MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	ATCTGT	2	12	1690	1701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385818463
2	NC_017472	TTTATT	2	12	1993	2004	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385818463
3	NC_017472	CAAACT	2	12	10498	10509	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385818469
4	NC_017472	TAGATG	2	12	13577	13588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818470
5	NC_017472	ATCTCT	2	12	14798	14809	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385818471
6	NC_017472	ATGGTT	2	12	18214	18225	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385818475
7	NC_017472	AATAAA	2	12	24349	24360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385818478
8	NC_017472	GCAGAA	2	12	26969	26980	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385818481
9	NC_017472	TTAGTT	2	12	28056	28067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385818483
10	NC_017472	ACTATT	2	12	30960	30971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385818484
11	NC_017472	TGAAAT	2	12	49483	49494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385818504
12	NC_017472	AACTTA	2	12	52784	52795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385818509
13	NC_017472	TTGAAG	2	12	54723	54734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818511
14	NC_017472	GATATG	2	12	64253	64264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818520
15	NC_017472	GAACAT	2	12	76011	76022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385818532
16	NC_017472	ATGGTG	2	12	77577	77588	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385818533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.