MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	TACTT	2	10	141	150	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017472	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017472	TAGGA	2	10	1875	1884	40 %	20 %	40 %	0 %	385818463
4	NC_017472	TCCAA	2	10	2994	3003	40 %	20 %	0 %	40 %	385818464
5	NC_017472	ATATA	2	10	3849	3858	60 %	40 %	0 %	0 %	385818465
6	NC_017472	TTTAA	2	10	5283	5292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017472	TACTT	2	10	5381	5390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017472	TGCAA	2	10	6053	6062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017472	GAAAA	2	10	6108	6117	80 %	0 %	20 %	0 %	385818467
10	NC_017472	GCAAT	2	10	6862	6871	40 %	20 %	20 %	20 %	385818467
11	NC_017472	CTAAA	2	10	7831	7840	60 %	20 %	0 %	20 %	385818467
12	NC_017472	AAGAA	2	10	7922	7931	80 %	0 %	20 %	0 %	385818467
13	NC_017472	GCTTT	2	10	8804	8813	0 %	60 %	20 %	20 %	385818468
14	NC_017472	GAAAA	2	10	10158	10167	80 %	0 %	20 %	0 %	385818469
15	NC_017472	ATGGA	2	10	10914	10923	40 %	20 %	40 %	0 %	385818469
16	NC_017472	ATCTA	2	10	15027	15036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017472	TTTGT	2	10	15189	15198	0 %	80 %	20 %	0 %	385818472
18	NC_017472	TAAAC	2	10	16273	16282	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017472	GAACT	2	10	16451	16460	40 %	20 %	20 %	20 %	385818473
20	NC_017472	TCAAA	2	10	19070	19079	60 %	20 %	0 %	20 %	385818475
21	NC_017472	AAGTT	2	10	19258	19267	40 %	40 %	20 %	0 %	385818475
22	NC_017472	TTTAA	2	10	19854	19863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017472	AAATA	2	10	19927	19936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017472	CTTTT	2	10	20610	20619	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017472	CAGAT	2	10	21240	21249	40 %	20 %	20 %	20 %	385818476
26	NC_017472	CACTT	2	10	22527	22536	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017472	GTAAA	2	10	26275	26284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017472	AGCAA	2	10	26293	26302	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017472	AATTT	2	10	26595	26604	40 %	60 %	0 %	0 %	385818481
30	NC_017472	CAAAA	2	10	27581	27590	80 %	0 %	0 %	20 %	385818482
31	NC_017472	CAAGA	2	10	28491	28500	60 %	0 %	20 %	20 %	385818483
32	NC_017472	TTAAG	2	10	28899	28908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017472	TGGAA	2	10	29315	29324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017472	TTTAT	2	10	30465	30474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017472	CTTAA	2	10	30538	30547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017472	CAATT	2	10	31213	31222	40 %	40 %	0 %	20 %	385818484
37	NC_017472	GTGAA	2	10	31248	31257	40 %	20 %	40 %	0 %	385818484
38	NC_017472	AAATA	2	10	31434	31443	80 %	20 %	0 %	0 %	385818484
39	NC_017472	TAAAT	2	10	32674	32683	60 %	40 %	0 %	0 %	385818486
40	NC_017472	CTTAA	2	10	33874	33883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017472	CTTTT	2	10	34147	34156	0 %	80 %	0 %	20 %	385818488
42	NC_017472	ATTTG	2	10	34395	34404	20 %	60 %	20 %	0 %	385818488
43	NC_017472	TTGTT	2	10	34738	34747	0 %	80 %	20 %	0 %	385818488
44	NC_017472	AGTTT	2	10	34775	34784	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017472	CTAAT	2	10	35096	35105	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017472	TTTTA	2	10	36298	36307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017472	TATCG	2	10	37074	37083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017472	ATCAG	2	10	40664	40673	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017472	TCTTA	2	10	41066	41075	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017472	ATCAA	2	10	41179	41188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017472	TCTGA	2	10	41991	42000	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017472	TTACA	2	10	43140	43149	40 %	40 %	0 %	20 %	385818499
53	NC_017472	AATTG	2	10	47542	47551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017472	AAAAG	2	10	47555	47564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017472	ACGCA	2	10	47926	47935	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017472	AAAAT	2	10	48042	48051	80 %	20 %	0 %	0 %	385818503
57	NC_017472	TCTCT	2	10	48298	48307	0 %	60 %	0 %	40 %	385818503
58	NC_017472	GATAG	2	10	48473	48482	40 %	20 %	40 %	0 %	385818503
59	NC_017472	AATTG	2	10	48598	48607	40 %	40 %	20 %	0 %	385818503
60	NC_017472	ATTTT	2	10	48796	48805	20 %	80 %	0 %	0 %	385818503
61	NC_017472	AATGT	2	10	49867	49876	40 %	40 %	20 %	0 %	385818504
62	NC_017472	GCAAA	2	10	51304	51313	60 %	0 %	20 %	20 %	385818506
63	NC_017472	TACTC	2	10	51715	51724	20 %	40 %	0 %	40 %	385818507
64	NC_017472	AGAAA	2	10	52048	52057	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017472	AAACT	2	10	55027	55036	60 %	20 %	0 %	20 %	385818511
66	NC_017472	TCATG	2	10	55745	55754	20 %	40 %	20 %	20 %	385818512
67	NC_017472	CACTA	2	10	56549	56558	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017472	GTACA	2	10	60750	60759	40 %	20 %	20 %	20 %	385818515
69	NC_017472	CTTTT	2	10	62569	62578	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017472	ACTTT	2	10	64456	64465	20 %	60 %	0 %	20 %	385818520
71	NC_017472	TACTT	2	10	67194	67203	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017472	TTTAT	2	10	67980	67989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017472	ATGGG	2	10	68144	68153	20 %	20 %	60 %	0 %	385818523
74	NC_017472	CAAAA	2	10	69254	69263	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017472	GTTTC	2	10	69595	69604	0 %	60 %	20 %	20 %	385818525
76	NC_017472	TTGAT	2	10	70604	70613	20 %	60 %	20 %	0 %	385818528
77	NC_017472	TTTGG	2	10	71382	71391	0 %	60 %	40 %	0 %	385818529
78	NC_017472	TCATG	2	10	73410	73419	20 %	40 %	20 %	20 %	385818530
79	NC_017472	TAAAT	2	10	74471	74480	60 %	40 %	0 %	0 %	385818531
80	NC_017472	TCTGC	2	10	74854	74863	0 %	40 %	20 %	40 %	385818531
81	NC_017472	AAGAA	2	10	75908	75917	80 %	0 %	20 %	0 %	385818532
82	NC_017472	TAAAT	2	10	77280	77289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017472	AAGGA	2	10	77432	77441	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.