MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 chromosome

Total Repeats: 24402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017470	ACG	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816612
2	NC_017470	TAC	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816612
3	NC_017470	AAC	2	6	370	375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816612
4	NC_017470	TGC	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816612
5	NC_017470	AGT	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816612
6	NC_017470	TTA	2	6	634	639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816612
7	NC_017470	TTA	2	6	696	701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816612
8	NC_017470	AAG	2	6	745	750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816612
9	NC_017470	TTC	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816612
10	NC_017470	TGA	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816612
11	NC_017470	CTC	2	6	889	894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385816612
12	NC_017470	GAA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816612
13	NC_017470	TGA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816612
14	NC_017470	CTA	2	6	1045	1050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816612
15	NC_017470	TCA	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816613
16	NC_017470	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816613
17	NC_017470	AGA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816613
18	NC_017470	AGT	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816613
19	NC_017470	AAT	2	6	1937	1942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816613
20	NC_017470	CAT	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816613
21	NC_017470	ATT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816613
22	NC_017470	ATT	2	6	2216	2221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816613
23	NC_017470	CAA	2	6	2434	2439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816613
24	NC_017470	AGA	3	9	2515	2523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816613
25	NC_017470	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816613
26	NC_017470	TCA	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816613
27	NC_017470	AGA	2	6	2671	2676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816613
28	NC_017470	TTA	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816613
29	NC_017470	TAT	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816614
30	NC_017470	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385816614
31	NC_017470	AGC	2	6	3093	3098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816614
32	NC_017470	AAT	2	6	3337	3342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816615
33	NC_017470	TTA	2	6	3382	3387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816615
34	NC_017470	AGA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816615
35	NC_017470	AGA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816615
36	NC_017470	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816615
37	NC_017470	CGC	2	6	3757	3762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385816615
38	NC_017470	ATC	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816615
39	NC_017470	ATA	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816615
40	NC_017470	ACT	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816615
41	NC_017470	GAT	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816615
42	NC_017470	GCA	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816615
43	NC_017470	GAT	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816615
44	NC_017470	GTC	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816615
45	NC_017470	CTT	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816615
46	NC_017470	TTA	2	6	4199	4204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816615
47	NC_017470	AAG	2	6	4243	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816615
48	NC_017470	GGT	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816616
49	NC_017470	ATT	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816616
50	NC_017470	CCA	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816616
51	NC_017470	GAT	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816616
52	NC_017470	GTC	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816616
53	NC_017470	TTC	2	6	4640	4645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816616
54	NC_017470	CGG	2	6	4650	4655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385816616
55	NC_017470	GGT	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816616
56	NC_017470	GTT	2	6	4714	4719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816616
57	NC_017470	AAG	2	6	4765	4770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816616
58	NC_017470	GAC	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816616
59	NC_017470	GGT	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816616
60	NC_017470	AAG	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816616
61	NC_017470	TGA	2	6	5073	5078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816616
62	NC_017470	AAC	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816616
63	NC_017470	GTT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816616
64	NC_017470	CTG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816616
65	NC_017470	CTG	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816616
66	NC_017470	ACA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816616
67	NC_017470	TCG	2	6	5627	5632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816616
68	NC_017470	GGT	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816616
69	NC_017470	CTT	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816616
70	NC_017470	GAA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816616
71	NC_017470	ACT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816616
72	NC_017470	AGT	2	6	6054	6059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816616
73	NC_017470	AAC	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816616
74	NC_017470	AAC	2	6	6108	6113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816616
75	NC_017470	AGG	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385816616
76	NC_017470	ATG	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
77	NC_017470	CTT	2	6	6346	6351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816617
78	NC_017470	CGT	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816617
79	NC_017470	AAG	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816617
80	NC_017470	TTG	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
81	NC_017470	TCA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
82	NC_017470	TGA	2	6	6628	6633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
83	NC_017470	GAT	2	6	6734	6739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
84	NC_017470	AGT	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
85	NC_017470	TTA	2	6	6855	6860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816617
86	NC_017470	TGA	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
87	NC_017470	CTA	2	6	6894	6899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
88	NC_017470	TGA	2	6	6909	6914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
89	NC_017470	GTT	2	6	7007	7012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
90	NC_017470	ATC	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
91	NC_017470	TGA	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
92	NC_017470	GTT	2	6	7226	7231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
93	NC_017470	AAC	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816617
94	NC_017470	TTG	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
95	NC_017470	CAC	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816617
96	NC_017470	TAC	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
97	NC_017470	AAG	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816617
98	NC_017470	TGT	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
99	NC_017470	ACA	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816617
100	NC_017470	CAT	2	6	7468	7473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
101	NC_017470	TGA	2	6	7531	7536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
102	NC_017470	GTT	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816617
103	NC_017470	GTG	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816617
104	NC_017470	AAG	2	6	7988	7993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816617
105	NC_017470	AGT	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
106	NC_017470	GAT	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816617
107	NC_017470	ACT	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
108	NC_017470	GTG	2	6	8481	8486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816617
109	NC_017470	CAT	2	6	8566	8571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
110	NC_017470	TAC	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816617
111	NC_017470	TAA	2	6	8738	8743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816617
112	NC_017470	CAT	2	6	8991	8996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816618
113	NC_017470	ACA	2	6	9017	9022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816618
114	NC_017470	GGT	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816618
115	NC_017470	CGT	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816618
116	NC_017470	CTG	2	6	9164	9169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816618
117	NC_017470	TTG	2	6	9323	9328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816619
118	NC_017470	TAC	2	6	9357	9362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816619
119	NC_017470	CAG	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816619
120	NC_017470	ATA	2	6	9551	9556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
121	NC_017470	GTT	3	9	9586	9594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816619
122	NC_017470	TGG	2	6	9648	9653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816619
123	NC_017470	AAT	2	6	9664	9669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
124	NC_017470	ATA	2	6	9674	9679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
125	NC_017470	AAT	2	6	9706	9711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
126	NC_017470	AAT	2	6	9727	9732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
127	NC_017470	AAT	2	6	9739	9744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
128	NC_017470	AAT	2	6	9754	9759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816619
129	NC_017470	TGA	3	9	9804	9812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816619
130	NC_017470	CAA	2	6	9860	9865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385816620
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255	NC_017470	ATG	2	6	19425	19430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816630
256	NC_017470	TTG	2	6	19452	19457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816630
257	NC_017470	TAT	2	6	19531	19536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816630
258	NC_017470	TCA	2	6	19638	19643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816630
259	NC_017470	ATG	2	6	19659	19664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816630
260	NC_017470	GGC	2	6	19727	19732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385816630
261	NC_017470	TGT	2	6	19754	19759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816630
262	NC_017470	GGC	2	6	19832	19837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385816630
263	NC_017470	CAC	2	6	19996	20001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385816630
264	NC_017470	GGC	2	6	20006	20011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385816630
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267	NC_017470	ATT	2	6	20563	20568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816631
268	NC_017470	ATT	2	6	20719	20724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816632
269	NC_017470	TGA	2	6	20732	20737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816632
270	NC_017470	TGA	2	6	20858	20863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385816633
271	NC_017470	TGC	2	6	21073	21078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816633
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273	NC_017470	AAT	2	6	21186	21191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816633
274	NC_017470	TGC	2	6	21291	21296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816633
275	NC_017470	TGG	2	6	21373	21378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385816633
276	NC_017470	TAT	2	6	21381	21386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816633
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279	NC_017470	TTC	2	6	21496	21501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816633
280	NC_017470	AGC	2	6	21607	21612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816633
281	NC_017470	ATA	2	6	21632	21637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816633
282	NC_017470	TAA	2	6	21953	21958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816634
283	NC_017470	AAT	2	6	21972	21977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816634
284	NC_017470	GAA	2	6	21990	21995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816634
285	NC_017470	CGA	2	6	22145	22150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385816634
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288	NC_017470	CTT	2	6	22538	22543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816635
289	NC_017470	TCT	2	6	22552	22557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816635
290	NC_017470	TTA	2	6	22633	22638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385816635
291	NC_017470	TCT	2	6	22687	22692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816635
292	NC_017470	TTG	2	6	22701	22706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385816635
293	NC_017470	AAG	2	6	22724	22729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385816635
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295	NC_017470	AAT	2	6	22770	22775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816635
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302	NC_017470	CTT	2	6	23228	23233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385816635
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357	NC_017470	TCG	2	6	27207	27212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385816638
358	NC_017470	CTA	2	6	27365	27370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816638
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373	NC_017470	ATA	2	6	29271	29276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385816641
374	NC_017470	ATC	2	6	29382	29387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816642
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376	NC_017470	CAT	2	6	29414	29419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385816642
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