MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 262

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	GACT	2	8	716	723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017472	AAGA	2	8	909	916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017472	AAAG	2	8	1292	1299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017472	TTTA	2	8	1509	1516	25 %	75 %	0 %	0 %	385818463
5	NC_017472	CTAA	2	8	2920	2927	50 %	25 %	0 %	25 %	385818464
6	NC_017472	AATC	2	8	3221	3228	50 %	25 %	0 %	25 %	385818464
7	NC_017472	CTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	0 %	25 %	385818464
8	NC_017472	TTCT	2	8	3627	3634	0 %	75 %	0 %	25 %	385818464
9	NC_017472	TTCC	2	8	3639	3646	0 %	50 %	0 %	50 %	385818464
10	NC_017472	AAAT	2	8	3661	3668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017472	ATTA	2	8	4048	4055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017472	AAAT	2	8	4556	4563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017472	GGCT	2	8	4602	4609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017472	TTAT	2	8	4867	4874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017472	ATTC	2	8	4940	4947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017472	AATC	2	8	5650	5657	50 %	25 %	0 %	25 %	385818466
17	NC_017472	CAAA	2	8	6012	6019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017472	TTCA	2	8	6947	6954	25 %	50 %	0 %	25 %	385818467
19	NC_017472	AATA	2	8	7481	7488	75 %	25 %	0 %	0 %	385818467
20	NC_017472	TTGA	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	385818467
21	NC_017472	CCAA	2	8	8116	8123	50 %	0 %	0 %	50 %	385818468
22	NC_017472	ATGA	2	8	8347	8354	50 %	25 %	25 %	0 %	385818468
23	NC_017472	ACTT	2	8	8632	8639	25 %	50 %	0 %	25 %	385818468
24	NC_017472	TACA	2	8	9144	9151	50 %	25 %	0 %	25 %	385818468
25	NC_017472	TGAT	2	8	9203	9210	25 %	50 %	25 %	0 %	385818468
26	NC_017472	TCAA	2	8	9432	9439	50 %	25 %	0 %	25 %	385818468
27	NC_017472	ATGG	2	8	9685	9692	25 %	25 %	50 %	0 %	385818468
28	NC_017472	CTTT	2	8	9851	9858	0 %	75 %	0 %	25 %	385818468
29	NC_017472	TATT	2	8	10118	10125	25 %	75 %	0 %	0 %	385818469
30	NC_017472	CAAT	2	8	11249	11256	50 %	25 %	0 %	25 %	385818469
31	NC_017472	AACG	2	8	11329	11336	50 %	0 %	25 %	25 %	385818470
32	NC_017472	ACTT	2	8	11938	11945	25 %	50 %	0 %	25 %	385818470
33	NC_017472	TAAA	2	8	12002	12009	75 %	25 %	0 %	0 %	385818470
34	NC_017472	AATT	2	8	12071	12078	50 %	50 %	0 %	0 %	385818470
35	NC_017472	AACT	2	8	12119	12126	50 %	25 %	0 %	25 %	385818470
36	NC_017472	GCTA	2	8	12282	12289	25 %	25 %	25 %	25 %	385818470
37	NC_017472	TGAC	2	8	12350	12357	25 %	25 %	25 %	25 %	385818470
38	NC_017472	CGAC	2	8	12369	12376	25 %	0 %	25 %	50 %	385818470
39	NC_017472	AGCA	2	8	12383	12390	50 %	0 %	25 %	25 %	385818470
40	NC_017472	TCAT	2	8	12600	12607	25 %	50 %	0 %	25 %	385818470
41	NC_017472	AGAA	2	8	12662	12669	75 %	0 %	25 %	0 %	385818470
42	NC_017472	AATA	2	8	13297	13304	75 %	25 %	0 %	0 %	385818470
43	NC_017472	GGTT	2	8	13308	13315	0 %	50 %	50 %	0 %	385818470
44	NC_017472	ATGT	2	8	13339	13346	25 %	50 %	25 %	0 %	385818470
45	NC_017472	TAAA	2	8	13676	13683	75 %	25 %	0 %	0 %	385818470
46	NC_017472	GGAT	2	8	13845	13852	25 %	25 %	50 %	0 %	385818470
47	NC_017472	TTCA	2	8	13885	13892	25 %	50 %	0 %	25 %	385818470
48	NC_017472	AAAG	2	8	14110	14117	75 %	0 %	25 %	0 %	385818470
49	NC_017472	ATTG	2	8	14178	14185	25 %	50 %	25 %	0 %	385818470
50	NC_017472	TTTA	2	8	14707	14714	25 %	75 %	0 %	0 %	385818471
51	NC_017472	CTAT	2	8	14903	14910	25 %	50 %	0 %	25 %	385818471
52	NC_017472	CATT	2	8	14954	14961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017472	TGGG	2	8	15281	15288	0 %	25 %	75 %	0 %	385818472
54	NC_017472	CAGG	2	8	15366	15373	25 %	0 %	50 %	25 %	385818472
55	NC_017472	TGTC	2	8	15375	15382	0 %	50 %	25 %	25 %	385818472
56	NC_017472	AATA	2	8	15924	15931	75 %	25 %	0 %	0 %	385818472
57	NC_017472	TTCT	2	8	16479	16486	0 %	75 %	0 %	25 %	385818473
58	NC_017472	ATTG	2	8	16522	16529	25 %	50 %	25 %	0 %	385818473
59	NC_017472	TAAA	2	8	17693	17700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017472	ATGG	2	8	17905	17912	25 %	25 %	50 %	0 %	385818475
61	NC_017472	AATT	2	8	17983	17990	50 %	50 %	0 %	0 %	385818475
62	NC_017472	GATT	2	8	18359	18366	25 %	50 %	25 %	0 %	385818475
63	NC_017472	GGAA	2	8	19109	19116	50 %	0 %	50 %	0 %	385818475
64	NC_017472	ATTT	2	8	19917	19924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017472	AGAA	2	8	20823	20830	75 %	0 %	25 %	0 %	385818476
66	NC_017472	TTTC	2	8	20918	20925	0 %	75 %	0 %	25 %	385818476
67	NC_017472	TTTA	2	8	21383	21390	25 %	75 %	0 %	0 %	385818476
68	NC_017472	AGGA	2	8	21718	21725	50 %	0 %	50 %	0 %	385818476
69	NC_017472	TGCT	2	8	22245	22252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017472	ATTG	2	8	22550	22557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017472	AAAT	2	8	22649	22656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017472	TCTA	2	8	23435	23442	25 %	50 %	0 %	25 %	385818477
73	NC_017472	AGAT	2	8	23534	23541	50 %	25 %	25 %	0 %	385818477
74	NC_017472	AAGA	2	8	23577	23584	75 %	0 %	25 %	0 %	385818477
75	NC_017472	TATT	2	8	23707	23714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017472	TTAT	2	8	23816	23823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017472	ATTC	2	8	23836	23843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017472	AATG	2	8	23902	23909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017472	AAAG	2	8	24078	24085	75 %	0 %	25 %	0 %	385818478
80	NC_017472	GAAG	2	8	24259	24266	50 %	0 %	50 %	0 %	385818478
81	NC_017472	TATG	2	8	25339	25346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017472	ATGT	2	8	25913	25920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017472	ATTT	2	8	26261	26268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017472	GTAT	2	8	26688	26695	25 %	50 %	25 %	0 %	385818481
85	NC_017472	TAAA	2	8	27022	27029	75 %	25 %	0 %	0 %	385818481
86	NC_017472	ATGT	2	8	27509	27516	25 %	50 %	25 %	0 %	385818482
87	NC_017472	TAAA	2	8	28087	28094	75 %	25 %	0 %	0 %	385818483
88	NC_017472	TTAA	2	8	28853	28860	50 %	50 %	0 %	0 %	385818483
89	NC_017472	ATAA	2	8	29030	29037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017472	AGGC	2	8	29752	29759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017472	GGTA	2	8	29901	29908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017472	CAAA	2	8	30036	30043	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017472	ACTA	2	8	30157	30164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017472	TTTG	2	8	30727	30734	0 %	75 %	25 %	0 %	385818484
95	NC_017472	TATT	2	8	31067	31074	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
96	NC_017472	AATT	2	8	31503	31510	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
97	NC_017472	AATT	2	8	31515	31522	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
98	NC_017472	ATTT	2	8	31719	31726	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
99	NC_017472	AAAT	2	8	31746	31753	75 %	25 %	0 %	0 %	385818484
100	NC_017472	ATTT	2	8	32007	32014	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
101	NC_017472	AATT	2	8	32138	32145	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
102	NC_017472	ATTC	2	8	32196	32203	25 %	50 %	0 %	25 %	385818484
103	NC_017472	TATT	2	8	32230	32237	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
104	NC_017472	ACAA	2	8	32465	32472	75 %	0 %	0 %	25 %	385818485
105	NC_017472	GTCT	2	8	32514	32521	0 %	50 %	25 %	25 %	385818485
106	NC_017472	TCTA	2	8	32828	32835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017472	CAAT	2	8	33454	33461	50 %	25 %	0 %	25 %	385818487
108	NC_017472	TGAT	2	8	34309	34316	25 %	50 %	25 %	0 %	385818488
109	NC_017472	ATAG	2	8	34468	34475	50 %	25 %	25 %	0 %	385818488
110	NC_017472	GCTT	2	8	35368	35375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017472	CGAT	2	8	35670	35677	25 %	25 %	25 %	25 %	385818491
112	NC_017472	AATT	2	8	35823	35830	50 %	50 %	0 %	0 %	385818491
113	NC_017472	TATT	2	8	36359	36366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017472	TTAA	2	8	36776	36783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017472	TCGA	2	8	36838	36845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017472	AATC	2	8	37183	37190	50 %	25 %	0 %	25 %	385818494
117	NC_017472	GTGC	2	8	37335	37342	0 %	25 %	50 %	25 %	385818494
118	NC_017472	TTCA	2	8	37373	37380	25 %	50 %	0 %	25 %	385818494
119	NC_017472	TCAT	2	8	37407	37414	25 %	50 %	0 %	25 %	385818494
120	NC_017472	TCTT	2	8	38509	38516	0 %	75 %	0 %	25 %	385818495
121	NC_017472	GAAC	2	8	39053	39060	50 %	0 %	25 %	25 %	385818495
122	NC_017472	CTTT	2	8	39771	39778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017472	CTAA	2	8	39797	39804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017472	GCTT	2	8	40095	40102	0 %	50 %	25 %	25 %	385818496
125	NC_017472	TGGC	2	8	40103	40110	0 %	25 %	50 %	25 %	385818496
126	NC_017472	TAAA	2	8	41112	41119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017472	AAAC	2	8	41492	41499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017472	AAGC	2	8	42125	42132	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017472	CTGT	2	8	42223	42230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017472	TCTG	2	8	42276	42283	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017472	CTGT	2	8	42354	42361	0 %	50 %	25 %	25 %	385818498
132	NC_017472	TTGC	2	8	43663	43670	0 %	50 %	25 %	25 %	385818500
133	NC_017472	AATC	2	8	44123	44130	50 %	25 %	0 %	25 %	385818500
134	NC_017472	CTTT	2	8	44153	44160	0 %	75 %	0 %	25 %	385818500
135	NC_017472	GGCA	2	8	44567	44574	25 %	0 %	50 %	25 %	385818500
136	NC_017472	TTTC	2	8	44687	44694	0 %	75 %	0 %	25 %	385818500
137	NC_017472	TACT	2	8	44780	44787	25 %	50 %	0 %	25 %	385818500
138	NC_017472	GAAA	2	8	44875	44882	75 %	0 %	25 %	0 %	385818500
139	NC_017472	AAAG	2	8	44922	44929	75 %	0 %	25 %	0 %	385818500
140	NC_017472	TTTA	2	8	45180	45187	25 %	75 %	0 %	0 %	385818500
141	NC_017472	TAAA	2	8	45341	45348	75 %	25 %	0 %	0 %	385818500
142	NC_017472	TAAA	2	8	45636	45643	75 %	25 %	0 %	0 %	385818500
143	NC_017472	TCAA	2	8	45877	45884	50 %	25 %	0 %	25 %	385818500
144	NC_017472	ATAA	2	8	46172	46179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017472	ATGA	2	8	46527	46534	50 %	25 %	25 %	0 %	385818501
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.