MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus H10 plasmid pH10

Total Repeats: 323

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017468	ATA	2	6	65	70	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017468	AAT	2	6	174	179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017468	AGT	2	6	235	240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017468	TAT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814793
5	NC_017468	ATT	2	6	311	316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814793
6	NC_017468	AAT	2	6	326	331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814793
7	NC_017468	CTT	2	6	364	369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814793
8	NC_017468	TGA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814793
9	NC_017468	CAG	2	6	393	398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814793
10	NC_017468	AGA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
11	NC_017468	AGA	2	6	515	520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
12	NC_017468	AAG	2	6	536	541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
13	NC_017468	CAG	3	9	743	751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814793
14	NC_017468	AAG	2	6	839	844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
15	NC_017468	ATT	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814793
16	NC_017468	ATC	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814793
17	NC_017468	TGA	2	6	1057	1062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814793
18	NC_017468	GCA	2	6	1081	1086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814793
19	NC_017468	CTT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814793
20	NC_017468	TGA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814793
21	NC_017468	TCG	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814793
22	NC_017468	GCT	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814793
23	NC_017468	GAA	2	6	1541	1546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
24	NC_017468	TCA	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814793
25	NC_017468	CAG	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814793
26	NC_017468	ATA	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017468	ATT	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017468	TAC	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017468	AAC	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017468	GTT	2	6	2115	2120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017468	ACT	2	6	2178	2183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814794
32	NC_017468	ACA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814794
33	NC_017468	AAT	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814794
34	NC_017468	ATA	2	6	2295	2300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814794
35	NC_017468	CAA	2	6	2368	2373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814794
36	NC_017468	AAT	2	6	2540	2545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017468	ATT	2	6	2565	2570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017468	TAT	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017468	TCG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017468	TAA	2	6	2811	2816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017468	GAA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017468	GTC	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814795
43	NC_017468	TGT	2	6	3006	3011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814795
44	NC_017468	ATC	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814795
45	NC_017468	CTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814795
46	NC_017468	TGC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814795
47	NC_017468	GAT	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814795
48	NC_017468	ATG	2	6	3147	3152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814795
49	NC_017468	TCA	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814795
50	NC_017468	GTT	2	6	3272	3277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814795
51	NC_017468	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814795
52	NC_017468	AAG	2	6	3659	3664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814796
53	NC_017468	TTG	2	6	3890	3895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814796
54	NC_017468	TTC	2	6	4008	4013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814796
55	NC_017468	TTA	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814796
56	NC_017468	TTC	2	6	4038	4043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814796
57	NC_017468	ATC	2	6	4149	4154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814796
58	NC_017468	CAG	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814796
59	NC_017468	CTT	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814796
60	NC_017468	CTT	3	9	4463	4471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814796
61	NC_017468	ATT	3	9	4492	4500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814796
62	NC_017468	CTT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017468	CTA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017468	GGT	2	6	4738	4743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017468	TTG	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017468	TTA	2	6	4930	4935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017468	TAT	2	6	5016	5021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017468	TGA	2	6	5130	5135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814797
69	NC_017468	ATG	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814797
70	NC_017468	TTC	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814797
71	NC_017468	TCA	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814797
72	NC_017468	TGA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814797
73	NC_017468	GGC	2	6	5513	5518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814797
74	NC_017468	ACC	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814797
75	NC_017468	CAG	2	6	5827	5832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814797
76	NC_017468	AAG	2	6	5912	5917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814797
77	NC_017468	ATT	2	6	5951	5956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814797
78	NC_017468	GGC	2	6	6006	6011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814797
79	NC_017468	CAC	2	6	6022	6027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814797
80	NC_017468	CAA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814797
81	NC_017468	CAA	2	6	6247	6252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814797
82	NC_017468	TTA	2	6	6364	6369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814797
83	NC_017468	GGC	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814797
84	NC_017468	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814798
85	NC_017468	GCG	2	6	6481	6486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814798
86	NC_017468	ATG	2	6	6813	6818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814799
87	NC_017468	CAG	2	6	6873	6878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814799
88	NC_017468	CAA	2	6	6906	6911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814799
89	NC_017468	AAC	2	6	6996	7001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814799
90	NC_017468	CAC	2	6	7019	7024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814799
91	NC_017468	CAA	2	6	7311	7316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814800
92	NC_017468	ATG	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814800
93	NC_017468	TAA	2	6	7380	7385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814800
94	NC_017468	AAC	2	6	7416	7421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814800
95	NC_017468	ATA	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814800
96	NC_017468	ATT	2	6	7545	7550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814800
97	NC_017468	TCA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814800
98	NC_017468	CTG	2	6	7632	7637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814800
99	NC_017468	GAT	2	6	7667	7672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814800
100	NC_017468	ATT	2	6	7744	7749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814800
101	NC_017468	TAA	3	9	7869	7877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814800
102	NC_017468	CAC	2	6	7929	7934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814800
103	NC_017468	CAT	2	6	7970	7975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814800
104	NC_017468	TAA	2	6	8021	8026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814800
105	NC_017468	GTT	2	6	8257	8262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
106	NC_017468	GTT	2	6	8296	8301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
107	NC_017468	CAT	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814801
108	NC_017468	TGT	2	6	8364	8369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
109	NC_017468	TTG	3	9	8390	8398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
110	NC_017468	TTA	2	6	8415	8420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814801
111	NC_017468	CTT	2	6	8470	8475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814801
112	NC_017468	TTG	2	6	8520	8525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
113	NC_017468	CCA	2	6	8778	8783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814801
114	NC_017468	AAT	2	6	8881	8886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814801
115	NC_017468	TGA	2	6	8919	8924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814801
116	NC_017468	GGT	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385814801
117	NC_017468	CTT	2	6	9071	9076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814801
118	NC_017468	AAT	2	6	9077	9082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814801
119	NC_017468	ATG	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814801
120	NC_017468	TGT	2	6	9285	9290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
121	NC_017468	CTC	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385814802
122	NC_017468	ATA	2	6	9464	9469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814802
123	NC_017468	GTT	2	6	9557	9562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814802
124	NC_017468	GTT	2	6	9599	9604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017468	AAG	2	6	9928	9933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814803
126	NC_017468	CGG	2	6	9938	9943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814803
127	NC_017468	TTG	2	6	9972	9977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814803
128	NC_017468	CTT	2	6	10038	10043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814803
129	NC_017468	TTC	2	6	10074	10079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814803
130	NC_017468	TCA	3	9	10306	10314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814803
131	NC_017468	GTC	2	6	10378	10383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814803
132	NC_017468	TTC	2	6	10563	10568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814803
133	NC_017468	GTC	2	6	10600	10605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814803
134	NC_017468	TTG	2	6	10626	10631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814803
135	NC_017468	GCT	2	6	10655	10660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814803
136	NC_017468	ATA	2	6	10684	10689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814803
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139	NC_017468	GCT	2	6	11368	11373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814804
140	NC_017468	TGC	2	6	11415	11420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814804
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162	NC_017468	TGT	2	6	13418	13423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017468	CTG	2	6	13517	13522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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246	NC_017468	TAC	2	6	20483	20488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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249	NC_017468	TTA	2	6	20611	20616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_017468	ATT	2	6	21376	21381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814812
260	NC_017468	ACA	2	6	21474	21479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814812
261	NC_017468	TTA	2	6	21492	21497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814812
262	NC_017468	CTA	2	6	21762	21767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814812
263	NC_017468	AAG	2	6	21776	21781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814812
264	NC_017468	TCA	2	6	21835	21840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814812
265	NC_017468	TAA	2	6	21883	21888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814812
266	NC_017468	GCT	3	9	21968	21976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814812
267	NC_017468	ATA	2	6	22006	22011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814812
268	NC_017468	TCC	2	6	22151	22156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_017468	ATG	2	6	22234	22239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017468	TGC	2	6	22285	22290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_017468	ATA	2	6	22291	22296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017468	ATT	2	6	22414	22419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814813
273	NC_017468	AAT	2	6	22511	22516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814813
274	NC_017468	ATT	2	6	22587	22592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814813
275	NC_017468	TAA	2	6	22646	22651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814813
276	NC_017468	TTC	2	6	22668	22673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814813
277	NC_017468	TAT	2	6	22770	22775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814813
278	NC_017468	ATA	2	6	22792	22797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814813
279	NC_017468	TCA	2	6	22798	22803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814813
280	NC_017468	TTG	2	6	22898	22903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814813
281	NC_017468	ATA	2	6	22965	22970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814813
282	NC_017468	AGT	2	6	22995	23000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814813
283	NC_017468	TTA	2	6	23089	23094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814813
284	NC_017468	ATC	2	6	23202	23207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814813
285	NC_017468	TAT	2	6	23309	23314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814813
286	NC_017468	ATC	2	6	23346	23351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814813
287	NC_017468	TTC	2	6	23422	23427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814813
288	NC_017468	TTC	2	6	23449	23454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814814
289	NC_017468	CTA	2	6	23553	23558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814814
290	NC_017468	ATT	2	6	23659	23664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017468	TCT	2	6	23767	23772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814815
292	NC_017468	AGC	2	6	23808	23813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814815
293	NC_017468	TAA	2	6	23892	23897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814815
294	NC_017468	CTG	2	6	23912	23917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814815
295	NC_017468	TAA	2	6	23999	24004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814815
296	NC_017468	CTA	2	6	24085	24090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814815
297	NC_017468	CCA	2	6	24127	24132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814815
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299	NC_017468	ATT	2	6	24702	24707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814815
300	NC_017468	TCA	2	6	24725	24730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814815
301	NC_017468	AAT	2	6	24744	24749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_017468	CCA	2	6	24775	24780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814816
303	NC_017468	TTC	2	6	24803	24808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814816
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309	NC_017468	CTT	2	6	25167	25172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814816
310	NC_017468	CAT	2	6	25350	25355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814817
311	NC_017468	AAT	2	6	25395	25400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814817
312	NC_017468	TCT	2	6	25447	25452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814817
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319	NC_017468	TAA	2	6	26005	26010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814817
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322	NC_017468	ATC	2	6	26248	26253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814817
323	NC_017468	ATT	2	6	26429	26434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.