MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	GCAGAA	2	12	1073	1084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385812839
2	NC_017467	GATGCA	2	12	6289	6300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812843
3	NC_017467	GCAAGG	2	12	8676	8687	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385812844
4	NC_017467	GATCAA	2	12	8837	8848	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385812844
5	NC_017467	TAATTT	2	12	9398	9409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812845
6	NC_017467	CAAGCA	2	12	11310	11321	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017467	AAAGAA	2	12	11646	11657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017467	AGATAA	2	12	13951	13962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812851
9	NC_017467	TAAATC	2	12	17759	17770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017467	AGCTGA	2	12	21206	21217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812856
11	NC_017467	TGAAGT	2	12	22775	22786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812857
12	NC_017467	TTTTAT	2	12	22933	22944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017467	TTCATC	2	12	23221	23232	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385812858
14	NC_017467	TAAGAA	2	12	33583	33594	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812870
15	NC_017467	ATAATT	2	12	33927	33938	50 %	50 %	0 %	0 %	385812870
16	NC_017467	GGACAT	2	12	34253	34264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812871
17	NC_017467	TATAAA	2	12	37219	37230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017467	TCTTTA	2	12	39107	39118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385812878
19	NC_017467	TTCTTT	2	12	40157	40168	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385812879
20	NC_017467	AGCAAT	2	12	42434	42445	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385812880
21	NC_017467	CATCCC	2	12	43770	43781	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385812882
22	NC_017467	TTTTAT	2	12	45547	45558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017467	AGATGC	2	12	47155	47166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812885
24	NC_017467	ATGGTG	2	12	48132	48143	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017467	TTTGAA	2	12	52013	52024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017467	AGATGA	2	12	54452	54463	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385812890
27	NC_017467	TAAAGT	2	12	56468	56479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385812893
28	NC_017467	GGAATA	2	12	56517	56528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385812893
29	NC_017467	AAATAC	2	12	59382	59393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017467	TCATGA	2	12	60325	60336	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385812896
31	NC_017467	AAAAAG	2	12	61248	61259	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385812898
32	NC_017467	GCAACT	2	12	61815	61826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385812899
33	NC_017467	GAATAT	2	12	63936	63947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385812902
34	NC_017467	TCACCG	2	12	65829	65840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385812903
35	NC_017467	ATATTT	2	12	66612	66623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017467	ATACTT	2	12	68319	68330	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385812906
37	NC_017467	CTTTGA	2	12	69058	69069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385812906
38	NC_017467	AGACAA	2	12	71913	71924	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385812908
39	NC_017467	TCTTTA	2	12	72787	72798	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385812909
40	NC_017467	AATTTA	2	12	72889	72900	50 %	50 %	0 %	0 %	385812909
41	NC_017467	GCACCA	2	12	73333	73344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385812909
42	NC_017467	ATTTAA	2	12	74786	74797	50 %	50 %	0 %	0 %	385812910
43	NC_017467	TTTGAC	2	12	75064	75075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385812910
44	NC_017467	AGTCTT	2	12	75084	75095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385812910
45	NC_017467	CTTGTT	2	12	75288	75299	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385812911
46	NC_017467	CTTCGT	2	12	75500	75511	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385812911
47	NC_017467	TTACAA	2	12	75599	75610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385812911
48	NC_017467	CTTTTT	2	12	77682	77693	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017467	ATTGCA	2	12	79874	79885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385812913
50	NC_017467	ATAAAA	2	12	81000	81011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385812914
51	NC_017467	CGGAGC	2	12	87528	87539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017467	TACTTT	2	12	90680	90691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017467	CACGGT	2	12	91223	91234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017467	CAAAAA	2	12	101347	101358	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385812927
55	NC_017467	GATTCA	2	12	104212	104223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385812930
56	NC_017467	AAATTC	2	12	105909	105920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385812930
57	NC_017467	TAAGGA	2	12	110896	110907	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385812935
58	NC_017467	AGTAAG	2	12	112245	112256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017467	AAGACA	2	12	121215	121226	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385812946
60	NC_017467	ATAAAT	2	12	131243	131254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812956
61	NC_017467	GCTTCA	2	12	131343	131354	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385812956
62	NC_017467	TTTTTC	2	12	131372	131383	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385812956
63	NC_017467	TTCCGA	2	12	132478	132489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385812958
64	NC_017467	CTTTTT	2	12	132758	132769	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385812959
65	NC_017467	CATAAT	2	12	133202	133213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385812959
66	NC_017467	TTATTT	2	12	134207	134218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385812961
67	NC_017467	TATAAA	2	12	134817	134828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812962
68	NC_017467	ACTTCT	2	12	136119	136130	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385812963
69	NC_017467	GTTTTG	2	12	140039	140050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812967
70	NC_017467	TGGCAA	2	12	141127	141138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812969
71	NC_017467	TGTTGA	2	12	143265	143276	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385812971
72	NC_017467	CTAAGG	2	12	145046	145057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812973
73	NC_017467	TTCTGG	2	12	146095	146106	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385812974
74	NC_017467	TAAAGA	2	12	151183	151194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812978
75	NC_017467	ATTTTG	2	12	151384	151395	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385812979
76	NC_017467	TTGCAG	2	12	151613	151624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385812979
77	NC_017467	GAATAA	2	12	152638	152649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812980
78	NC_017467	AACGCA	2	12	153630	153641	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385812982
79	NC_017467	CAATTT	2	12	153879	153890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385812982
80	NC_017467	ATTGCC	2	12	154465	154476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385812982
81	NC_017467	TAACTT	2	12	158939	158950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385812986
82	NC_017467	TAAAGA	2	12	166070	166081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812994
83	NC_017467	GTCATC	2	12	166807	166818	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385812994
84	NC_017467	CTAAGA	2	12	169536	169547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385812996
85	NC_017467	TATTGA	2	12	174151	174162	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385813000
86	NC_017467	TTAAGG	2	12	175856	175867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017467	CTGAAG	2	12	177784	177795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813003
88	NC_017467	GTGGTT	2	12	179638	179649	0 %	50 %	50 %	0 %	385813004
89	NC_017467	CAATAG	2	12	180301	180312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813004
90	NC_017467	GTAACA	2	12	181017	181028	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813004
91	NC_017467	GATGAA	2	12	182772	182783	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017467	TATCCT	2	12	182806	182817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017467	GCGCCA	2	12	182973	182984	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017467	TGTTAA	2	12	185168	185179	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385813008
95	NC_017467	GTAACT	2	12	185220	185231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813008
96	NC_017467	ATATAG	2	12	186833	186844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385813010
97	NC_017467	TTGAAA	2	12	186878	186889	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385813010
98	NC_017467	TTGATT	2	12	190383	190394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813013
99	NC_017467	TTTGCA	2	12	192627	192638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017467	TGACTA	2	12	194157	194168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813014
101	NC_017467	TTTCTT	2	12	195897	195908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385813016
102	NC_017467	ATCAAC	2	12	198297	198308	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385813019
103	NC_017467	CGTTGC	2	12	202713	202724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813024
104	NC_017467	ATTCTT	2	12	203798	203809	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385813025
105	NC_017467	GTAATT	2	12	204534	204545	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385813025
106	NC_017467	CCAAGC	2	12	212448	212459	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385813030
107	NC_017467	GATAAG	2	12	218381	218392	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385813036
108	NC_017467	AAGATG	2	12	218517	218528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385813036
109	NC_017467	ATGACG	2	12	219177	219188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813038
110	NC_017467	TCCGGT	2	12	220717	220728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813039
111	NC_017467	TTGCCA	2	12	223665	223676	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385813040
112	NC_017467	GTCTAA	2	12	223724	223735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813040
113	NC_017467	CCTGTT	2	12	223950	223961	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385813040
114	NC_017467	GGCTAA	2	12	224393	224404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813040
115	NC_017467	GAAGCT	2	12	228877	228888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813045
116	NC_017467	AAAGAT	2	12	231236	231247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385813047
117	NC_017467	ATAGAC	2	12	231443	231454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813048
118	NC_017467	TTAGTT	2	12	233867	233878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813050
119	NC_017467	TCAAGT	2	12	235265	235276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813050
120	NC_017467	AAAAGA	2	12	237792	237803	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385813052
121	NC_017467	GAAACT	2	12	239683	239694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813055
122	NC_017467	GACAAT	2	12	240548	240559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813056
123	NC_017467	CGTCAC	2	12	242135	242146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385813057
124	NC_017467	GTATTC	2	12	243255	243266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385813058
125	NC_017467	TTGATC	2	12	245206	245217	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385813061
126	NC_017467	GCCTAA	2	12	247155	247166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385813063
127	NC_017467	CAGGTC	2	12	252416	252427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385813067
128	NC_017467	GCTTAA	2	12	253858	253869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017467	CAAATG	2	12	255095	255106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017467	ACTACA	2	12	256632	256643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385813069
131	NC_017467	GAAAAG	2	12	259924	259935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017467	AAAAAT	2	12	260428	260439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017467	AAATTG	2	12	260792	260803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385813070
134	NC_017467	ATAGAG	2	12	261296	261307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385813070
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137	NC_017467	TCGCCA	2	12	267172	267183	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385813075
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139	NC_017467	ACTGGT	2	12	269919	269930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385813078
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145	NC_017467	ATATTA	2	12	273544	273555	50 %	50 %	0 %	0 %	385813081
146	NC_017467	AGACAA	2	12	275827	275838	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385813084
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148	NC_017467	GAAAAT	2	12	276441	276452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385813085
149	NC_017467	TGCACC	2	12	277016	277027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385813085
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153	NC_017467	TTTTTA	2	12	288213	288224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017467	TTTTGA	2	12	289530	289541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813094
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172	NC_017467	TGATTT	2	12	333497	333508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813146
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216	NC_017467	GGCTAA	2	12	440882	440893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813247
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220	NC_017467	CGGAGC	2	12	448479	448490	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
221	NC_017467	GCTAAT	2	12	451499	451510	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813252
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230	NC_017467	TCCATC	2	12	468096	468107	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
231	NC_017467	TTTGGT	2	12	469574	469585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813265
232	NC_017467	AACTGT	2	12	469846	469857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813265
233	NC_017467	GAGCTA	2	12	473948	473959	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813270
234	NC_017467	CTGCAG	2	12	475245	475256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385813271
235	NC_017467	AAAGGT	2	12	479365	479376	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385813274
236	NC_017467	TACCAA	2	12	482002	482013	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385813276
237	NC_017467	GTCTTT	2	12	483353	483364	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385813276
238	NC_017467	GATGCC	2	12	483569	483580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385813276
239	NC_017467	GACTTG	2	12	486859	486870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
240	NC_017467	TCTTAT	2	12	486994	487005	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
241	NC_017467	GATATG	2	12	491757	491768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813284
242	NC_017467	TGACTA	2	12	496565	496576	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813287
243	NC_017467	CGGATA	2	12	499242	499253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
244	NC_017467	TAGCTC	2	12	499433	499444	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385813290
245	NC_017467	AGATAA	2	12	506234	506245	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385813298
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252	NC_017467	ATTATG	2	12	521032	521043	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385813314
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255	NC_017467	TTGATT	2	12	527817	527828	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813323
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260	NC_017467	AAAGAA	2	12	540240	540251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017467	ATTTTG	2	12	545399	545410	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813341
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263	NC_017467	GTAGTG	2	12	551280	551291	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385813345
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269	NC_017467	GGAGAA	2	12	573578	573589	50 %	0 %	50 %	0 %	385813363
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275	NC_017467	ATTTTT	2	12	592781	592792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_017467	AAAAAT	2	12	656799	656810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_017467	CAAATT	2	12	758702	758713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385813536
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343	NC_017467	AAGTAA	2	12	770186	770197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385813546
344	NC_017467	AGAAAA	2	12	770686	770697	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385813546
345	NC_017467	GAAGCT	2	12	781620	781631	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813559
346	NC_017467	AAGCAA	2	12	786717	786728	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385813565
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348	NC_017467	ATCCAG	2	12	789233	789244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385813566
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461	NC_017467	TATTAA	2	12	1050144	1050155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_017467	TATCTT	2	12	1064430	1064441	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385813804
465	NC_017467	ATTCAA	2	12	1065484	1065495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385813804
466	NC_017467	TCTTAT	2	12	1072117	1072128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
467	NC_017467	AGTCAA	2	12	1077815	1077826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813810
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469	NC_017467	ATAATT	2	12	1078790	1078801	50 %	50 %	0 %	0 %	385813810
470	NC_017467	GCATCA	2	12	1078857	1078868	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385813810
471	NC_017467	TGATCT	2	12	1079085	1079096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385813810
472	NC_017467	TAATTA	2	12	1079340	1079351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017467	GTATTT	2	12	1081205	1081216	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813812
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493	NC_017467	CAAACC	2	12	1143464	1143475	50 %	0 %	0 %	50 %	385813885
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