MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 7760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017473	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	385818535
2	NC_017473	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	385818535
3	NC_017473	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	385818535
4	NC_017473	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	385818535
5	NC_017473	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	385818535
6	NC_017473	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	385818535
7	NC_017473	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	385818535
8	NC_017473	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	385818535
9	NC_017473	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	385818535
10	NC_017473	ACGT	2	8	2961	2968	25 %	25 %	25 %	25 %	385818537
11	NC_017473	TAAT	2	8	3513	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017473	GGCC	2	8	3772	3779	0 %	0 %	50 %	50 %	385818538
13	NC_017473	AATC	2	8	3923	3930	50 %	25 %	0 %	25 %	385818539
14	NC_017473	TGAC	2	8	4343	4350	25 %	25 %	25 %	25 %	385818539
15	NC_017473	AAGA	2	8	5055	5062	75 %	0 %	25 %	0 %	385818541
16	NC_017473	CCAG	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	385818541
17	NC_017473	GCTG	2	8	5237	5244	0 %	25 %	50 %	25 %	385818541
18	NC_017473	CCTG	2	8	6302	6309	0 %	25 %	25 %	50 %	385818541
19	NC_017473	TGTT	2	8	6976	6983	0 %	75 %	25 %	0 %	385818541
20	NC_017473	ATGA	2	8	7225	7232	50 %	25 %	25 %	0 %	385818542
21	NC_017473	GATT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	25 %	0 %	385818542
22	NC_017473	CGGT	2	8	7595	7602	0 %	25 %	50 %	25 %	385818542
23	NC_017473	CTTG	2	8	8832	8839	0 %	50 %	25 %	25 %	385818542
24	NC_017473	ACGG	2	8	9234	9241	25 %	0 %	50 %	25 %	385818542
25	NC_017473	TTTG	2	8	9774	9781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017473	TTTC	2	8	9962	9969	0 %	75 %	0 %	25 %	385818543
27	NC_017473	GACA	2	8	10133	10140	50 %	0 %	25 %	25 %	385818543
28	NC_017473	ATCA	2	8	10458	10465	50 %	25 %	0 %	25 %	385818543
29	NC_017473	GCAA	2	8	10590	10597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017473	TTGG	2	8	10984	10991	0 %	50 %	50 %	0 %	385818544
31	NC_017473	CGTA	2	8	11805	11812	25 %	25 %	25 %	25 %	385818546
32	NC_017473	AACC	2	8	11973	11980	50 %	0 %	0 %	50 %	385818546
33	NC_017473	AAGA	2	8	12486	12493	75 %	0 %	25 %	0 %	385818547
34	NC_017473	ATTA	2	8	12658	12665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017473	TTGG	2	8	12999	13006	0 %	50 %	50 %	0 %	385818548
36	NC_017473	AGTT	2	8	13382	13389	25 %	50 %	25 %	0 %	385818548
37	NC_017473	AAAG	2	8	13720	13727	75 %	0 %	25 %	0 %	385818548
38	NC_017473	TTTA	2	8	14043	14050	25 %	75 %	0 %	0 %	385818548
39	NC_017473	GCAG	2	8	14070	14077	25 %	0 %	50 %	25 %	385818548
40	NC_017473	TTTC	2	8	14240	14247	0 %	75 %	0 %	25 %	385818548
41	NC_017473	GATT	2	8	14918	14925	25 %	50 %	25 %	0 %	385818549
42	NC_017473	AACG	2	8	15202	15209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017473	GCTG	2	8	15396	15403	0 %	25 %	50 %	25 %	385818550
44	NC_017473	CAAT	2	8	15836	15843	50 %	25 %	0 %	25 %	385818550
45	NC_017473	ACTT	2	8	16276	16283	25 %	50 %	0 %	25 %	385818550
46	NC_017473	CTGG	2	8	16580	16587	0 %	25 %	50 %	25 %	385818550
47	NC_017473	TTCT	2	8	17123	17130	0 %	75 %	0 %	25 %	385818551
48	NC_017473	CAAT	2	8	17161	17168	50 %	25 %	0 %	25 %	385818551
49	NC_017473	ACAA	2	8	18416	18423	75 %	0 %	0 %	25 %	385818553
50	NC_017473	AAAG	2	8	18594	18601	75 %	0 %	25 %	0 %	385818553
51	NC_017473	TGTT	2	8	18813	18820	0 %	75 %	25 %	0 %	385818553
52	NC_017473	AAGC	2	8	18872	18879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017473	GACT	2	8	19170	19177	25 %	25 %	25 %	25 %	385818554
54	NC_017473	AAAC	2	8	19256	19263	75 %	0 %	0 %	25 %	385818554
55	NC_017473	TAAT	2	8	19639	19646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017473	CGTT	2	8	20293	20300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017473	ATAA	2	8	20484	20491	75 %	25 %	0 %	0 %	385818556
58	NC_017473	AGCT	2	8	21732	21739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017473	CGAG	2	8	21942	21949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017473	GGGT	2	8	22159	22166	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017473	GACT	2	8	22471	22478	25 %	25 %	25 %	25 %	385818559
62	NC_017473	CAAC	2	8	22752	22759	50 %	0 %	0 %	50 %	385818559
63	NC_017473	CAAA	2	8	24428	24435	75 %	0 %	0 %	25 %	385818560
64	NC_017473	AGAC	2	8	24747	24754	50 %	0 %	25 %	25 %	385818560
65	NC_017473	AAGA	2	8	25170	25177	75 %	0 %	25 %	0 %	385818560
66	NC_017473	CTGC	2	8	25937	25944	0 %	25 %	25 %	50 %	385818560
67	NC_017473	TAGT	2	8	26171	26178	25 %	50 %	25 %	0 %	385818560
68	NC_017473	AGCC	2	8	26570	26577	25 %	0 %	25 %	50 %	385818561
69	NC_017473	TTAC	2	8	27326	27333	25 %	50 %	0 %	25 %	385818562
70	NC_017473	TGGT	2	8	27432	27439	0 %	50 %	50 %	0 %	385818562
71	NC_017473	AATT	2	8	27788	27795	50 %	50 %	0 %	0 %	385818563
72	NC_017473	AATT	2	8	28004	28011	50 %	50 %	0 %	0 %	385818563
73	NC_017473	ATTT	2	8	28222	28229	25 %	75 %	0 %	0 %	385818563
74	NC_017473	ATTG	2	8	28768	28775	25 %	50 %	25 %	0 %	385818564
75	NC_017473	GGTT	2	8	28926	28933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017473	CATA	2	8	28972	28979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017473	AGTG	2	8	29118	29125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017473	AACA	2	8	29925	29932	75 %	0 %	0 %	25 %	385818566
79	NC_017473	AATG	2	8	30277	30284	50 %	25 %	25 %	0 %	385818567
80	NC_017473	TACA	2	8	31131	31138	50 %	25 %	0 %	25 %	385818567
81	NC_017473	TTGC	2	8	31827	31834	0 %	50 %	25 %	25 %	385818567
82	NC_017473	CAAA	2	8	32016	32023	75 %	0 %	0 %	25 %	385818567
83	NC_017473	CTAC	2	8	32207	32214	25 %	25 %	0 %	50 %	385818567
84	NC_017473	GTGC	2	8	32974	32981	0 %	25 %	50 %	25 %	385818568
85	NC_017473	GCAA	2	8	33268	33275	50 %	0 %	25 %	25 %	385818568
86	NC_017473	ATTT	2	8	33927	33934	25 %	75 %	0 %	0 %	385818569
87	NC_017473	ATGA	2	8	34207	34214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017473	AGCA	2	8	34816	34823	50 %	0 %	25 %	25 %	385818570
89	NC_017473	AAGC	2	8	35973	35980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017473	TTCA	2	8	37153	37160	25 %	50 %	0 %	25 %	385818572
91	NC_017473	AGCA	2	8	37479	37486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017473	ATTT	2	8	37527	37534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017473	AAAC	2	8	38564	38571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017473	GTAT	2	8	38871	38878	25 %	50 %	25 %	0 %	385818575
95	NC_017473	GATT	2	8	39306	39313	25 %	50 %	25 %	0 %	385818575
96	NC_017473	AAGG	2	8	39388	39395	50 %	0 %	50 %	0 %	385818575
97	NC_017473	GCCG	2	8	39958	39965	0 %	0 %	50 %	50 %	385818575
98	NC_017473	AGAA	2	8	40297	40304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017473	TACT	2	8	42191	42198	25 %	50 %	0 %	25 %	385818579
100	NC_017473	TATT	2	8	43437	43444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017473	CTTT	2	8	43676	43683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017473	TCTT	2	8	43768	43775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017473	ATGA	2	8	44101	44108	50 %	25 %	25 %	0 %	385818581
104	NC_017473	TCAT	2	8	45648	45655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017473	ATCC	2	8	46084	46091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017473	GTCA	2	8	46471	46478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017473	AATG	2	8	46702	46709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017473	TAAT	2	8	46842	46849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017473	GAAA	2	8	47083	47090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017473	AAAT	2	8	47124	47131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017473	CAAA	2	8	47322	47329	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017473	AAAG	2	8	47380	47387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017473	CAAA	2	8	47705	47712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017473	ATCG	2	8	49486	49493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017473	CTTG	2	8	49514	49521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017473	TCAT	2	8	49637	49644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017473	AAAT	2	8	50900	50907	75 %	25 %	0 %	0 %	385818582
118	NC_017473	AATC	2	8	51386	51393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017473	TCAA	2	8	51425	51432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017473	CGCT	2	8	51621	51628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017473	CTAT	2	8	51893	51900	25 %	50 %	0 %	25 %	385818583
122	NC_017473	CTAG	2	8	52115	52122	25 %	25 %	25 %	25 %	385818583
123	NC_017473	ACTA	2	8	52400	52407	50 %	25 %	0 %	25 %	385818584
124	NC_017473	AAAT	2	8	52742	52749	75 %	25 %	0 %	0 %	385818584
125	NC_017473	TAGG	2	8	52780	52787	25 %	25 %	50 %	0 %	385818584
126	NC_017473	TGAT	2	8	53516	53523	25 %	50 %	25 %	0 %	385818585
127	NC_017473	CAAA	2	8	53577	53584	75 %	0 %	0 %	25 %	385818585
128	NC_017473	AAAT	2	8	53886	53893	75 %	25 %	0 %	0 %	385818585
129	NC_017473	TATT	2	8	54496	54503	25 %	75 %	0 %	0 %	385818585
130	NC_017473	TTGA	2	8	54793	54800	25 %	50 %	25 %	0 %	385818585
131	NC_017473	AACA	2	8	54893	54900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017473	TGAA	2	8	55072	55079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017473	TGAA	2	8	55114	55121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017473	CCGC	2	8	55216	55223	0 %	0 %	25 %	75 %	385818586
135	NC_017473	TGAG	2	8	55939	55946	25 %	25 %	50 %	0 %	385818586
136	NC_017473	CAAA	2	8	56266	56273	75 %	0 %	0 %	25 %	385818586
137	NC_017473	TGCG	2	8	56547	56554	0 %	25 %	50 %	25 %	385818586
138	NC_017473	GTTA	2	8	56755	56762	25 %	50 %	25 %	0 %	385818587
139	NC_017473	TTTG	2	8	57065	57072	0 %	75 %	25 %	0 %	385818587
140	NC_017473	GTGC	2	8	57245	57252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017473	GTCA	2	8	57455	57462	25 %	25 %	25 %	25 %	385818588
142	NC_017473	GTTG	2	8	58456	58463	0 %	50 %	50 %	0 %	385818588
143	NC_017473	TTAA	2	8	58701	58708	50 %	50 %	0 %	0 %	385818588
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