MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	CAAGCA	2	12	11310	11321	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017467	AAAGAA	2	12	11646	11657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017467	TAAATC	2	12	17759	17770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017467	TTTTAT	2	12	22933	22944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017467	TATAAA	2	12	37219	37230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017467	TTTTAT	2	12	45547	45558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017467	ATGGTG	2	12	48132	48143	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017467	TTTGAA	2	12	52013	52024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017467	AAATAC	2	12	59382	59393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017467	ATATTT	2	12	66612	66623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017467	CTTTTT	2	12	77682	77693	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017467	CGGAGC	2	12	87528	87539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017467	TACTTT	2	12	90680	90691	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017467	CACGGT	2	12	91223	91234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017467	AGTAAG	2	12	112245	112256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017467	TTAAGG	2	12	175856	175867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017467	GATGAA	2	12	182772	182783	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017467	TATCCT	2	12	182806	182817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017467	GCGCCA	2	12	182973	182984	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017467	TTTGCA	2	12	192627	192638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017467	GCTTAA	2	12	253858	253869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017467	CAAATG	2	12	255095	255106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017467	GAAAAG	2	12	259924	259935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017467	AAAAAT	2	12	260428	260439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017467	TTTTTA	2	12	288213	288224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017467	ATATTT	2	12	332712	332723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017467	TTATCT	2	12	379248	379259	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017467	ATCTAA	2	12	414986	414997	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017467	CGGAGC	2	12	431219	431230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017467	TATTAA	2	12	435674	435685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017467	GAAAAA	2	12	445583	445594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017467	CGGAGC	2	12	448479	448490	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017467	GCTGTA	2	12	465107	465118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017467	TATTTC	2	12	465496	465507	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017467	TTTGAA	2	12	466375	466386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017467	TCCATC	2	12	468096	468107	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017467	GACTTG	2	12	486859	486870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017467	TCTTAT	2	12	486994	487005	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017467	CGGATA	2	12	499242	499253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017467	AAAGAA	2	12	540240	540251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017467	ATTTTT	2	12	592781	592792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017467	TTAAAA	2	12	594911	594922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017467	TACTAA	2	12	655283	655294	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017467	AAAAAT	2	12	656799	656810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017467	CTTAAG	2	12	668851	668862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017467	AAAAAT	2	12	677235	677246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017467	GTAATT	2	12	681211	681222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017467	TTGAGT	2	12	684370	684381	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017467	TTTTTA	2	12	684386	684397	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017467	TAATTT	2	12	685416	685427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017467	ACAGTA	2	12	688306	688317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017467	ATAAAA	2	12	702724	702735	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017467	AGCCTT	2	12	705515	705526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017467	TCTATT	2	12	750536	750547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017467	TTCTTT	2	12	757662	757673	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017467	TGTTTT	2	12	806075	806086	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017467	TTAAAA	2	12	806134	806145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017467	CAAGAA	2	12	814455	814466	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017467	CAGAAC	2	12	814645	814656	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017467	TAATTA	2	12	819139	819150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017467	CGCTGG	2	12	823968	823979	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017467	CTTAAG	2	12	862205	862216	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017467	AAATAA	2	12	869070	869081	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017467	TGTTTT	2	12	873192	873203	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017467	ATTATG	2	12	886888	886899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017467	TAAATG	2	12	893724	893735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017467	CAAGCA	2	12	951710	951721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017467	AAAGAA	2	12	952046	952057	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017467	ATTAGA	2	12	959789	959800	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017467	AAATAA	2	12	961426	961437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017467	AAAAAG	2	12	963737	963748	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017467	GCAATT	2	12	974847	974858	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017467	GCTTAA	2	12	982755	982766	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017467	AAAAAG	2	12	990262	990273	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017467	GATGAA	2	12	998491	998502	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017467	AATTTT	2	12	1010715	1010726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017467	GTATTA	2	12	1010739	1010750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017467	TTCATT	2	12	1034036	1034047	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017467	TTATTT	2	12	1038504	1038515	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017467	ATTGAA	2	12	1043758	1043769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017467	TTAATT	2	12	1050027	1050038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017467	TATTAA	2	12	1050144	1050155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017467	TTTTTA	2	12	1061754	1061765	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017467	TCTTAT	2	12	1072117	1072128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017467	TAATTA	2	12	1079340	1079351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017467	AGTTGC	2	12	1096877	1096888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017467	TAGAAC	2	12	1115927	1115938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017467	ATTTTA	2	12	1133569	1133580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017467	CGTTTG	2	12	1145925	1145936	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017467	TAGGAA	2	12	1164152	1164163	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017467	GATCTA	2	12	1198636	1198647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017467	ATAAAA	2	12	1200061	1200072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017467	CTAAAA	2	12	1227829	1227840	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017467	ATCAAT	2	12	1228696	1228707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017467	TTAAAA	2	12	1242771	1242782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017467	TTAAAA	2	12	1254451	1254462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017467	AAATTA	2	12	1254482	1254493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017467	TTATTT	2	12	1265827	1265838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017467	TGCAGC	2	12	1267565	1267576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017467	TATAAG	2	12	1272137	1272148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017467	TTTAAT	2	12	1283087	1283098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017467	CATTTT	2	12	1291003	1291014	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017467	AGATGA	2	12	1291683	1291694	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017467	AAATTA	2	12	1307049	1307060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017467	CTTTTT	2	12	1312704	1312715	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017467	AGTTTG	2	12	1327732	1327743	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017467	CAGGAA	2	12	1345718	1345729	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017467	CATCTT	2	12	1380886	1380897	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017467	TGATAA	2	12	1380944	1380955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017467	CTGAAG	2	12	1425487	1425498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017467	AAAAAT	2	12	1429649	1429660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017467	TTAAAA	2	12	1435558	1435569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017467	CTTAAG	2	12	1437865	1437876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017467	ATAAAA	2	12	1444523	1444534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017467	GATATA	2	12	1478034	1478045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017467	AAGTAG	2	12	1483788	1483799	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017467	TGCCTT	2	12	1483870	1483881	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017467	ATTACC	2	12	1484236	1484247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017467	CTTTTT	2	12	1534077	1534088	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017467	TTTAAA	2	12	1544159	1544170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017467	TAAAAA	2	12	1556709	1556720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017467	CTTAAG	2	12	1559186	1559197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017467	TTTTAG	2	12	1564544	1564555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017467	TATCTC	2	12	1583193	1583204	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017467	TTTCAT	2	12	1583475	1583486	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017467	GCTTAA	2	12	1595729	1595740	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017467	TGAGCA	2	12	1614758	1614769	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017467	CGCTTC	2	12	1618253	1618264	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017467	TGACGC	2	12	1635090	1635101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017467	AGGCAA	2	12	1638378	1638389	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017467	TGCAGC	2	12	1638693	1638704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017467	GTAACT	2	12	1647024	1647035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017467	TTTTTA	2	12	1684983	1684994	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017467	ACCATC	2	12	1691953	1691964	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017467	AGGTGA	2	12	1694365	1694376	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_017467	AAATAT	2	12	1812669	1812680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.