MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	GACT	2	8	716	723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017472	AAGA	2	8	909	916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017472	AAAG	2	8	1292	1299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017472	AAAT	2	8	3661	3668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017472	ATTA	2	8	4048	4055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017472	AAAT	2	8	4556	4563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017472	GGCT	2	8	4602	4609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017472	TTAT	2	8	4867	4874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017472	ATTC	2	8	4940	4947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017472	CAAA	2	8	6012	6019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017472	CATT	2	8	14954	14961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017472	TAAA	2	8	17693	17700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017472	ATTT	2	8	19917	19924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017472	TGCT	2	8	22245	22252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017472	ATTG	2	8	22550	22557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017472	AAAT	2	8	22649	22656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017472	TATT	2	8	23707	23714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017472	TTAT	2	8	23816	23823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017472	ATTC	2	8	23836	23843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017472	AATG	2	8	23902	23909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017472	TATG	2	8	25339	25346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017472	ATGT	2	8	25913	25920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017472	ATTT	2	8	26261	26268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017472	ATAA	2	8	29030	29037	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017472	AGGC	2	8	29752	29759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017472	GGTA	2	8	29901	29908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017472	CAAA	2	8	30036	30043	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017472	ACTA	2	8	30157	30164	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017472	TCTA	2	8	32828	32835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017472	GCTT	2	8	35368	35375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017472	TATT	2	8	36359	36366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017472	TTAA	2	8	36776	36783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017472	TCGA	2	8	36838	36845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017472	CTTT	2	8	39771	39778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017472	CTAA	2	8	39797	39804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017472	TAAA	2	8	41112	41119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017472	AAAC	2	8	41492	41499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017472	AAGC	2	8	42125	42132	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017472	CTGT	2	8	42223	42230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017472	TCTG	2	8	42276	42283	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017472	ATAA	2	8	46172	46179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017472	ATGC	2	8	47266	47273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017472	TTAT	2	8	47396	47403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017472	CTAG	2	8	47529	47536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017472	GAAA	2	8	49044	49051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017472	AGAT	2	8	49908	49915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017472	GGTC	2	8	50688	50695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017472	TGAT	2	8	50819	50826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017472	GATG	2	8	52099	52106	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017472	GTTA	2	8	54235	54242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017472	AAGC	2	8	56514	56521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017472	ATAG	2	8	56533	56540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017472	TCCC	2	8	56640	56647	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_017472	TTTC	2	8	56660	56667	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017472	CCAA	2	8	56736	56743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017472	TAAA	2	8	56908	56915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017472	TAAA	2	8	62084	62091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017472	TCAG	2	8	62116	62123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017472	CAAT	2	8	62608	62615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017472	TCTT	2	8	66316	66323	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017472	GACA	2	8	67373	67380	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017472	ATGG	2	8	67569	67576	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017472	CTAT	2	8	67597	67604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017472	ATTC	2	8	67919	67926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017472	ACTA	2	8	68492	68499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017472	TCAC	2	8	68618	68625	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017472	CTAC	2	8	69231	69238	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017472	CAGG	2	8	70531	70538	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017472	AATA	2	8	72191	72198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017472	CGTT	2	8	72268	72275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017472	CATT	2	8	72289	72296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017472	GTAT	2	8	72497	72504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017472	AATT	2	8	72568	72575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017472	AGAA	2	8	72640	72647	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017472	TAAA	2	8	73953	73960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017472	CTAA	2	8	74222	74229	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017472	TTTA	2	8	77297	77304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.