MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 2797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017474	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017474	CA	3	6	752	757	50 %	0 %	0 %	50 %	385821701
3	NC_017474	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	385821701
4	NC_017474	AG	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017474	AT	3	6	3033	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017474	AT	3	6	3094	3099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017474	CT	3	6	4111	4116	0 %	50 %	0 %	50 %	385821704
8	NC_017474	GC	4	8	4384	4391	0 %	0 %	50 %	50 %	385821704
9	NC_017474	GC	3	6	4558	4563	0 %	0 %	50 %	50 %	385821704
10	NC_017474	GC	3	6	5714	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	385821705
11	NC_017474	AT	3	6	6725	6730	50 %	50 %	0 %	0 %	385821705
12	NC_017474	AT	3	6	7863	7868	50 %	50 %	0 %	0 %	385821706
13	NC_017474	GC	3	6	9825	9830	0 %	0 %	50 %	50 %	385821707
14	NC_017474	TG	3	6	10452	10457	0 %	50 %	50 %	0 %	385821707
15	NC_017474	GT	3	6	10831	10836	0 %	50 %	50 %	0 %	385821708
16	NC_017474	TG	3	6	11718	11723	0 %	50 %	50 %	0 %	385821710
17	NC_017474	AT	3	6	12319	12324	50 %	50 %	0 %	0 %	385821711
18	NC_017474	TA	3	6	12819	12824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017474	GA	3	6	13136	13141	50 %	0 %	50 %	0 %	385821712
20	NC_017474	AT	3	6	13410	13415	50 %	50 %	0 %	0 %	385821712
21	NC_017474	TA	3	6	14615	14620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017474	TA	3	6	15284	15289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017474	CA	3	6	16240	16245	50 %	0 %	0 %	50 %	385821714
24	NC_017474	TC	3	6	18919	18924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017474	TG	3	6	19023	19028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017474	GT	3	6	19466	19471	0 %	50 %	50 %	0 %	385821718
27	NC_017474	AT	3	6	19645	19650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017474	AC	3	6	19689	19694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017474	AC	3	6	20923	20928	50 %	0 %	0 %	50 %	385821720
30	NC_017474	TA	3	6	21786	21791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017474	GA	3	6	24199	24204	50 %	0 %	50 %	0 %	385821724
32	NC_017474	GC	3	6	25062	25067	0 %	0 %	50 %	50 %	385821724
33	NC_017474	GC	3	6	25112	25117	0 %	0 %	50 %	50 %	385821724
34	NC_017474	AT	3	6	26890	26895	50 %	50 %	0 %	0 %	385821725
35	NC_017474	TG	3	6	26930	26935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017474	TG	3	6	28091	28096	0 %	50 %	50 %	0 %	385821727
37	NC_017474	GT	3	6	29316	29321	0 %	50 %	50 %	0 %	385821729
38	NC_017474	TC	3	6	29825	29830	0 %	50 %	0 %	50 %	385821730
39	NC_017474	TA	3	6	30129	30134	50 %	50 %	0 %	0 %	385821730
40	NC_017474	AT	3	6	31150	31155	50 %	50 %	0 %	0 %	385821731
41	NC_017474	AT	3	6	31375	31380	50 %	50 %	0 %	0 %	385821731
42	NC_017474	TG	3	6	32442	32447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017474	AC	3	6	33461	33466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017474	CG	3	6	34003	34008	0 %	0 %	50 %	50 %	385821733
45	NC_017474	TG	3	6	34601	34606	0 %	50 %	50 %	0 %	385821734
46	NC_017474	GT	3	6	34736	34741	0 %	50 %	50 %	0 %	385821734
47	NC_017474	CT	3	6	35027	35032	0 %	50 %	0 %	50 %	385821734
48	NC_017474	CG	3	6	35139	35144	0 %	0 %	50 %	50 %	385821734
49	NC_017474	CA	3	6	36088	36093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017474	TC	3	6	36768	36773	0 %	50 %	0 %	50 %	385821736
51	NC_017474	TA	3	6	37605	37610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017474	AG	3	6	38052	38057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017474	CT	3	6	38641	38646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017474	CG	3	6	40108	40113	0 %	0 %	50 %	50 %	385821739
55	NC_017474	TA	3	6	41461	41466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017474	AT	3	6	42800	42805	50 %	50 %	0 %	0 %	385821744
57	NC_017474	GA	4	8	45494	45501	50 %	0 %	50 %	0 %	385821747
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59	NC_017474	TA	3	6	48579	48584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017474	AT	3	6	50115	50120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017474	TC	3	6	50263	50268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017474	CA	3	6	52364	52369	50 %	0 %	0 %	50 %	385821756
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66	NC_017474	GA	3	6	57237	57242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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68	NC_017474	CT	3	6	60432	60437	0 %	50 %	0 %	50 %	385821760
69	NC_017474	CT	3	6	60821	60826	0 %	50 %	0 %	50 %	385821761
70	NC_017474	AT	3	6	61202	61207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017474	TA	3	6	61873	61878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017474	TG	3	6	65094	65099	0 %	50 %	50 %	0 %	385821766
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75	NC_017474	TA	3	6	66435	66440	50 %	50 %	0 %	0 %	385821767
76	NC_017474	AG	3	6	66874	66879	50 %	0 %	50 %	0 %	385821768
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83	NC_017474	CT	3	6	76402	76407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017474	GC	3	6	76410	76415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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106	NC_017474	CG	3	6	97286	97291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017474	GC	3	6	97911	97916	0 %	0 %	50 %	50 %	385821799
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109	NC_017474	AT	3	6	101690	101695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_017474	AT	3	6	102525	102530	50 %	50 %	0 %	0 %	385821805
112	NC_017474	TA	3	6	102815	102820	50 %	50 %	0 %	0 %	385821805
113	NC_017474	AT	3	6	103290	103295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017474	AT	3	6	103419	103424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017474	CA	3	6	105453	105458	50 %	0 %	0 %	50 %	385821808
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119	NC_017474	AT	3	6	111984	111989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017474	CG	3	6	112119	112124	0 %	0 %	50 %	50 %	385821813
121	NC_017474	GC	3	6	112318	112323	0 %	0 %	50 %	50 %	385821813
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124	NC_017474	CA	3	6	114302	114307	50 %	0 %	0 %	50 %	385821814
125	NC_017474	CA	3	6	114359	114364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017474	CG	3	6	117245	117250	0 %	0 %	50 %	50 %	385821817
127	NC_017474	TG	3	6	117734	117739	0 %	50 %	50 %	0 %	385821817
128	NC_017474	CG	3	6	117744	117749	0 %	0 %	50 %	50 %	385821817
129	NC_017474	TA	3	6	119545	119550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017474	GC	3	6	120301	120306	0 %	0 %	50 %	50 %	385821820
131	NC_017474	AC	3	6	121685	121690	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017474	TA	3	6	121691	121696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017474	GT	3	6	124399	124404	0 %	50 %	50 %	0 %	385821823
134	NC_017474	AG	3	6	125374	125379	50 %	0 %	50 %	0 %	385821824
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136	NC_017474	AT	3	6	129892	129897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017474	AG	3	6	132174	132179	50 %	0 %	50 %	0 %	385821830
138	NC_017474	TG	3	6	134469	134474	0 %	50 %	50 %	0 %	385821833
139	NC_017474	AT	3	6	135666	135671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_017474	TG	3	6	139129	139134	0 %	50 %	50 %	0 %	385821839
144	NC_017474	AT	3	6	139555	139560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017474	AT	3	6	139596	139601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017474	CA	3	6	141205	141210	50 %	0 %	0 %	50 %	385821842
147	NC_017474	GC	3	6	141315	141320	0 %	0 %	50 %	50 %	385821842
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