MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	CA	3	6	3279	3284	50 %	0 %	0 %	50 %	385818464
2	NC_017472	AT	3	6	10363	10368	50 %	50 %	0 %	0 %	385818469
3	NC_017472	CT	3	6	10583	10588	0 %	50 %	0 %	50 %	385818469
4	NC_017472	AT	3	6	12686	12691	50 %	50 %	0 %	0 %	385818470
5	NC_017472	AT	3	6	13131	13136	50 %	50 %	0 %	0 %	385818470
6	NC_017472	AC	3	6	13265	13270	50 %	0 %	0 %	50 %	385818470
7	NC_017472	TC	3	6	14670	14675	0 %	50 %	0 %	50 %	385818471
8	NC_017472	TC	3	6	14915	14920	0 %	50 %	0 %	50 %	385818471
9	NC_017472	AG	3	6	15812	15817	50 %	0 %	50 %	0 %	385818472
10	NC_017472	AT	3	6	16414	16419	50 %	50 %	0 %	0 %	385818473
11	NC_017472	GT	3	6	16806	16811	0 %	50 %	50 %	0 %	385818474
12	NC_017472	AT	4	8	21145	21152	50 %	50 %	0 %	0 %	385818476
13	NC_017472	CT	3	6	21158	21163	0 %	50 %	0 %	50 %	385818476
14	NC_017472	AT	3	6	21366	21371	50 %	50 %	0 %	0 %	385818476
15	NC_017472	AG	3	6	24233	24238	50 %	0 %	50 %	0 %	385818478
16	NC_017472	CA	3	6	27638	27643	50 %	0 %	0 %	50 %	385818482
17	NC_017472	AG	3	6	28756	28761	50 %	0 %	50 %	0 %	385818483
18	NC_017472	AT	4	8	30780	30787	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
19	NC_017472	TA	3	6	30987	30992	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
20	NC_017472	AT	3	6	31275	31280	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
21	NC_017472	AT	3	6	31817	31822	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
22	NC_017472	TG	3	6	33074	33079	0 %	50 %	50 %	0 %	385818487
23	NC_017472	AC	3	6	33129	33134	50 %	0 %	0 %	50 %	385818487
24	NC_017472	GA	3	6	39043	39048	50 %	0 %	50 %	0 %	385818495
25	NC_017472	AT	3	6	40468	40473	50 %	50 %	0 %	0 %	385818496
26	NC_017472	AT	3	6	41585	41590	50 %	50 %	0 %	0 %	385818497
27	NC_017472	AT	3	6	41796	41801	50 %	50 %	0 %	0 %	385818497
28	NC_017472	TA	4	8	41821	41828	50 %	50 %	0 %	0 %	385818497
29	NC_017472	TA	3	6	42959	42964	50 %	50 %	0 %	0 %	385818499
30	NC_017472	TG	3	6	43376	43381	0 %	50 %	50 %	0 %	385818500
31	NC_017472	TA	3	6	43650	43655	50 %	50 %	0 %	0 %	385818500
32	NC_017472	AT	3	6	43954	43959	50 %	50 %	0 %	0 %	385818500
33	NC_017472	CA	3	6	44223	44228	50 %	0 %	0 %	50 %	385818500
34	NC_017472	AG	3	6	45467	45472	50 %	0 %	50 %	0 %	385818500
35	NC_017472	AT	3	6	45901	45906	50 %	50 %	0 %	0 %	385818500
36	NC_017472	GC	3	6	46358	46363	0 %	0 %	50 %	50 %	385818501
37	NC_017472	AT	3	6	46377	46382	50 %	50 %	0 %	0 %	385818501
38	NC_017472	AT	3	6	48019	48024	50 %	50 %	0 %	0 %	385818503
39	NC_017472	AT	4	8	48571	48578	50 %	50 %	0 %	0 %	385818503
40	NC_017472	TC	3	6	51188	51193	0 %	50 %	0 %	50 %	385818506
41	NC_017472	AT	3	6	52403	52408	50 %	50 %	0 %	0 %	385818508
42	NC_017472	AG	3	6	54785	54790	50 %	0 %	50 %	0 %	385818511
43	NC_017472	GA	3	6	58010	58015	50 %	0 %	50 %	0 %	385818513
44	NC_017472	TC	3	6	58772	58777	0 %	50 %	0 %	50 %	385818513
45	NC_017472	TA	3	6	60337	60342	50 %	50 %	0 %	0 %	385818515
46	NC_017472	AT	3	6	60964	60969	50 %	50 %	0 %	0 %	385818515
47	NC_017472	AC	3	6	63079	63084	50 %	0 %	0 %	50 %	385818518
48	NC_017472	TG	3	6	63824	63829	0 %	50 %	50 %	0 %	385818519
49	NC_017472	GT	3	6	66147	66152	0 %	50 %	50 %	0 %	385818520
50	NC_017472	TG	3	6	69882	69887	0 %	50 %	50 %	0 %	385818526
51	NC_017472	AT	3	6	69976	69981	50 %	50 %	0 %	0 %	385818526
52	NC_017472	AT	3	6	70026	70031	50 %	50 %	0 %	0 %	385818526
53	NC_017472	CT	3	6	70179	70184	0 %	50 %	0 %	50 %	385818527
54	NC_017472	GC	3	6	71665	71670	0 %	0 %	50 %	50 %	385818529
55	NC_017472	AT	3	6	74927	74932	50 %	50 %	0 %	0 %	385818531
56	NC_017472	CA	3	6	76423	76428	50 %	0 %	0 %	50 %	385818532

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.