MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 chromosome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017470	ATTAAG	2	12	2733	2744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017470	ATAAAT	2	12	14287	14298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017470	GAAAAA	2	12	22462	22473	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017470	CGGAGC	2	12	58321	58332	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017470	TTCATT	2	12	70880	70891	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017470	ATTGAT	2	12	70959	70970	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017470	CAGTTA	2	12	72766	72777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017470	TTCATT	2	12	79746	79757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017470	CTAAAA	2	12	102600	102611	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017470	AGAAAG	2	12	131150	131161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017470	AAAGAC	2	12	158508	158519	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017470	TTGTCT	2	12	197154	197165	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017470	AAAACA	2	12	214087	214098	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017470	TTTAGC	2	12	338152	338163	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017470	TCAAGA	2	12	363519	363530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017470	TGGCTG	2	12	393659	393670	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017470	ATCTAG	2	12	398544	398555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017470	CTTTTT	2	12	403384	403395	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017470	CGGAGC	2	12	415736	415747	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017470	TATTAA	2	12	420672	420683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017470	CGGAGC	2	12	433504	433515	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017470	ACATTT	2	12	442681	442692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017470	ACTTAT	2	12	452517	452528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017470	AAAGAA	2	12	471762	471773	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017470	CTTTTT	2	12	477289	477300	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017470	AGATAT	2	12	493897	493908	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017470	TTACAA	2	12	503347	503358	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017470	TTTTTA	2	12	503845	503856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017470	GGAATT	2	12	525054	525065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017470	TTCATA	2	12	543316	543327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017470	AAAAGA	2	12	555093	555104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017470	TAAAGA	2	12	558468	558479	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017470	TTGAAC	2	12	568291	568302	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017470	ATTTAT	2	12	585469	585480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017470	TTTTTG	2	12	588145	588156	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017470	AATATT	2	12	621382	621393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017470	AGTGTT	2	12	624405	624416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017470	TATAAG	2	12	633719	633730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017470	TTAATG	2	12	686574	686585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017470	ATCTAT	2	12	692591	692602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017470	ACGTTT	2	12	711351	711362	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017470	GAAAAA	2	12	712612	712623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017470	ATCTAA	2	12	717513	717524	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017470	CAAACT	2	12	830639	830650	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017470	GATTTC	2	12	834438	834449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017470	TTAGCT	2	12	849228	849239	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017470	CCTTTT	2	12	855734	855745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017470	TTCTAT	2	12	866944	866955	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017470	CAAAAG	2	12	876819	876830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017470	CTTATG	2	12	886491	886502	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017470	AAAAAT	2	12	894767	894778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017470	GATATA	2	12	896707	896718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017470	ATGTAT	2	12	907461	907472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017470	TAAATA	2	12	912168	912179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017470	CTTATA	2	12	944206	944217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017470	AAGAAT	2	12	956034	956045	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017470	AGTTAA	2	12	976398	976409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017470	AACTGC	2	12	986012	986023	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017470	GTTTTT	2	12	1001601	1001612	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017470	TAATGC	2	12	1016664	1016675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017470	AAATTA	2	12	1016836	1016847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017470	TAATTA	2	12	1023924	1023935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017470	ATGTAA	2	12	1024983	1024994	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017470	TTGACT	2	12	1025473	1025484	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017470	TTCTTT	2	12	1037534	1037545	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017470	AGTTGG	2	12	1044153	1044164	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017470	ATATAA	2	12	1053870	1053881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017470	TCAGGC	2	12	1085805	1085816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017470	GCTTTT	2	12	1105381	1105392	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017470	ATTTAT	2	12	1122745	1122756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017470	TACTAG	2	12	1123811	1123822	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017470	TTTTTA	2	12	1138859	1138870	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017470	TAAAAT	2	12	1186068	1186079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017470	ATAATT	2	12	1217175	1217186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017470	CATTAG	2	12	1220103	1220114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017470	ATGAGA	2	12	1238047	1238058	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017470	TTTCTT	2	12	1328188	1328199	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017470	CATTCG	2	12	1359308	1359319	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017470	TTTAAT	2	12	1380838	1380849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017470	TAATTA	2	12	1386884	1386895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017470	CATTGA	2	12	1389750	1389761	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017470	ATCAAT	2	12	1401483	1401494	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017470	TTTAAT	2	12	1411545	1411556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017470	GCACTC	2	12	1413281	1413292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017470	CTATTT	2	12	1464847	1464858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017470	CAAAAA	2	12	1476110	1476121	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017470	CCTTGA	2	12	1566660	1566671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017470	GCTCCG	2	12	1591952	1591963	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017470	AAAAAG	2	12	1601647	1601658	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017470	TAAAAA	2	12	1640895	1640906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017470	TTTTAT	2	12	1663493	1663504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017470	AAAAAT	2	12	1666393	1666404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017470	TTTTTA	2	12	1675698	1675709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017470	TATTTT	2	12	1716136	1716147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017470	TTCTAT	2	12	1748980	1748991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017470	AAAAGA	2	12	1758266	1758277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017470	ATTATA	2	12	1759360	1759371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017470	ATAAAA	2	12	1805135	1805146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017470	TTATTT	2	12	1812838	1812849	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017470	TAGTGC	2	12	1815593	1815604	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017470	ATTATC	2	12	1838141	1838152	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017470	TAACTT	2	12	1839556	1839567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017470	CCTTTT	2	12	1847854	1847865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017470	TATTTT	2	12	1894125	1894136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.