MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	CTTCAA	2	12	986	997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017472	CAAAAA	2	12	1388	1399	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017472	ATCTGT	2	12	1690	1701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385818463
4	NC_017472	TTTATT	2	12	1993	2004	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385818463
5	NC_017472	CAAACT	2	12	10498	10509	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385818469
6	NC_017472	TAGATG	2	12	13577	13588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818470
7	NC_017472	ATCTCT	2	12	14798	14809	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385818471
8	NC_017472	TGCAAT	2	12	17605	17616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017472	ATGGTT	2	12	18214	18225	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385818475
10	NC_017472	TGCACA	2	12	22616	22627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017472	ATCGCC	2	12	23028	23039	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017472	AATAAA	2	12	24349	24360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385818478
13	NC_017472	TTAAGG	2	12	26035	26046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017472	GCAGAA	2	12	26969	26980	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385818481
15	NC_017472	TTAGTT	2	12	28056	28067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385818483
16	NC_017472	ACTATT	2	12	30960	30971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385818484
17	NC_017472	TTTTTA	2	12	35956	35967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017472	TTTGAT	2	12	47406	47417	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017472	TGAAAT	2	12	49483	49494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385818504
20	NC_017472	AACTTA	2	12	52784	52795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385818509
21	NC_017472	TTGAAG	2	12	54723	54734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818511
22	NC_017472	TATTTT	2	12	60281	60292	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017472	ATAACT	2	12	61548	61559	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017472	AAAAAT	2	12	61645	61656	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017472	ACTTGC	2	12	62551	62562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017472	GATATG	2	12	64253	64264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818520
27	NC_017472	GAACAT	2	12	76011	76022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385818532
28	NC_017472	ATGGTG	2	12	77577	77588	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385818533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.