MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	TACTT	2	10	141	150	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017472	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017472	TTTAA	2	10	5283	5292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017472	TACTT	2	10	5381	5390	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017472	TGCAA	2	10	6053	6062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017472	ATCTA	2	10	15027	15036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017472	TAAAC	2	10	16273	16282	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017472	TTTAA	2	10	19854	19863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017472	AAATA	2	10	19927	19936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017472	CTTTT	2	10	20610	20619	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017472	CACTT	2	10	22527	22536	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017472	GTAAA	2	10	26275	26284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017472	AGCAA	2	10	26293	26302	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017472	TTAAG	2	10	28899	28908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017472	TGGAA	2	10	29315	29324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017472	TTTAT	2	10	30465	30474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017472	CTTAA	2	10	30538	30547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017472	CTTAA	2	10	33874	33883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017472	AGTTT	2	10	34775	34784	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017472	CTAAT	2	10	35096	35105	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017472	TTTTA	2	10	36298	36307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017472	TATCG	2	10	37074	37083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017472	ATCAG	2	10	40664	40673	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017472	TCTTA	2	10	41066	41075	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017472	ATCAA	2	10	41179	41188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017472	TCTGA	2	10	41991	42000	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017472	AATTG	2	10	47542	47551	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017472	AAAAG	2	10	47555	47564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017472	ACGCA	2	10	47926	47935	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017472	AGAAA	2	10	52048	52057	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017472	CACTA	2	10	56549	56558	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017472	CTTTT	2	10	62569	62578	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017472	TACTT	2	10	67194	67203	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017472	TTTAT	2	10	67980	67989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017472	CAAAA	2	10	69254	69263	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017472	TAAAT	2	10	77280	77289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017472	AAGGA	2	10	77432	77441	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.