MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 5392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017474	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017474	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017474	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017474	AGG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017474	CAA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017474	TGA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017474	ATA	3	9	2861	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017474	GAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017474	TAG	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017474	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017474	ATA	3	9	3077	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017474	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017474	AGT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017474	GAC	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017474	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017474	AGG	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017474	GAG	2	6	7051	7056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017474	TAA	2	6	9693	9698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017474	TCC	2	6	10506	10511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017474	AGA	2	6	10604	10609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017474	TGC	2	6	10644	10649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017474	AGG	2	6	10668	10673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017474	CGC	2	6	11124	11129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017474	AGG	2	6	11226	11231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017474	GGA	2	6	12239	12244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017474	ATT	2	6	12542	12547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017474	AGA	2	6	12612	12617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017474	GAA	2	6	12681	12686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017474	TAG	2	6	12745	12750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017474	TAA	2	6	12826	12831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017474	TGT	2	6	12841	12846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017474	GGA	2	6	12874	12879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017474	ATA	2	6	14606	14611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017474	CAA	2	6	14719	14724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017474	GGT	2	6	14751	14756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017474	AAT	2	6	15066	15071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017474	AGC	2	6	15237	15242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017474	ATT	2	6	15344	15349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017474	GCG	3	9	17861	17869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017474	AAG	2	6	17872	17877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017474	GAA	2	6	18856	18861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017474	CAT	2	6	18945	18950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017474	TTG	2	6	18951	18956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017474	TAA	2	6	19017	19022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017474	AAC	2	6	19079	19084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017474	ATT	2	6	19138	19143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017474	CAA	2	6	20123	20128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017474	AGC	2	6	20203	20208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017474	TTC	2	6	21235	21240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017474	CCT	2	6	21683	21688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017474	GAT	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017474	CAG	3	9	21921	21929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017474	CCT	2	6	22038	22043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017474	CTT	2	6	22095	22100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017474	TGA	2	6	23554	23559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017474	GAC	2	6	23586	23591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017474	CCT	2	6	26906	26911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017474	ATG	2	6	27160	27165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017474	GGA	2	6	27169	27174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017474	ATA	2	6	27756	27761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017474	AGA	2	6	28986	28991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017474	GTT	2	6	29051	29056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017474	CCT	2	6	30256	30261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017474	TAT	2	6	32433	32438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017474	CTC	2	6	33379	33384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017474	GAA	2	6	33543	33548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017474	AAT	2	6	34167	34172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017474	AGC	2	6	35215	35220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017474	CAA	2	6	35909	35914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017474	TCA	2	6	37553	37558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017474	CAT	2	6	38659	38664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017474	AAG	2	6	40191	40196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017474	TCA	2	6	40240	40245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017474	AGC	2	6	41018	41023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017474	TAG	2	6	41367	41372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017474	ACA	2	6	41387	41392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017474	TAA	2	6	41396	41401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017474	TAA	2	6	41419	41424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017474	TGG	2	6	41498	41503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017474	ATT	2	6	41509	41514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017474	AAG	2	6	41726	41731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017474	CTT	2	6	41763	41768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017474	TGA	2	6	41814	41819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017474	CAA	2	6	42677	42682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017474	GGA	2	6	43420	43425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017474	TGA	2	6	43463	43468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017474	GTT	2	6	43503	43508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017474	ATG	2	6	43583	43588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017474	ATA	2	6	43589	43594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017474	TGA	2	6	43637	43642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017474	GAT	2	6	43650	43655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017474	CTT	3	9	43723	43731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017474	GAG	2	6	43779	43784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017474	AGA	2	6	43858	43863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017474	GGT	2	6	43873	43878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017474	TGC	3	9	43937	43945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017474	TCT	2	6	43951	43956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017474	ATG	2	6	43974	43979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017474	TAT	2	6	45738	45743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017474	CAA	2	6	45766	45771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017474	AAT	2	6	46262	46267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017474	ACC	2	6	46330	46335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017474	AAC	2	6	46354	46359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017474	CGT	2	6	46417	46422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017474	GAT	2	6	46443	46448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017474	TTA	2	6	47575	47580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017474	CTG	2	6	48544	48549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017474	AGC	2	6	50075	50080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017474	TAT	2	6	50096	50101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017474	AAT	2	6	50107	50112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017474	AGC	2	6	50152	50157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017474	AGA	2	6	51334	51339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017474	GCT	2	6	51738	51743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017474	GCT	2	6	52266	52271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017474	ATT	2	6	52272	52277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017474	GGA	2	6	53258	53263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017474	ATT	2	6	55033	55038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017474	CAT	2	6	55161	55166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017474	CTG	2	6	56639	56644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017474	GCT	2	6	56716	56721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017474	TAA	2	6	56722	56727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017474	TTA	2	6	57104	57109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017474	CAA	2	6	57157	57162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017474	CTC	2	6	61176	61181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017474	TGT	2	6	61267	61272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017474	AAG	2	6	61293	61298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017474	CCA	2	6	61339	61344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017474	ACA	2	6	61389	61394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017474	TTG	2	6	61781	61786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017474	GAC	2	6	61845	61850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017474	TCC	2	6	65391	65396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017474	TGA	2	6	65573	65578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017474	AAT	2	6	65593	65598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017474	AAC	2	6	65728	65733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017474	TGT	2	6	65757	65762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017474	CAT	2	6	66707	66712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017474	ATC	2	6	66962	66967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017474	CAT	3	9	66980	66988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017474	AGA	2	6	67009	67014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017474	ACT	2	6	67017	67022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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