	NC_017474	GGT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
72	NC_017474	CGG	4	12	5396	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
73	NC_017474	GTG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
74	NC_017474	TAC	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821705
75	NC_017474	GAT	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
76	NC_017474	ACC	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821705
77	NC_017474	GGC	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
78	NC_017474	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821705
79	NC_017474	CAA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821705
80	NC_017474	GGC	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
81	NC_017474	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
82	NC_017474	GAT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821705
83	NC_017474	CGG	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
84	NC_017474	GGT	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
85	NC_017474	GGC	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821705
86	NC_017474	ACA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821705
87	NC_017474	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821705
88	NC_017474	TCG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821705
89	NC_017474	TGG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821705
90	NC_017474	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821705
91	NC_017474	TTG	2	6	6618	6623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821705
92	NC_017474	GCC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821705
93	NC_017474	GAA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821705
94	NC_017474	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821705
95	NC_017474	GAC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821705
96	NC_017474	AAC	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821705
97	NC_017474	GAG	2	6	7051	7056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017474	GAT	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821706
99	NC_017474	CGG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821706
100	NC_017474	AAG	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821706
101	NC_017474	TTG	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821706
102	NC_017474	TGC	2	6	7472	7477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821706
103	NC_017474	CAA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821706
104	NC_017474	ATG	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821706
105	NC_017474	GTT	2	6	7540	7545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821706
106	NC_017474	TTG	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821706
107	NC_017474	GAC	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821706
108	NC_017474	CCG	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821706
109	NC_017474	CGG	2	6	7728	7733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821706
110	NC_017474	TGG	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821706
111	NC_017474	ATC	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821706
112	NC_017474	TCG	2	6	8154	8159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821706
113	NC_017474	TGA	2	6	8238	8243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821706
114	NC_017474	ATC	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821706
115	NC_017474	AGC	2	6	8412	8417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821706
116	NC_017474	TCA	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821706
117	NC_017474	ATC	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821706
118	NC_017474	AGA	2	6	8495	8500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821706
119	NC_017474	AAG	2	6	8576	8581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821706
120	NC_017474	TCA	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821706
121	NC_017474	ATG	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821706
122	NC_017474	ATG	2	6	8729	8734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821706
123	NC_017474	CTT	2	6	8742	8747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821706
124	NC_017474	CAA	2	6	8751	8756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821706
125	NC_017474	GCA	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821706
126	NC_017474	ATG	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821706
127	NC_017474	TCT	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821706
128	NC_017474	GTT	2	6	8932	8937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821706
129	NC_017474	GCA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821706
130	NC_017474	AAT	2	6	9019	9024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821706
131	NC_017474	GAC	2	6	9454	9459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821706
132	NC_017474	CGA	2	6	9501	9506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821706
133	NC_017474	GCA	2	6	9518	9523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821706
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259	NC_017474	TAC	2	6	17828	17833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821715
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261	NC_017474	AAG	2	6	17872	17877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_017474	AGC	2	6	20203	20208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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384	NC_017474	ATG	2	6	26842	26847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821725
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499	NC_017474	CAT	2	6	34905	34910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821734
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