MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 chromosome

Total Repeats: 1155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017470	AGCAA	2	10	3473	3482	60 %	0 %	20 %	20 %	385816615
2	NC_017470	ATTTT	2	10	3514	3523	20 %	80 %	0 %	0 %	385816615
3	NC_017470	AAGGC	2	10	3680	3689	40 %	0 %	40 %	20 %	385816615
4	NC_017470	GATGA	2	10	4804	4813	40 %	20 %	40 %	0 %	385816616
5	NC_017470	CAAGG	2	10	5974	5983	40 %	0 %	40 %	20 %	385816616
6	NC_017470	CAAAA	2	10	12228	12237	80 %	0 %	0 %	20 %	385816621
7	NC_017470	TGGTT	2	10	14638	14647	0 %	60 %	40 %	0 %	385816624
8	NC_017470	TATGC	2	10	15829	15838	20 %	40 %	20 %	20 %	385816625
9	NC_017470	AGAAA	2	10	16503	16512	80 %	0 %	20 %	0 %	385816626
10	NC_017470	TTCTT	2	10	19775	19784	0 %	80 %	0 %	20 %	385816630
11	NC_017470	ACAAT	2	10	22309	22318	60 %	20 %	0 %	20 %	385816634
12	NC_017470	GATAG	2	10	22674	22683	40 %	20 %	40 %	0 %	385816635
13	NC_017470	TAATT	2	10	23322	23331	40 %	60 %	0 %	0 %	385816635
14	NC_017470	AATTT	2	10	28925	28934	40 %	60 %	0 %	0 %	385816641
15	NC_017470	TTTGC	2	10	29390	29399	0 %	60 %	20 %	20 %	385816642
16	NC_017470	TTGAT	2	10	29516	29525	20 %	60 %	20 %	0 %	385816642
17	NC_017470	TAAAC	2	10	31282	31291	60 %	20 %	0 %	20 %	385816642
18	NC_017470	CATTA	2	10	32163	32172	40 %	40 %	0 %	20 %	385816643
19	NC_017470	AATTA	2	10	33450	33459	60 %	40 %	0 %	0 %	385816645
20	NC_017470	CTGGT	2	10	34025	34034	0 %	40 %	40 %	20 %	385816646
21	NC_017470	TCATT	2	10	34430	34439	20 %	60 %	0 %	20 %	385816646
22	NC_017470	TAGCT	2	10	36201	36210	20 %	40 %	20 %	20 %	385816648
23	NC_017470	TTTTC	2	10	37120	37129	0 %	80 %	0 %	20 %	385816649
24	NC_017470	CTTTT	2	10	39627	39636	0 %	80 %	0 %	20 %	385816651
25	NC_017470	TTTGC	2	10	40149	40158	0 %	60 %	20 %	20 %	385816652
26	NC_017470	TGATT	2	10	40511	40520	20 %	60 %	20 %	0 %	385816652
27	NC_017470	GTGCG	2	10	42330	42339	0 %	20 %	60 %	20 %	385816653
28	NC_017470	TAAAA	2	10	42771	42780	80 %	20 %	0 %	0 %	385816653
29	NC_017470	GATCA	2	10	43049	43058	40 %	20 %	20 %	20 %	385816654
30	NC_017470	GTGAA	2	10	45933	45942	40 %	20 %	40 %	0 %	385816657
31	NC_017470	TTTAC	2	10	49660	49669	20 %	60 %	0 %	20 %	385816659
32	NC_017470	TTGCT	2	10	50048	50057	0 %	60 %	20 %	20 %	385816659
33	NC_017470	AAAAT	2	10	51383	51392	80 %	20 %	0 %	0 %	385816659
34	NC_017470	TAATG	2	10	54034	54043	40 %	40 %	20 %	0 %	385816661
35	NC_017470	GAGAA	2	10	57649	57658	60 %	0 %	40 %	0 %	385816663
36	NC_017470	TGAGT	2	10	61747	61756	20 %	40 %	40 %	0 %	385816664
37	NC_017470	GCTGG	2	10	62306	62315	0 %	20 %	60 %	20 %	385816666
38	NC_017470	TCGGT	2	10	65328	65337	0 %	40 %	40 %	20 %	385816669
39	NC_017470	ATTGA	2	10	65586	65595	40 %	40 %	20 %	0 %	385816669
40	NC_017470	ATTGA	2	10	66913	66922	40 %	40 %	20 %	0 %	385816670
41	NC_017470	AATTT	2	10	69299	69308	40 %	60 %	0 %	0 %	385816674
42	NC_017470	TAGAA	2	10	70513	70522	60 %	20 %	20 %	0 %	385816675
43	NC_017470	ATGTT	2	10	70710	70719	20 %	60 %	20 %	0 %	385816675
44	NC_017470	TAAAT	2	10	71276	71285	60 %	40 %	0 %	0 %	385816676
45	NC_017470	AAAGA	2	10	71399	71408	80 %	0 %	20 %	0 %	385816676
46	NC_017470	TTGGC	2	10	73894	73903	0 %	40 %	40 %	20 %	385816678
47	NC_017470	TTCAC	2	10	77231	77240	20 %	40 %	0 %	40 %	385816681
48	NC_017470	GCAAA	2	10	77881	77890	60 %	0 %	20 %	20 %	385816682
49	NC_017470	GATAT	2	10	78675	78684	40 %	40 %	20 %	0 %	385816683
50	NC_017470	TAAAT	2	10	78829	78838	60 %	40 %	0 %	0 %	385816683
51	NC_017470	TTCAC	2	10	81809	81818	20 %	40 %	0 %	40 %	385816687
52	NC_017470	GCAAA	2	10	82459	82468	60 %	0 %	20 %	20 %	385816688
53	NC_017470	ATGAA	2	10	83540	83549	60 %	20 %	20 %	0 %	385816690
54	NC_017470	CTTAT	2	10	84965	84974	20 %	60 %	0 %	20 %	385816691
55	NC_017470	ATCAA	2	10	85450	85459	60 %	20 %	0 %	20 %	385816691
56	NC_017470	TAAAT	2	10	85547	85556	60 %	40 %	0 %	0 %	385816691
57	NC_017470	TGATG	2	10	85878	85887	20 %	40 %	40 %	0 %	385816692
58	NC_017470	TACAT	2	10	86488	86497	40 %	40 %	0 %	20 %	385816692
59	NC_017470	TCGAA	2	10	89928	89937	40 %	20 %	20 %	20 %	385816696
60	NC_017470	CAAAA	2	10	90763	90772	80 %	0 %	0 %	20 %	385816696
61	NC_017470	CCTTA	2	10	90989	90998	20 %	40 %	0 %	40 %	385816696
62	NC_017470	TTGTG	2	10	91098	91107	0 %	60 %	40 %	0 %	385816697
63	NC_017470	AATAA	2	10	96478	96487	80 %	20 %	0 %	0 %	385816702
64	NC_017470	GATTA	2	10	96750	96759	40 %	40 %	20 %	0 %	385816702
65	NC_017470	AATGC	2	10	96766	96775	40 %	20 %	20 %	20 %	385816702
66	NC_017470	TTTAA	2	10	98202	98211	40 %	60 %	0 %	0 %	385816704
67	NC_017470	GGTAA	2	10	98508	98517	40 %	20 %	40 %	0 %	385816704
68	NC_017470	TTAAA	2	10	101962	101971	60 %	40 %	0 %	0 %	385816708
69	NC_017470	GAAAA	2	10	105559	105568	80 %	0 %	20 %	0 %	385816712
70	NC_017470	TAAAT	2	10	107575	107584	60 %	40 %	0 %	0 %	385816713
71	NC_017470	AACCA	2	10	107763	107772	60 %	0 %	0 %	40 %	385816714
72	NC_017470	AGATG	2	10	108619	108628	40 %	20 %	40 %	0 %	385816715
73	NC_017470	ATGCC	2	10	109394	109403	20 %	20 %	20 %	40 %	385816717
74	NC_017470	AGACA	2	10	110616	110625	60 %	0 %	20 %	20 %	385816718
75	NC_017470	TGATG	2	10	110883	110892	20 %	40 %	40 %	0 %	385816718
76	NC_017470	AAGTA	2	10	112375	112384	60 %	20 %	20 %	0 %	385816719
77	NC_017470	CTAAA	2	10	112532	112541	60 %	20 %	0 %	20 %	385816719
78	NC_017470	AAATT	2	10	118989	118998	60 %	40 %	0 %	0 %	385816726
79	NC_017470	CTTTT	2	10	119805	119814	0 %	80 %	0 %	20 %	385816727
80	NC_017470	TTGGC	2	10	121191	121200	0 %	40 %	40 %	20 %	385816729
81	NC_017470	TGATC	2	10	122604	122613	20 %	40 %	20 %	20 %	385816731
82	NC_017470	ATTAC	2	10	128355	128364	40 %	40 %	0 %	20 %	385816737
83	NC_017470	GCTTG	2	10	129169	129178	0 %	40 %	40 %	20 %	385816738
84	NC_017470	TAATG	2	10	129274	129283	40 %	40 %	20 %	0 %	385816738
85	NC_017470	ATGGA	2	10	131246	131255	40 %	20 %	40 %	0 %	385816740
86	NC_017470	AGAAA	2	10	133596	133605	80 %	0 %	20 %	0 %	385816742
87	NC_017470	AGCAA	2	10	134704	134713	60 %	0 %	20 %	20 %	385816743
88	NC_017470	ATTTT	2	10	135206	135215	20 %	80 %	0 %	0 %	385816744
89	NC_017470	CAACT	2	10	137235	137244	40 %	20 %	0 %	40 %	385816745
90	NC_017470	ACGCA	2	10	139140	139149	40 %	0 %	20 %	40 %	385816747
91	NC_017470	AATGG	2	10	141109	141118	40 %	20 %	40 %	0 %	385816749
92	NC_017470	TTTCT	2	10	141198	141207	0 %	80 %	0 %	20 %	385816750
93	NC_017470	TTCAA	2	10	141472	141481	40 %	40 %	0 %	20 %	385816750
94	NC_017470	AACTT	2	10	143252	143261	40 %	40 %	0 %	20 %	385816750
95	NC_017470	ACAGA	2	10	144403	144412	60 %	0 %	20 %	20 %	385816751
96	NC_017470	TTTAC	2	10	149498	149507	20 %	60 %	0 %	20 %	385816756
97	NC_017470	TCATT	2	10	151601	151610	20 %	60 %	0 %	20 %	385816759
98	NC_017470	TTGGT	2	10	151976	151985	0 %	60 %	40 %	0 %	385816759
99	NC_017470	CAAGA	2	10	152949	152958	60 %	0 %	20 %	20 %	385816761
100	NC_017470	TATTT	2	10	154828	154837	20 %	80 %	0 %	0 %	385816762
101	NC_017470	TGATT	2	10	156078	156087	20 %	60 %	20 %	0 %	385816763
102	NC_017470	AAGTT	2	10	156131	156140	40 %	40 %	20 %	0 %	385816763
103	NC_017470	TATGG	2	10	156976	156985	20 %	40 %	40 %	0 %	385816764
104	NC_017470	GATAG	2	10	158638	158647	40 %	20 %	40 %	0 %	385816765
105	NC_017470	GGAAC	2	10	164368	164377	40 %	0 %	40 %	20 %	385816770
106	NC_017470	ATTCC	2	10	164763	164772	20 %	40 %	0 %	40 %	385816770
107	NC_017470	AATAA	2	10	167966	167975	80 %	20 %	0 %	0 %	385816774
108	NC_017470	CATAA	2	10	170168	170177	60 %	20 %	0 %	20 %	385816775
109	NC_017470	ATATC	2	10	172163	172172	40 %	40 %	0 %	20 %	385816779
110	NC_017470	ATTTA	2	10	172261	172270	40 %	60 %	0 %	0 %	385816779
111	NC_017470	CCTTG	2	10	173614	173623	0 %	40 %	20 %	40 %	385816780
112	NC_017470	ATTTT	2	10	182839	182848	20 %	80 %	0 %	0 %	385816788
113	NC_017470	TAAGG	2	10	183357	183366	40 %	20 %	40 %	0 %	385816788
114	NC_017470	ATCGA	2	10	186492	186501	40 %	20 %	20 %	20 %	385816791
115	NC_017470	GGTTG	2	10	186884	186893	0 %	40 %	60 %	0 %	385816792
116	NC_017470	AATCA	2	10	187826	187835	60 %	20 %	0 %	20 %	385816793
117	NC_017470	CCTAA	2	10	188198	188207	40 %	20 %	0 %	40 %	385816793
118	NC_017470	TAAAT	2	10	188854	188863	60 %	40 %	0 %	0 %	385816794
119	NC_017470	TACTT	2	10	189184	189193	20 %	60 %	0 %	20 %	385816795
120	NC_017470	ACAAG	2	10	192633	192642	60 %	0 %	20 %	20 %	385816797
121	NC_017470	ATATG	2	10	193738	193747	40 %	40 %	20 %	0 %	385816797
122	NC_017470	CAAAC	2	10	193979	193988	60 %	0 %	0 %	40 %	385816798
123	NC_017470	TATTT	2	10	194146	194155	20 %	80 %	0 %	0 %	385816798
124	NC_017470	ATTCC	2	10	194751	194760	20 %	40 %	0 %	40 %	385816798
125	NC_017470	ATTAA	2	10	194992	195001	60 %	40 %	0 %	0 %	385816798
126	NC_017470	GGCGC	2	10	195290	195299	0 %	0 %	60 %	40 %	385816799
127	NC_017470	CCATT	2	10	195914	195923	20 %	40 %	0 %	40 %	385816799
128	NC_017470	TGGTT	2	10	197877	197886	0 %	60 %	40 %	0 %	385816802
129	NC_017470	AAGAA	2	10	197903	197912	80 %	0 %	20 %	0 %	385816802
130	NC_017470	CACGA	2	10	198822	198831	40 %	0 %	20 %	40 %	385816803
131	NC_017470	TTTAC	2	10	199766	199775	20 %	60 %	0 %	20 %	385816804
132	NC_017470	TTTAC	2	10	201459	201468	20 %	60 %	0 %	20 %	385816805
133	NC_017470	CGAAG	2	10	204385	204394	40 %	0 %	40 %	20 %	385816807
134	NC_017470	TGATT	2	10	208823	208832	20 %	60 %	20 %	0 %	385816811
135	NC_017470	TAAAC	2	10	209177	209186	60 %	20 %	0 %	20 %	385816812
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