MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus H10 plasmid pH10

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017468	CAAA	2	8	221	228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017468	TGTC	2	8	523	530	0 %	50 %	25 %	25 %	385814793
3	NC_017468	GTTT	2	8	928	935	0 %	75 %	25 %	0 %	385814793
4	NC_017468	AAGA	2	8	1046	1053	75 %	0 %	25 %	0 %	385814793
5	NC_017468	AAGA	2	8	1573	1580	75 %	0 %	25 %	0 %	385814793
6	NC_017468	AAAT	2	8	1674	1681	75 %	25 %	0 %	0 %	385814793
7	NC_017468	TTCG	2	8	1904	1911	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017468	GCCA	2	8	2081	2088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017468	AGAA	2	8	2170	2177	75 %	0 %	25 %	0 %	385814794
10	NC_017468	TATT	2	8	2519	2526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017468	TAAA	2	8	2721	2728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017468	TGCC	2	8	2980	2987	0 %	25 %	25 %	50 %	385814795
13	NC_017468	ATTT	2	8	4311	4318	25 %	75 %	0 %	0 %	385814796
14	NC_017468	ATCA	2	8	5425	5432	50 %	25 %	0 %	25 %	385814797
15	NC_017468	AGCT	2	8	5795	5802	25 %	25 %	25 %	25 %	385814797
16	NC_017468	ATTT	2	8	6257	6264	25 %	75 %	0 %	0 %	385814797
17	NC_017468	TGAT	2	8	6308	6315	25 %	50 %	25 %	0 %	385814797
18	NC_017468	TTCA	2	8	7449	7456	25 %	50 %	0 %	25 %	385814800
19	NC_017468	ATTT	2	8	8341	8348	25 %	75 %	0 %	0 %	385814801
20	NC_017468	TTGC	2	8	8377	8384	0 %	50 %	25 %	25 %	385814801
21	NC_017468	GAGT	2	8	8597	8604	25 %	25 %	50 %	0 %	385814801
22	NC_017468	CTTG	2	8	9866	9873	0 %	50 %	25 %	25 %	385814803
23	NC_017468	TTTA	2	8	9897	9904	25 %	75 %	0 %	0 %	385814803
24	NC_017468	TGCT	2	8	9951	9958	0 %	50 %	25 %	25 %	385814803
25	NC_017468	TGAT	2	8	9964	9971	25 %	50 %	25 %	0 %	385814803
26	NC_017468	ATTT	2	8	10404	10411	25 %	75 %	0 %	0 %	385814803
27	NC_017468	TAAC	2	8	12121	12128	50 %	25 %	0 %	25 %	385814804
28	NC_017468	TTTA	2	8	12338	12345	25 %	75 %	0 %	0 %	385814804
29	NC_017468	TAAT	2	8	12430	12437	50 %	50 %	0 %	0 %	385814804
30	NC_017468	CAAC	2	8	12838	12845	50 %	0 %	0 %	50 %	385814804
31	NC_017468	TTGC	2	8	12887	12894	0 %	50 %	25 %	25 %	385814804
32	NC_017468	TCTT	2	8	13152	13159	0 %	75 %	0 %	25 %	385814804
33	NC_017468	CGGG	2	8	13244	13251	0 %	0 %	75 %	25 %	385814804
34	NC_017468	ATTC	2	8	13473	13480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017468	CAAA	2	8	13743	13750	75 %	0 %	0 %	25 %	385814805
36	NC_017468	GTTC	2	8	14372	14379	0 %	50 %	25 %	25 %	385814807
37	NC_017468	CCAC	2	8	14751	14758	25 %	0 %	0 %	75 %	385814807
38	NC_017468	TCTT	2	8	15779	15786	0 %	75 %	0 %	25 %	385814808
39	NC_017468	TCTA	2	8	15794	15801	25 %	50 %	0 %	25 %	385814808
40	NC_017468	TTCT	2	8	16112	16119	0 %	75 %	0 %	25 %	385814808
41	NC_017468	TTTG	2	8	16371	16378	0 %	75 %	25 %	0 %	385814808
42	NC_017468	TGTC	2	8	16535	16542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017468	ATTT	2	8	16644	16651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017468	TAAT	2	8	16695	16702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017468	GACG	2	8	17185	17192	25 %	0 %	50 %	25 %	385814809
46	NC_017468	ATCA	2	8	17662	17669	50 %	25 %	0 %	25 %	385814810
47	NC_017468	TTTC	2	8	18420	18427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017468	TATT	2	8	18482	18489	25 %	75 %	0 %	0 %	385814811
49	NC_017468	AAAG	2	8	18849	18856	75 %	0 %	25 %	0 %	385814811
50	NC_017468	CTTT	2	8	19067	19074	0 %	75 %	0 %	25 %	385814811
51	NC_017468	TGAA	2	8	19424	19431	50 %	25 %	25 %	0 %	385814811
52	NC_017468	TAGA	2	8	19460	19467	50 %	25 %	25 %	0 %	385814811
53	NC_017468	ATCA	2	8	20283	20290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017468	AATA	2	8	20463	20470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017468	AGTG	2	8	21223	21230	25 %	25 %	50 %	0 %	385814812
56	NC_017468	GGCT	2	8	21422	21429	0 %	25 %	50 %	25 %	385814812
57	NC_017468	TTGC	2	8	21623	21630	0 %	50 %	25 %	25 %	385814812
58	NC_017468	TATT	2	8	21687	21694	25 %	75 %	0 %	0 %	385814812
59	NC_017468	ATAA	2	8	22074	22081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017468	ACCT	2	8	22749	22756	25 %	25 %	0 %	50 %	385814813
61	NC_017468	TAAA	2	8	23488	23495	75 %	25 %	0 %	0 %	385814814
62	NC_017468	TAAT	2	8	23625	23632	50 %	50 %	0 %	0 %	385814814
63	NC_017468	ATCT	2	8	23738	23745	25 %	50 %	0 %	25 %	385814815
64	NC_017468	ATTA	2	8	24060	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	385814815
65	NC_017468	TTCT	2	8	24272	24279	0 %	75 %	0 %	25 %	385814815
66	NC_017468	GCCA	2	8	24326	24333	25 %	0 %	25 %	50 %	385814815
67	NC_017468	GTTT	2	8	24344	24351	0 %	75 %	25 %	0 %	385814815
68	NC_017468	AGAA	2	8	24372	24379	75 %	0 %	25 %	0 %	385814815
69	NC_017468	TCCA	2	8	24493	24500	25 %	25 %	0 %	50 %	385814815
70	NC_017468	TCTT	2	8	24815	24822	0 %	75 %	0 %	25 %	385814816
71	NC_017468	TCTT	2	8	25091	25098	0 %	75 %	0 %	25 %	385814816
72	NC_017468	ATAC	2	8	25386	25393	50 %	25 %	0 %	25 %	385814817
73	NC_017468	GCTC	2	8	26370	26377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.