MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus H10 plasmid pH10

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017468	T	7	7	40	46	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017468	T	6	6	105	110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017468	T	6	6	157	162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017468	A	6	6	185	190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017468	A	7	7	253	259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017468	T	6	6	1989	1994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017468	A	7	7	2054	2060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017468	T	6	6	2411	2416	0 %	100 %	0 %	0 %	385814794
9	NC_017468	A	7	7	2417	2423	100 %	0 %	0 %	0 %	385814794
10	NC_017468	T	6	6	2713	2718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017468	A	6	6	2731	2736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017468	A	8	8	2837	2844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017468	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	385814795
14	NC_017468	A	6	6	3541	3546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017468	T	6	6	3630	3635	0 %	100 %	0 %	0 %	385814796
16	NC_017468	T	6	6	3708	3713	0 %	100 %	0 %	0 %	385814796
17	NC_017468	T	6	6	4183	4188	0 %	100 %	0 %	0 %	385814796
18	NC_017468	A	6	6	4230	4235	100 %	0 %	0 %	0 %	385814796
19	NC_017468	A	8	8	4893	4900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017468	T	6	6	5093	5098	0 %	100 %	0 %	0 %	385814797
21	NC_017468	T	6	6	6548	6553	0 %	100 %	0 %	0 %	385814798
22	NC_017468	T	7	7	6782	6788	0 %	100 %	0 %	0 %	385814799
23	NC_017468	T	6	6	7178	7183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017468	T	6	6	8439	8444	0 %	100 %	0 %	0 %	385814801
25	NC_017468	T	6	6	9750	9755	0 %	100 %	0 %	0 %	385814803
26	NC_017468	A	6	6	10054	10059	100 %	0 %	0 %	0 %	385814803
27	NC_017468	T	6	6	10225	10230	0 %	100 %	0 %	0 %	385814803
28	NC_017468	T	7	7	10384	10390	0 %	100 %	0 %	0 %	385814803
29	NC_017468	T	6	6	10710	10715	0 %	100 %	0 %	0 %	385814803
30	NC_017468	T	7	7	10976	10982	0 %	100 %	0 %	0 %	385814803
31	NC_017468	T	6	6	12666	12671	0 %	100 %	0 %	0 %	385814804
32	NC_017468	T	7	7	12759	12765	0 %	100 %	0 %	0 %	385814804
33	NC_017468	T	6	6	12798	12803	0 %	100 %	0 %	0 %	385814804
34	NC_017468	T	6	6	12817	12822	0 %	100 %	0 %	0 %	385814804
35	NC_017468	T	6	6	13209	13214	0 %	100 %	0 %	0 %	385814804
36	NC_017468	A	7	7	13699	13705	100 %	0 %	0 %	0 %	385814805
37	NC_017468	A	6	6	13929	13934	100 %	0 %	0 %	0 %	385814806
38	NC_017468	A	6	6	14134	14139	100 %	0 %	0 %	0 %	385814806
39	NC_017468	T	6	6	14185	14190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017468	A	6	6	14480	14485	100 %	0 %	0 %	0 %	385814807
41	NC_017468	T	6	6	14558	14563	0 %	100 %	0 %	0 %	385814807
42	NC_017468	A	6	6	14607	14612	100 %	0 %	0 %	0 %	385814807
43	NC_017468	T	6	6	15813	15818	0 %	100 %	0 %	0 %	385814808
44	NC_017468	T	6	6	15879	15884	0 %	100 %	0 %	0 %	385814808
45	NC_017468	T	6	6	15933	15938	0 %	100 %	0 %	0 %	385814808
46	NC_017468	T	6	6	16576	16581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017468	A	6	6	16595	16600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017468	T	7	7	16649	16655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017468	T	6	6	16827	16832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017468	T	6	6	16848	16853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017468	T	6	6	17334	17339	0 %	100 %	0 %	0 %	385814810
52	NC_017468	A	6	6	18349	18354	100 %	0 %	0 %	0 %	385814810
53	NC_017468	T	6	6	18468	18473	0 %	100 %	0 %	0 %	385814811
54	NC_017468	A	7	7	18496	18502	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
55	NC_017468	T	6	6	18793	18798	0 %	100 %	0 %	0 %	385814811
56	NC_017468	A	7	7	18863	18869	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
57	NC_017468	A	7	7	18913	18919	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
58	NC_017468	A	8	8	18959	18966	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
59	NC_017468	A	6	6	18976	18981	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
60	NC_017468	T	7	7	18987	18993	0 %	100 %	0 %	0 %	385814811
61	NC_017468	A	7	7	19182	19188	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
62	NC_017468	A	6	6	19339	19344	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
63	NC_017468	A	8	8	19365	19372	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
64	NC_017468	A	7	7	19375	19381	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
65	NC_017468	A	6	6	19396	19401	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
66	NC_017468	A	6	6	19454	19459	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
67	NC_017468	A	7	7	19581	19587	100 %	0 %	0 %	0 %	385814811
68	NC_017468	T	8	8	19607	19614	0 %	100 %	0 %	0 %	385814811
69	NC_017468	A	7	7	19671	19677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017468	A	6	6	19693	19698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017468	A	7	7	20624	20630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017468	T	6	6	20681	20686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017468	A	6	6	21812	21817	100 %	0 %	0 %	0 %	385814812
74	NC_017468	A	6	6	21842	21847	100 %	0 %	0 %	0 %	385814812
75	NC_017468	A	6	6	21919	21924	100 %	0 %	0 %	0 %	385814812
76	NC_017468	T	6	6	22763	22768	0 %	100 %	0 %	0 %	385814813
77	NC_017468	T	6	6	22818	22823	0 %	100 %	0 %	0 %	385814813
78	NC_017468	A	6	6	22853	22858	100 %	0 %	0 %	0 %	385814813
79	NC_017468	A	6	6	23124	23129	100 %	0 %	0 %	0 %	385814813
80	NC_017468	T	6	6	23508	23513	0 %	100 %	0 %	0 %	385814814
81	NC_017468	T	6	6	24309	24314	0 %	100 %	0 %	0 %	385814815
82	NC_017468	A	6	6	24505	24510	100 %	0 %	0 %	0 %	385814815
83	NC_017468	T	6	6	24519	24524	0 %	100 %	0 %	0 %	385814815
84	NC_017468	T	7	7	24611	24617	0 %	100 %	0 %	0 %	385814815
85	NC_017468	T	6	6	25171	25176	0 %	100 %	0 %	0 %	385814816
86	NC_017468	T	6	6	26117	26122	0 %	100 %	0 %	0 %	385814817
87	NC_017468	T	6	6	26272	26277	0 %	100 %	0 %	0 %	385814817
88	NC_017468	A	6	6	26307	26312	100 %	0 %	0 %	0 %	385814817
89	NC_017468	A	7	7	26475	26481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.