MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 1265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017473	TAAT	2	8	3513	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017473	TTTG	2	8	9774	9781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017473	GCAA	2	8	10590	10597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017473	ATTA	2	8	12658	12665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017473	AACG	2	8	15202	15209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017473	AAGC	2	8	18872	18879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017473	TAAT	2	8	19639	19646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017473	CGTT	2	8	20293	20300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017473	AGCT	2	8	21732	21739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017473	CGAG	2	8	21942	21949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017473	GGGT	2	8	22159	22166	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017473	GGTT	2	8	28926	28933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017473	CATA	2	8	28972	28979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017473	AGTG	2	8	29118	29125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017473	ATGA	2	8	34207	34214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017473	AAGC	2	8	35973	35980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017473	AGCA	2	8	37479	37486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017473	ATTT	2	8	37527	37534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017473	AAAC	2	8	38564	38571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017473	AGAA	2	8	40297	40304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017473	TATT	2	8	43437	43444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017473	CTTT	2	8	43676	43683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017473	TCTT	2	8	43768	43775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017473	TCAT	2	8	45648	45655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017473	ATCC	2	8	46084	46091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017473	GTCA	2	8	46471	46478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017473	AATG	2	8	46702	46709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017473	TAAT	2	8	46842	46849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017473	GAAA	2	8	47083	47090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017473	AAAT	2	8	47124	47131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017473	CAAA	2	8	47322	47329	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017473	AAAG	2	8	47380	47387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017473	CAAA	2	8	47705	47712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017473	ATCG	2	8	49486	49493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017473	CTTG	2	8	49514	49521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017473	TCAT	2	8	49637	49644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017473	AATC	2	8	51386	51393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017473	TCAA	2	8	51425	51432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017473	CGCT	2	8	51621	51628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017473	AACA	2	8	54893	54900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017473	TGAA	2	8	55072	55079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017473	TGAA	2	8	55114	55121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017473	GTGC	2	8	57245	57252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017473	TAGC	2	8	65481	65488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017473	ACAA	2	8	65851	65858	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017473	TTGT	2	8	65889	65896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017473	GACT	2	8	65963	65970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017473	AGCA	2	8	67796	67803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017473	GTGA	2	8	67835	67842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017473	GGCA	2	8	68316	68323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017473	CCTA	2	8	68331	68338	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017473	GATG	2	8	68836	68843	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017473	TAAA	2	8	69151	69158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017473	CTGA	2	8	70654	70661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017473	CTAC	2	8	70740	70747	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017473	ATAA	2	8	71047	71054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017473	TCAA	2	8	71122	71129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017473	TACT	2	8	71508	71515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017473	ATTA	2	8	85423	85430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017473	GAAA	2	8	88499	88506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017473	TCCC	2	8	89846	89853	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_017473	AGTA	2	8	89881	89888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017473	GCAC	2	8	90187	90194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017473	CTGG	2	8	90339	90346	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017473	TTGC	2	8	90373	90380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017473	TATT	2	8	91117	91124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017473	TATC	2	8	91181	91188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017473	TAAA	2	8	94186	94193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017473	TTTC	2	8	94247	94254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017473	CAAT	2	8	94344	94351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017473	CAAA	2	8	99619	99626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017473	GTTG	2	8	99804	99811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017473	AAAT	2	8	99861	99868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017473	GTCT	2	8	100008	100015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017473	GGCA	2	8	104425	104432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017473	GTGA	2	8	104480	104487	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017473	CTTT	2	8	105925	105932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017473	ATCA	2	8	106860	106867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017473	TTGT	2	8	110159	110166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017473	AAGA	2	8	111672	111679	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017473	ATTA	2	8	128497	128504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017473	TTAG	2	8	128547	128554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017473	TGAC	2	8	129973	129980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017473	TGGT	2	8	132469	132476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017473	TGTT	2	8	134250	134257	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017473	CAGA	2	8	134334	134341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017473	AAAT	2	8	135443	135450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017473	ATTA	2	8	137791	137798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017473	TTAA	2	8	137931	137938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017473	GATT	2	8	141267	141274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017473	TTTC	2	8	143773	143780	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017473	GCCT	2	8	147440	147447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017473	TTAC	2	8	148478	148485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017473	AGTA	2	8	148490	148497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017473	ACAT	2	8	154275	154282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017473	GAAT	2	8	155514	155521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017473	TAAC	2	8	169043	169050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017473	GCAG	2	8	169078	169085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017473	CAGA	2	8	173991	173998	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017473	GGTA	2	8	174029	174036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017473	TGAA	2	8	174190	174197	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017473	AAGG	2	8	178693	178700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017473	AAAC	2	8	183955	183962	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017473	AGAA	2	8	187394	187401	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017473	AGTA	2	8	187645	187652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017473	TTAA	2	8	188129	188136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017473	AAAG	2	8	188287	188294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017473	TGCT	2	8	192939	192946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017473	GTTT	2	8	194398	194405	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017473	GAAA	2	8	194442	194449	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017473	CAGC	2	8	195016	195023	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017473	TGTT	2	8	195162	195169	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017473	CTTT	2	8	201000	201007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017473	AAGA	2	8	209834	209841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017473	TCAA	2	8	209904	209911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017473	TACT	2	8	209913	209920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017473	TAAA	2	8	210894	210901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017473	CCTT	2	8	211826	211833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017473	TATT	2	8	211911	211918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017473	TGAA	2	8	211970	211977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017473	ATGA	2	8	224801	224808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017473	TACA	2	8	224861	224868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017473	ATAA	2	8	227636	227643	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017473	ATTA	2	8	234075	234082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017473	CAAA	2	8	249798	249805	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017473	AAGC	2	8	253898	253905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017473	ATCA	2	8	253947	253954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017473	TATG	2	8	253978	253985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017473	AGCA	2	8	255900	255907	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017473	TGCA	2	8	255986	255993	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017473	GTGC	2	8	258533	258540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017473	TGAG	2	8	258582	258589	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017473	GTCA	2	8	258615	258622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017473	TGGA	2	8	259100	259107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017473	GTGA	2	8	259279	259286	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017473	ATGG	2	8	260114	260121	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017473	GAGC	2	8	260333	260340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017473	TAAG	2	8	260728	260735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017473	AGAA	2	8	260858	260865	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017473	GCGA	2	8	260887	260894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017473	GCTT	2	8	260919	260926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017473	GAGC	2	8	262329	262336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017473	TAGG	2	8	262775	262782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017473	CTGC	2	8	263768	263775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017473	TAAG	2	8	263842	263849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017473	AACC	2	8	265877	265884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017473	CCGA	2	8	265992	265999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017473	TTCA	2	8	268783	268790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017473	CGGG	2	8	268795	268802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017473	AAAG	2	8	273197	273204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017473	GCTT	2	8	274050	274057	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017473	ATGG	2	8	278758	278765	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017473	TAGA	2	8	278969	278976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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