MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid1

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017471	GAT	2	6	68	73	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017471	ATC	2	6	91	96	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017471	TTC	2	6	117	122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017471	GAT	2	6	429	434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017471	TGC	2	6	502	507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017471	AAC	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017471	ACC	2	6	957	962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017471	ATT	2	6	1027	1032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017471	ATT	2	6	1090	1095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017471	CTA	3	9	1170	1178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017471	ATT	2	6	1284	1289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818455
12	NC_017471	CTA	2	6	1323	1328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818455
13	NC_017471	AAT	2	6	1339	1344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818455
14	NC_017471	CCA	2	6	1373	1378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818455
15	NC_017471	TGC	2	6	1398	1403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818455
16	NC_017471	TAA	2	6	1404	1409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818455
17	NC_017471	ATT	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818455
18	NC_017471	TTC	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818455
19	NC_017471	GAA	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818455
20	NC_017471	ACA	2	6	1985	1990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818455
21	NC_017471	TTC	2	6	2006	2011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818455
22	NC_017471	CCA	2	6	2046	2051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818455
23	NC_017471	TAT	2	6	2164	2169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017471	CTA	2	6	2233	2238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017471	ATT	2	6	2248	2253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017471	CAT	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017471	ATT	2	6	2398	2403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017471	AAG	2	6	2475	2480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017471	ATT	2	6	2534	2539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017471	TGA	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818456
31	NC_017471	ATC	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818456
32	NC_017471	TCA	2	6	2808	2813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017471	AAC	2	6	2912	2917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818457
34	NC_017471	ACT	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818458
35	NC_017471	GTA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818458
36	NC_017471	GCA	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818458
37	NC_017471	ATG	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017471	AAT	2	6	3705	3710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818459
39	NC_017471	CAT	2	6	3750	3755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818459
40	NC_017471	TGC	2	6	3796	3801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818459
41	NC_017471	ATA	2	6	3805	3810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818459
42	NC_017471	ATC	2	6	3853	3858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818459
43	NC_017471	ATT	2	6	3883	3888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818459
44	NC_017471	AAT	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017471	TCA	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017471	AGC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017471	ACC	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.