MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 1917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017473	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	385818535
2	NC_017473	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017473	CAACG	2	10	1771	1780	40 %	0 %	20 %	40 %	385818536
4	NC_017473	GAAGA	2	10	5070	5079	60 %	0 %	40 %	0 %	385818541
5	NC_017473	GGCAC	2	10	5556	5565	20 %	0 %	40 %	40 %	385818541
6	NC_017473	GACAA	2	10	5830	5839	60 %	0 %	20 %	20 %	385818541
7	NC_017473	GAAAA	2	10	7915	7924	80 %	0 %	20 %	0 %	385818542
8	NC_017473	GACAA	2	10	9041	9050	60 %	0 %	20 %	20 %	385818542
9	NC_017473	CATTT	2	10	10155	10164	20 %	60 %	0 %	20 %	385818543
10	NC_017473	GTCGA	2	10	14527	14536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017473	CAAAA	2	10	14937	14946	80 %	0 %	0 %	20 %	385818549
12	NC_017473	ATTGA	2	10	20035	20044	40 %	40 %	20 %	0 %	385818555
13	NC_017473	CAACC	2	10	21362	21371	40 %	0 %	0 %	60 %	385818557
14	NC_017473	TGGCT	2	10	22959	22968	0 %	40 %	40 %	20 %	385818559
15	NC_017473	GCTTT	2	10	24511	24520	0 %	60 %	20 %	20 %	385818560
16	NC_017473	CAGCG	2	10	25158	25167	20 %	0 %	40 %	40 %	385818560
17	NC_017473	GCCCG	2	10	26062	26071	0 %	0 %	40 %	60 %	385818560
18	NC_017473	GTTTT	2	10	27130	27139	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017473	TCCTG	2	10	28083	28092	0 %	40 %	20 %	40 %	385818563
20	NC_017473	GGCTA	2	10	28576	28585	20 %	20 %	40 %	20 %	385818563
21	NC_017473	TTGTT	2	10	28872	28881	0 %	80 %	20 %	0 %	385818564
22	NC_017473	AAGCC	2	10	33296	33305	40 %	0 %	20 %	40 %	385818568
23	NC_017473	CAAAG	2	10	34144	34153	60 %	0 %	20 %	20 %	385818569
24	NC_017473	TTCTT	2	10	34193	34202	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017473	TTTCT	2	10	41215	41224	0 %	80 %	0 %	20 %	385818577
26	NC_017473	GAAAG	2	10	43525	43534	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017473	GTTTG	2	10	44524	44533	0 %	60 %	40 %	0 %	385818581
28	NC_017473	TAAAG	2	10	45271	45280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017473	GAAAA	2	10	46873	46882	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017473	TTGAA	2	10	47298	47307	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017473	ATAAA	2	10	47444	47453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017473	AATAA	2	10	47690	47699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017473	TCAAT	2	10	48309	48318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017473	AACGC	2	10	50194	50203	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017473	ATGAA	2	10	50627	50636	60 %	20 %	20 %	0 %	385818582
36	NC_017473	ACAAA	2	10	52156	52165	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017473	TTTCT	2	10	52790	52799	0 %	80 %	0 %	20 %	385818584
38	NC_017473	TCGTT	2	10	53187	53196	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017473	TTCTT	2	10	53738	53747	0 %	80 %	0 %	20 %	385818585
40	NC_017473	TGTTT	2	10	56892	56901	0 %	80 %	20 %	0 %	385818587
41	NC_017473	GCGCC	2	10	58396	58405	0 %	0 %	40 %	60 %	385818588
42	NC_017473	CAGTT	2	10	60868	60877	20 %	40 %	20 %	20 %	385818589
43	NC_017473	TTGAT	2	10	67902	67911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017473	TTGCT	2	10	67995	68004	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017473	CGTTT	2	10	69895	69904	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017473	TAAGT	2	10	73754	73763	40 %	40 %	20 %	0 %	385818597
47	NC_017473	TCATC	2	10	75303	75312	20 %	40 %	0 %	40 %	385818599
48	NC_017473	AAAGC	2	10	76770	76779	60 %	0 %	20 %	20 %	385818601
49	NC_017473	AGTTG	2	10	77286	77295	20 %	40 %	40 %	0 %	385818601
50	NC_017473	GTATT	2	10	77516	77525	20 %	60 %	20 %	0 %	385818601
51	NC_017473	CGGCC	2	10	80069	80078	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_017473	GAAGC	2	10	82300	82309	40 %	0 %	40 %	20 %	385818606
53	NC_017473	TGGCA	2	10	82467	82476	20 %	20 %	40 %	20 %	385818606
54	NC_017473	GTTTC	2	10	85248	85257	0 %	60 %	20 %	20 %	385818609
55	NC_017473	TGTGC	2	10	86374	86383	0 %	40 %	40 %	20 %	385818610
56	NC_017473	TGCTT	2	10	87445	87454	0 %	60 %	20 %	20 %	385818611
57	NC_017473	ATCCA	2	10	87908	87917	40 %	20 %	0 %	40 %	385818612
58	NC_017473	AACCA	2	10	88283	88292	60 %	0 %	0 %	40 %	385818612
59	NC_017473	AAAAT	2	10	88861	88870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017473	GTTAA	2	10	88882	88891	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017473	TGAAT	2	10	90867	90876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017473	TAGTT	2	10	91782	91791	20 %	60 %	20 %	0 %	385818616
63	NC_017473	AGATA	2	10	94072	94081	60 %	20 %	20 %	0 %	385818617
64	NC_017473	CCAAC	2	10	94531	94540	40 %	0 %	0 %	60 %	385818618
65	NC_017473	TCCCA	2	10	95578	95587	20 %	20 %	0 %	60 %	385818619
66	NC_017473	CCCAG	2	10	96211	96220	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_017473	GCTTT	2	10	99219	99228	0 %	60 %	20 %	20 %	385818622
68	NC_017473	ATTGA	2	10	102473	102482	40 %	40 %	20 %	0 %	385818624
69	NC_017473	CAAAA	2	10	105148	105157	80 %	0 %	0 %	20 %	385818629
70	NC_017473	ATTTC	2	10	105674	105683	20 %	60 %	0 %	20 %	385818629
71	NC_017473	ATGGC	2	10	107390	107399	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017473	GAAGA	2	10	109736	109745	60 %	0 %	40 %	0 %	385818633
73	NC_017473	GAAAA	2	10	109754	109763	80 %	0 %	20 %	0 %	385818633
74	NC_017473	CAAAG	2	10	109820	109829	60 %	0 %	20 %	20 %	385818633
75	NC_017473	CGGCC	2	10	113527	113536	0 %	0 %	40 %	60 %	385818636
76	NC_017473	CTCAA	2	10	114110	114119	40 %	20 %	0 %	40 %	385818636
77	NC_017473	ACCAA	2	10	114381	114390	60 %	0 %	0 %	40 %	385818636
78	NC_017473	CAAGT	2	10	115341	115350	40 %	20 %	20 %	20 %	385818637
79	NC_017473	GACCC	2	10	116789	116798	20 %	0 %	20 %	60 %	385818638
80	NC_017473	ACCAA	2	10	117377	117386	60 %	0 %	0 %	40 %	385818639
81	NC_017473	TTGGC	2	10	118893	118902	0 %	40 %	40 %	20 %	385818639
82	NC_017473	GAAAA	2	10	122297	122306	80 %	0 %	20 %	0 %	385818643
83	NC_017473	TCAAA	2	10	126868	126877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017473	ATTGC	2	10	129358	129367	20 %	40 %	20 %	20 %	385818650
85	NC_017473	TGATC	2	10	130188	130197	20 %	40 %	20 %	20 %	385818651
86	NC_017473	CATGC	2	10	131318	131327	20 %	20 %	20 %	40 %	385818652
87	NC_017473	CGATC	2	10	138069	138078	20 %	20 %	20 %	40 %	385818659
88	NC_017473	AAAGC	2	10	144023	144032	60 %	0 %	20 %	20 %	385818667
89	NC_017473	CATAA	2	10	144092	144101	60 %	20 %	0 %	20 %	385818667
90	NC_017473	GGGAT	2	10	145185	145194	20 %	20 %	60 %	0 %	385818668
91	NC_017473	GCTCA	2	10	145520	145529	20 %	20 %	20 %	40 %	385818668
92	NC_017473	GTCAT	2	10	147463	147472	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017473	TTTTC	2	10	149499	149508	0 %	80 %	0 %	20 %	385818672
94	NC_017473	CAAGC	2	10	150889	150898	40 %	0 %	20 %	40 %	385818673
95	NC_017473	AATGA	2	10	152189	152198	60 %	20 %	20 %	0 %	385818674
96	NC_017473	CCAAC	2	10	152757	152766	40 %	0 %	0 %	60 %	385818675
97	NC_017473	GCCTT	2	10	154649	154658	0 %	40 %	20 %	40 %	385818677
98	NC_017473	GAGGC	2	10	157473	157482	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017473	GTAAG	2	10	158785	158794	40 %	20 %	40 %	0 %	385818681
100	NC_017473	CACAA	2	10	160219	160228	60 %	0 %	0 %	40 %	385818682
101	NC_017473	TGAAT	2	10	162208	162217	40 %	40 %	20 %	0 %	385818684
102	NC_017473	ATCAA	2	10	163660	163669	60 %	20 %	0 %	20 %	385818686
103	NC_017473	CCGTT	2	10	167879	167888	0 %	40 %	20 %	40 %	385818690
104	NC_017473	CCAAC	2	10	170288	170297	40 %	0 %	0 %	60 %	385818692
105	NC_017473	GAACC	2	10	171539	171548	40 %	0 %	20 %	40 %	385818692
106	NC_017473	TGAAG	2	10	172937	172946	40 %	20 %	40 %	0 %	385818693
107	NC_017473	CAGCC	2	10	173849	173858	20 %	0 %	20 %	60 %	385818693
108	NC_017473	GTTCA	2	10	173929	173938	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017473	CAATG	2	10	174217	174226	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017473	TGGTT	2	10	175167	175176	0 %	60 %	40 %	0 %	385818696
111	NC_017473	CTGAA	2	10	177047	177056	40 %	20 %	20 %	20 %	385818698
112	NC_017473	GTTGA	2	10	179325	179334	20 %	40 %	40 %	0 %	385818699
113	NC_017473	TCGAT	2	10	180852	180861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017473	CGTTG	2	10	181550	181559	0 %	40 %	40 %	20 %	385818701
115	NC_017473	AGATG	2	10	182526	182535	40 %	20 %	40 %	0 %	385818702
116	NC_017473	AAGGT	2	10	184738	184747	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017473	TTCAT	2	10	185013	185022	20 %	60 %	0 %	20 %	385818706
118	NC_017473	TGAGG	2	10	185214	185223	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017473	AAATG	2	10	186178	186187	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017473	GGCAT	2	10	187829	187838	20 %	20 %	40 %	20 %	385818711
121	NC_017473	TCGTT	2	10	188246	188255	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017473	CGGCA	2	10	188433	188442	20 %	0 %	40 %	40 %	385818712
123	NC_017473	GCCAA	2	10	193419	193428	40 %	0 %	20 %	40 %	385818720
124	NC_017473	CTGGG	2	10	196185	196194	0 %	20 %	60 %	20 %	385818724
125	NC_017473	ACTTC	2	10	198347	198356	20 %	40 %	0 %	40 %	385818726
126	NC_017473	GTAGA	2	10	198747	198756	40 %	20 %	40 %	0 %	385818727
127	NC_017473	GCTTG	2	10	200552	200561	0 %	40 %	40 %	20 %	385818729
128	NC_017473	CGTCA	2	10	204515	204524	20 %	20 %	20 %	40 %	385818733
129	NC_017473	TCAAT	2	10	204639	204648	40 %	40 %	0 %	20 %	385818733
130	NC_017473	AAATC	2	10	211520	211529	60 %	20 %	0 %	20 %	385818739
131	NC_017473	TGGAA	2	10	212585	212594	40 %	20 %	40 %	0 %	385818740
132	NC_017473	CAGAA	2	10	213089	213098	60 %	0 %	20 %	20 %	385818740
133	NC_017473	ATTTG	2	10	216314	216323	20 %	60 %	20 %	0 %	385818743
134	NC_017473	AAATG	2	10	219743	219752	60 %	20 %	20 %	0 %	385818745
135	NC_017473	CAAAA	2	10	220263	220272	80 %	0 %	0 %	20 %	385818745
136	NC_017473	ACTGG	2	10	220455	220464	20 %	20 %	40 %	20 %	385818746
137	NC_017473	CCATG	2	10	221659	221668	20 %	20 %	20 %	40 %	385818747
138	NC_017473	GAGTC	2	10	223425	223434	20 %	20 %	40 %	20 %	385818749
139	NC_017473	ACTCA	2	10	224398	224407	40 %	20 %	0 %	40 %	385818750
140	NC_017473	ATTTG	2	10	225044	225053	20 %	60 %	20 %	0 %	385818751
141	NC_017473	TTTGA	2	10	228937	228946	20 %	60 %	20 %	0 %	385818753
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143	NC_017473	ATTTG	2	10	233672	233681	20 %	60 %	20 %	0 %	385818758
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146	NC_017473	GAAGC	2	10	235750	235759	40 %	0 %	40 %	20 %	385818759
147	NC_017473	CTGGA	2	10	238850	238859	20 %	20 %	40 %	20 %	385818761
148	NC_017473	GTTGT	2	10	242798	242807	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017473	AGTTG	2	10	243239	243248	20 %	40 %	40 %	0 %	385818766
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151	NC_017473	TGATT	2	10	244018	244027	20 %	60 %	20 %	0 %	385818767
152	NC_017473	TGTCA	2	10	244262	244271	20 %	40 %	20 %	20 %	385818767
153	NC_017473	TGATC	2	10	248066	248075	20 %	40 %	20 %	20 %	385818770
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160	NC_017473	AGATC	2	10	257117	257126	40 %	20 %	20 %	20 %	385818778
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164	NC_017473	TCGCA	2	10	260606	260615	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_017473	GAGAT	2	10	263432	263441	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_017473	ATCAA	2	10	363116	363125	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_017473	CAAAA	2	10	417273	417282	80 %	0 %	0 %	20 %	385818949
267	NC_017473	CAGTT	2	10	419212	419221	20 %	40 %	20 %	20 %	385818951
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