MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus 2038 chromosome

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017469	TCTTTT	2	12	10424	10435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017469	TGAAAA	2	12	26831	26842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017469	TGGCAA	2	12	40587	40598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017469	TTAATA	2	12	41071	41082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017469	TGAAAA	2	12	49251	49262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017469	ATTTTT	2	12	57383	57394	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017469	AAAAGC	2	12	91750	91761	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017469	CGGCAG	2	12	110645	110656	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017469	TTTTGA	2	12	157404	157415	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017469	TGAGCG	2	12	161743	161754	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017469	TTACTT	2	12	185540	185551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017469	AAGTTT	2	12	200618	200629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017469	TCGAAA	2	12	205154	205165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017469	ACCAGG	2	12	256294	256305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017469	ATAACA	2	12	258807	258818	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017469	TCATTT	2	12	260725	260736	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017469	GAAGGA	2	12	267659	267670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017469	TGGTGA	2	12	267773	267784	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017469	ATCTGA	2	12	274344	274355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017469	GATCGT	2	12	277375	277386	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017469	GCAAGG	2	12	316077	316088	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017469	GTTGAA	2	12	316913	316924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017469	AGCATC	2	12	355722	355733	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017469	TTTATA	2	12	355798	355809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017469	AAAATG	2	12	356621	356632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017469	AAGCAA	2	12	410189	410200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017469	TTGTCA	2	12	419880	419891	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017469	ATAACA	2	12	420686	420697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017469	GCCGGG	2	12	426659	426670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017469	GAAAAA	2	12	457621	457632	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017469	TACTTG	2	12	459830	459841	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017469	GTCTTT	2	12	507051	507062	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017469	AAAAGC	2	12	521984	521995	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017469	AGCTTT	2	12	523739	523750	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017469	AAGTAA	2	12	540450	540461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017469	AGAAAA	2	12	542074	542085	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017469	AATTAA	2	12	596922	596933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017469	GATCAA	2	12	616070	616081	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017469	CTTTTT	2	12	616843	616854	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017469	AAAAAT	2	12	616937	616948	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017469	TCTTTT	2	12	651461	651472	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017469	AAAAGA	2	12	655547	655558	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017469	TCATGC	2	12	656411	656422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017469	TTAAAA	2	12	656431	656442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017469	TTCCTT	2	12	665897	665908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017469	TGGCAA	2	12	685798	685809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017469	GACAAA	2	12	711171	711182	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017469	AAAAAT	2	12	746235	746246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017469	GAAAAA	2	12	749089	749100	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017469	CTGGTG	2	12	756270	756281	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017469	GCAATT	2	12	784789	784800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017469	TGGCAA	2	12	793928	793939	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017469	TACTCA	2	12	809224	809235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017469	GAAACT	2	12	812351	812362	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017469	AGAAGC	2	12	820829	820840	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017469	TGGCAA	2	12	825951	825962	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017469	CAAGAA	2	12	831542	831553	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017469	CTGCTT	2	12	894006	894017	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017469	AATTTT	2	12	910939	910950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017469	TCTTTT	2	12	922173	922184	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017469	GAACTG	2	12	942202	942213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017469	TCTTTC	2	12	962204	962215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017469	TCCCCC	2	12	971028	971039	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
64	NC_017469	CCAGTT	2	12	979462	979473	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017469	GAAAAG	2	12	987985	987996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017469	TCCCCT	2	12	1002487	1002498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017469	AAAGAA	2	12	1011363	1011374	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017469	TTTAAC	2	12	1067970	1067981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017469	CTGCCG	2	12	1102564	1102575	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017469	TTTTCT	2	12	1105902	1105913	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017469	TTTTTC	2	12	1136277	1136288	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017469	ATTTTT	2	12	1136294	1136305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017469	AAAAAG	2	12	1136318	1136329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017469	GAAAAT	2	12	1149542	1149553	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017469	ACGATA	2	12	1150161	1150172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017469	GAGGAC	2	12	1155584	1155595	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017469	GTCATA	2	12	1155677	1155688	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017469	GTTCCC	2	12	1235451	1235462	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017469	CATTTT	2	12	1250513	1250524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017469	TTTTCT	2	12	1254992	1255003	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017469	GAAGCA	2	12	1301355	1301366	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017469	ATACAG	2	12	1354708	1354719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017469	AGAAAA	2	12	1387849	1387860	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017469	GCCAAA	2	12	1390228	1390239	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017469	TTCCAG	2	12	1401113	1401124	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017469	TGTGAA	2	12	1450804	1450815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017469	TAGACA	2	12	1468914	1468925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017469	GCACTT	2	12	1554661	1554672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017469	TCAAAG	2	12	1557785	1557796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017469	TAAGGT	2	12	1565061	1565072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017469	CCTAAA	2	12	1568010	1568021	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017469	CCCTTG	2	12	1616598	1616609	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017469	AAACTA	2	12	1617844	1617855	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017469	ATAGTT	2	12	1624548	1624559	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017469	ATGAAT	2	12	1656429	1656440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017469	CCAGGC	2	12	1667223	1667234	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017469	TATGAC	2	12	1678414	1678425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017469	GTTATT	2	12	1684995	1685006	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017469	CTCTTT	2	12	1698933	1698944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017469	GCTTTT	2	12	1700323	1700334	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017469	AGTCTC	2	12	1716783	1716794	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017469	AATAAA	2	12	1747624	1747635	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017469	CACAAA	2	12	1771732	1771743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017469	TTTTCA	2	12	1779740	1779751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017469	TGGCAA	2	12	1786807	1786818	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017469	CTTAAG	2	12	1788074	1788085	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017469	ATAAAA	2	12	1811899	1811910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017469	ATTTTT	2	12	1820564	1820575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017469	TCTTTT	2	12	1826014	1826025	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017469	AGGAAT	2	12	1842811	1842822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017469	TAACAA	2	12	1860737	1860748	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017469	GCCTGA	2	12	1872836	1872847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.