MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 chromosome

Total Repeats: 742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017470	GGAGAA	2	12	4287	4298	50 %	0 %	50 %	0 %	385816615
2	NC_017470	TGGCGG	2	12	4662	4673	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385816616
3	NC_017470	CGAAGA	2	12	7768	7779	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385816617
4	NC_017470	TAATTT	2	12	9256	9267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816618
5	NC_017470	TGAAGT	2	12	14047	14058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816623
6	NC_017470	CCAATT	2	12	15529	15540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816625
7	NC_017470	TTCATA	2	12	18906	18917	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385816629
8	NC_017470	AATCTA	2	12	21012	21023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385816633
9	NC_017470	GACTTT	2	12	24521	24532	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385816636
10	NC_017470	TGTGCA	2	12	25681	25692	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385816637
11	NC_017470	AGTTAA	2	12	38032	38043	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385816650
12	NC_017470	TCACCG	2	12	40685	40696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385816652
13	NC_017470	AAAGAA	2	12	41519	41530	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385816653
14	NC_017470	TGGTGA	2	12	43553	43564	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385816654
15	NC_017470	AATAAA	2	12	43711	43722	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385816654
16	NC_017470	TTACAA	2	12	45854	45865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385816657
17	NC_017470	AAAATT	2	12	49861	49872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816659
18	NC_017470	TGTTTT	2	12	52402	52413	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385816660
19	NC_017470	TACCTG	2	12	52747	52758	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385816660
20	NC_017470	TGTTTT	2	12	54748	54759	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385816661
21	NC_017470	TACTTT	2	12	61159	61170	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385816664
22	NC_017470	ATTTTA	2	12	68073	68084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816672
23	NC_017470	TCAATG	2	12	68263	68274	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385816673
24	NC_017470	TATTTT	2	12	69850	69861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385816674
25	NC_017470	CAGTTA	2	12	70116	70127	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385816675
26	NC_017470	ATCTCC	2	12	78463	78474	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385816683
27	NC_017470	ATATTT	2	12	78699	78710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816683
28	NC_017470	ATAAAA	2	12	83702	83713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385816690
29	NC_017470	ACTGCT	2	12	83854	83865	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385816690
30	NC_017470	GGCAAA	2	12	84852	84863	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385816691
31	NC_017470	ATGCTG	2	12	89251	89262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385816696
32	NC_017470	AATTCA	2	12	89340	89351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385816696
33	NC_017470	GGTTTG	2	12	90892	90903	0 %	50 %	50 %	0 %	385816696
34	NC_017470	ATTCCA	2	12	92105	92116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816697
35	NC_017470	AGTTCA	2	12	94573	94584	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385816700
36	NC_017470	GTACGT	2	12	96022	96033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385816701
37	NC_017470	ATTGTT	2	12	102955	102966	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385816709
38	NC_017470	GATAAA	2	12	104552	104563	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385816711
39	NC_017470	CGATGA	2	12	111527	111538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385816719
40	NC_017470	CAAAGC	2	12	112247	112258	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385816719
41	NC_017470	AAACAT	2	12	115121	115132	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385816722
42	NC_017470	CCAGTA	2	12	115157	115168	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385816722
43	NC_017470	AACTTG	2	12	116370	116381	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385816724
44	NC_017470	TAGTAA	2	12	116444	116455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385816724
45	NC_017470	GTTCAA	2	12	116799	116810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385816724
46	NC_017470	ATAAAT	2	12	118690	118701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816725
47	NC_017470	CTTTTC	2	12	119988	119999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816727
48	NC_017470	TTTCTT	2	12	122716	122727	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385816731
49	NC_017470	GCTTTG	2	12	127504	127515	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385816736
50	NC_017470	TGAAGC	2	12	128227	128238	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385816737
51	NC_017470	TGATTT	2	12	132524	132535	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385816741
52	NC_017470	GTAGCT	2	12	133534	133545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385816742
53	NC_017470	GTTTTG	2	12	139334	139345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816747
54	NC_017470	AACGCA	2	12	141683	141694	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385816750
55	NC_017470	AAAGAA	2	12	146987	146998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385816753
56	NC_017470	CAACTT	2	12	148192	148203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816755
57	NC_017470	TACGCA	2	12	149650	149661	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385816756
58	NC_017470	AAGGCT	2	12	155833	155844	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385816763
59	NC_017470	ACCACT	2	12	160783	160794	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385816766
60	NC_017470	ATTGAT	2	12	162236	162247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385816768
61	NC_017470	CTTGTC	2	12	173988	173999	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385816781
62	NC_017470	ACTGCT	2	12	175797	175808	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385816784
63	NC_017470	GGCAAG	2	12	179113	179124	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385816785
64	NC_017470	AGCAGT	2	12	179128	179139	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385816785
65	NC_017470	CTCAAT	2	12	180244	180255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816786
66	NC_017470	AAGGAT	2	12	180270	180281	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385816786
67	NC_017470	TGGCCT	2	12	181099	181110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816787
68	NC_017470	TTGCTT	2	12	191261	191272	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385816797
69	NC_017470	GTCATT	2	12	192296	192307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385816797
70	NC_017470	TGTCGG	2	12	196748	196759	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385816800
71	NC_017470	AAGAAC	2	12	200159	200170	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385816804
72	NC_017470	ACGATG	2	12	202342	202353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385816805
73	NC_017470	CGGTGC	2	12	202751	202762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385816805
74	NC_017470	CAACTG	2	12	204660	204671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385816807
75	NC_017470	GCCATT	2	12	205840	205851	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385816808
76	NC_017470	ATCGGT	2	12	206059	206070	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385816808
77	NC_017470	TCAGGT	2	12	206392	206403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385816809
78	NC_017470	ATCTGG	2	12	207473	207484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385816810
79	NC_017470	AGAAAC	2	12	210102	210113	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385816812
80	NC_017470	GACAAG	2	12	215711	215722	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385816818
81	NC_017470	AAGATG	2	12	215847	215858	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385816818
82	NC_017470	GTCTAA	2	12	221049	221060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385816822
83	NC_017470	AGCCAA	2	12	221654	221665	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385816822
84	NC_017470	GGCTAA	2	12	221718	221729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385816822
85	NC_017470	AACTGA	2	12	223227	223238	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385816824
86	NC_017470	TCAACT	2	12	227659	227670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816829
87	NC_017470	CTATCG	2	12	230595	230606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385816831
88	NC_017470	GTTTTT	2	12	231665	231676	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385816832
89	NC_017470	GATTAT	2	12	235674	235685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385816835
90	NC_017470	GAAGAC	2	12	238463	238474	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385816839
91	NC_017470	ACGATG	2	12	238701	238712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385816839
92	NC_017470	CGTCAC	2	12	240231	240242	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385816840
93	NC_017470	CACCAA	2	12	246479	246490	50 %	0 %	0 %	50 %	385816846
94	NC_017470	CAGGTC	2	12	249809	249820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385816850
95	NC_017470	AAAATA	2	12	257179	257190	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385816858
96	NC_017470	CGTTGT	2	12	257281	257292	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385816859
97	NC_017470	TCACCG	2	12	257391	257402	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385816859
98	NC_017470	GTTAAG	2	12	262947	262958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816863
99	NC_017470	AGTTGA	2	12	263266	263277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816864
100	NC_017470	GATATG	2	12	267058	267069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816868
101	NC_017470	ATTAGA	2	12	267082	267093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385816868
102	NC_017470	CAAGAT	2	12	267368	267379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385816869
103	NC_017470	TTTAAT	2	12	267493	267504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816869
104	NC_017470	TGCACC	2	12	268084	268095	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385816869
105	NC_017470	TTCATA	2	12	271726	271737	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385816872
106	NC_017470	ATCAAA	2	12	273137	273148	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385816873
107	NC_017470	GGTAAG	2	12	277734	277745	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385816877
108	NC_017470	CAGCAC	2	12	281482	281493	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385816880
109	NC_017470	AAGTGC	2	12	282434	282445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385816880
110	NC_017470	ATTCTT	2	12	282659	282670	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385816880
111	NC_017470	AAACGA	2	12	286687	286698	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385816881
112	NC_017470	GTGAAG	2	12	288891	288902	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385816882
113	NC_017470	CTGGTA	2	12	290898	290909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385816882
114	NC_017470	AAATAA	2	12	291523	291534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385816883
115	NC_017470	AAAAGC	2	12	291611	291622	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385816883
116	NC_017470	AATCAC	2	12	297306	297317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385816891
117	NC_017470	GCAGAT	2	12	298124	298135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385816892
118	NC_017470	AGAAAA	2	12	299877	299888	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385816896
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121	NC_017470	CTCGTA	2	12	307010	307021	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385816912
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220	NC_017470	TCCTGC	2	12	578235	578246	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385817178
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226	NC_017470	AAGCCA	2	12	585839	585850	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385817186
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229	NC_017470	AACTGA	2	12	587605	587616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385817186
230	NC_017470	AATGGA	2	12	588075	588086	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385817186
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452	NC_017470	ATAAGC	2	12	1163536	1163547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385817739
453	NC_017470	TTATCA	2	12	1163696	1163707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385817739
454	NC_017470	AAAATC	2	12	1164208	1164219	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385817739
455	NC_017470	ACTGAT	2	12	1165684	1165695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385817740
456	NC_017470	TTTGAC	2	12	1165810	1165821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385817740
457	NC_017470	CTTTAG	2	12	1168374	1168385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385817741
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460	NC_017470	ATCTAC	2	12	1173066	1173077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385817743
461	NC_017470	TGAACT	2	12	1173178	1173189	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385817743
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