MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 1661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	TGGAA	2	10	400	409	40 %	20 %	40 %	0 %	385812839
2	NC_017467	TATTT	2	10	3636	3645	20 %	80 %	0 %	0 %	385812842
3	NC_017467	ATGAA	2	10	4928	4937	60 %	20 %	20 %	0 %	385812843
4	NC_017467	AGAAT	2	10	5042	5051	60 %	20 %	20 %	0 %	385812843
5	NC_017467	AGGAA	2	10	9426	9435	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017467	TCATG	2	10	12867	12876	20 %	40 %	20 %	20 %	385812848
7	NC_017467	TAATA	2	10	13623	13632	60 %	40 %	0 %	0 %	385812850
8	NC_017467	TAACT	2	10	14014	14023	40 %	40 %	0 %	20 %	385812851
9	NC_017467	CAATA	2	10	14916	14925	60 %	20 %	0 %	20 %	385812851
10	NC_017467	AAATT	2	10	17316	17325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017467	TGGCT	2	10	21119	21128	0 %	40 %	40 %	20 %	385812856
12	NC_017467	CAAAT	2	10	21643	21652	60 %	20 %	0 %	20 %	385812857
13	NC_017467	AGCCA	2	10	23299	23308	40 %	0 %	20 %	40 %	385812858
14	NC_017467	CATTG	2	10	24069	24078	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017467	ATATC	2	10	24217	24226	40 %	40 %	0 %	20 %	385812859
16	NC_017467	GAAAA	2	10	27634	27643	80 %	0 %	20 %	0 %	385812862
17	NC_017467	GCAAA	2	10	28332	28341	60 %	0 %	20 %	20 %	385812862
18	NC_017467	AAGGT	2	10	29072	29081	40 %	20 %	40 %	0 %	385812863
19	NC_017467	TTGAT	2	10	31627	31636	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017467	TGATA	2	10	31862	31871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017467	GAATG	2	10	34018	34027	40 %	20 %	40 %	0 %	385812871
22	NC_017467	GAAAA	2	10	34078	34087	80 %	0 %	20 %	0 %	385812871
23	NC_017467	TCACT	2	10	34219	34228	20 %	40 %	0 %	40 %	385812871
24	NC_017467	GCAAG	2	10	35319	35328	40 %	0 %	40 %	20 %	385812873
25	NC_017467	GAAGC	2	10	35650	35659	40 %	0 %	40 %	20 %	385812874
26	NC_017467	TAAAA	2	10	36767	36776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017467	AAATA	2	10	38666	38675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017467	AATTT	2	10	39748	39757	40 %	60 %	0 %	0 %	385812878
29	NC_017467	AATTT	2	10	44412	44421	40 %	60 %	0 %	0 %	385812883
30	NC_017467	ATATT	2	10	48965	48974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017467	CAAAT	2	10	51391	51400	60 %	20 %	0 %	20 %	385812888
32	NC_017467	AAATT	2	10	53011	53020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017467	GTTTT	2	10	53079	53088	0 %	80 %	20 %	0 %	385812889
34	NC_017467	ATATG	2	10	53228	53237	40 %	40 %	20 %	0 %	385812890
35	NC_017467	ACTAA	2	10	54423	54432	60 %	20 %	0 %	20 %	385812890
36	NC_017467	AAATA	2	10	54615	54624	80 %	20 %	0 %	0 %	385812890
37	NC_017467	AAGAT	2	10	55964	55973	60 %	20 %	20 %	0 %	385812892
38	NC_017467	CAATG	2	10	56342	56351	40 %	20 %	20 %	20 %	385812893
39	NC_017467	ACGCA	2	10	59857	59866	40 %	0 %	20 %	40 %	385812896
40	NC_017467	TAATT	2	10	61084	61093	40 %	60 %	0 %	0 %	385812897
41	NC_017467	GTGCC	2	10	62705	62714	0 %	20 %	40 %	40 %	385812900
42	NC_017467	AATAA	2	10	63453	63462	80 %	20 %	0 %	0 %	385812901
43	NC_017467	ATAGA	2	10	63594	63603	60 %	20 %	20 %	0 %	385812901
44	NC_017467	CTATA	2	10	67230	67239	40 %	40 %	0 %	20 %	385812905
45	NC_017467	TAAAA	2	10	69152	69161	80 %	20 %	0 %	0 %	385812906
46	NC_017467	GCTTT	2	10	69556	69565	0 %	60 %	20 %	20 %	385812907
47	NC_017467	GATCA	2	10	71691	71700	40 %	20 %	20 %	20 %	385812908
48	NC_017467	TTAGT	2	10	72414	72423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017467	AAGAA	2	10	72526	72535	80 %	0 %	20 %	0 %	385812909
50	NC_017467	ATAAA	2	10	74254	74263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017467	TTTCA	2	10	75618	75627	20 %	60 %	0 %	20 %	385812911
52	NC_017467	GTGAA	2	10	75678	75687	40 %	20 %	40 %	0 %	385812911
53	NC_017467	AAATG	2	10	76601	76610	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017467	AAAAG	2	10	77019	77028	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017467	AAGAT	2	10	81267	81276	60 %	20 %	20 %	0 %	385812914
56	NC_017467	GCTCT	2	10	83223	83232	0 %	40 %	20 %	40 %	385812915
57	NC_017467	TTCAG	2	10	83736	83745	20 %	40 %	20 %	20 %	385812915
58	NC_017467	TTTTG	2	10	84228	84237	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017467	AAGCA	2	10	84413	84422	60 %	0 %	20 %	20 %	385812916
60	NC_017467	TCGTG	2	10	86202	86211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017467	GGCAG	2	10	86601	86610	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017467	GAGAA	2	10	86856	86865	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017467	AAGGC	2	10	88254	88263	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017467	TTGAA	2	10	88764	88773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017467	GCCAG	2	10	89096	89105	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017467	AGGAA	2	10	89949	89958	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017467	AGTTA	2	10	92349	92358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017467	TTTGC	2	10	92769	92778	0 %	60 %	20 %	20 %	385812919
69	NC_017467	AGCAT	2	10	93173	93182	40 %	20 %	20 %	20 %	385812919
70	NC_017467	TTTTC	2	10	93425	93434	0 %	80 %	0 %	20 %	385812920
71	NC_017467	AAAGA	2	10	93591	93600	80 %	0 %	20 %	0 %	385812920
72	NC_017467	ATTGA	2	10	95212	95221	40 %	40 %	20 %	0 %	385812921
73	NC_017467	TAAAA	2	10	98633	98642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017467	TCTTG	2	10	99484	99493	0 %	60 %	20 %	20 %	385812926
75	NC_017467	CTTTA	2	10	100323	100332	20 %	60 %	0 %	20 %	385812927
76	NC_017467	AATTG	2	10	100358	100367	40 %	40 %	20 %	0 %	385812927
77	NC_017467	TTGTT	2	10	101989	101998	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017467	ATTTA	2	10	103327	103336	40 %	60 %	0 %	0 %	385812929
79	NC_017467	CAGTG	2	10	107839	107848	20 %	20 %	40 %	20 %	385812932
80	NC_017467	AAAAG	2	10	110728	110737	80 %	0 %	20 %	0 %	385812935
81	NC_017467	ATTTA	2	10	112677	112686	40 %	60 %	0 %	0 %	385812936
82	NC_017467	GTTTA	2	10	113626	113635	20 %	60 %	20 %	0 %	385812938
83	NC_017467	AGAAA	2	10	113666	113675	80 %	0 %	20 %	0 %	385812938
84	NC_017467	TAAAG	2	10	115986	115995	60 %	20 %	20 %	0 %	385812942
85	NC_017467	TTTGT	2	10	117186	117195	0 %	80 %	20 %	0 %	385812943
86	NC_017467	TTTAA	2	10	118088	118097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017467	ACAAA	2	10	118387	118396	80 %	0 %	0 %	20 %	385812944
88	NC_017467	TTTTC	2	10	119163	119172	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017467	ATGCC	2	10	121318	121327	20 %	20 %	20 %	40 %	385812946
90	NC_017467	AACTT	2	10	121856	121865	40 %	40 %	0 %	20 %	385812947
91	NC_017467	CGTTA	2	10	124374	124383	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017467	CGTAG	2	10	125771	125780	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017467	AACCA	2	10	126151	126160	60 %	0 %	0 %	40 %	385812951
94	NC_017467	AAATT	2	10	126386	126395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017467	TTCCA	2	10	128493	128502	20 %	40 %	0 %	40 %	385812954
96	NC_017467	CAATA	2	10	130540	130549	60 %	20 %	0 %	20 %	385812955
97	NC_017467	TTAAT	2	10	132133	132142	40 %	60 %	0 %	0 %	385812958
98	NC_017467	AATTT	2	10	132447	132456	40 %	60 %	0 %	0 %	385812958
99	NC_017467	TTTTG	2	10	133250	133259	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017467	TTAGG	2	10	133736	133745	20 %	40 %	40 %	0 %	385812960
101	NC_017467	TTTCA	2	10	136433	136442	20 %	60 %	0 %	20 %	385812963
102	NC_017467	CAAAA	2	10	136523	136532	80 %	0 %	0 %	20 %	385812963
103	NC_017467	TGATT	2	10	138044	138053	20 %	60 %	20 %	0 %	385812965
104	NC_017467	TTCAT	2	10	138250	138259	20 %	60 %	0 %	20 %	385812965
105	NC_017467	TGCTT	2	10	139027	139036	0 %	60 %	20 %	20 %	385812966
106	NC_017467	ATTAA	2	10	139397	139406	60 %	40 %	0 %	0 %	385812966
107	NC_017467	ATGGA	2	10	142928	142937	40 %	20 %	40 %	0 %	385812971
108	NC_017467	GCAAC	2	10	143195	143204	40 %	0 %	20 %	40 %	385812971
109	NC_017467	ATTTT	2	10	146898	146907	20 %	80 %	0 %	0 %	385812975
110	NC_017467	TAATT	2	10	148376	148385	40 %	60 %	0 %	0 %	385812976
111	NC_017467	TCAAA	2	10	149628	149637	60 %	20 %	0 %	20 %	385812977
112	NC_017467	GAAAT	2	10	150782	150791	60 %	20 %	20 %	0 %	385812978
113	NC_017467	CAATT	2	10	152611	152620	40 %	40 %	0 %	20 %	385812980
114	NC_017467	AGCTT	2	10	155199	155208	20 %	40 %	20 %	20 %	385812982
115	NC_017467	TTTTA	2	10	156255	156264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017467	GAAGT	2	10	157540	157549	40 %	20 %	40 %	0 %	385812984
117	NC_017467	TTGGT	2	10	162715	162724	0 %	60 %	40 %	0 %	385812990
118	NC_017467	ATTTA	2	10	164862	164871	40 %	60 %	0 %	0 %	385812992
119	NC_017467	ATTTT	2	10	165031	165040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017467	CAAGA	2	10	165157	165166	60 %	0 %	20 %	20 %	385812993
121	NC_017467	TAATT	2	10	169080	169089	40 %	60 %	0 %	0 %	385812995
122	NC_017467	TATGG	2	10	169181	169190	20 %	40 %	40 %	0 %	385812996
123	NC_017467	GAACA	2	10	170483	170492	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017467	GATAA	2	10	174386	174395	60 %	20 %	20 %	0 %	385813000
125	NC_017467	ATTTC	2	10	175649	175658	20 %	60 %	0 %	20 %	385813001
126	NC_017467	TTGGA	2	10	175973	175982	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017467	CATTA	2	10	176792	176801	40 %	40 %	0 %	20 %	385813002
128	NC_017467	ACTTT	2	10	177556	177565	20 %	60 %	0 %	20 %	385813003
129	NC_017467	AATAA	2	10	179144	179153	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017467	TTATT	2	10	179169	179178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017467	CATAA	2	10	181286	181295	60 %	20 %	0 %	20 %	385813004
132	NC_017467	TTCTT	2	10	182102	182111	0 %	80 %	0 %	20 %	385813005
133	NC_017467	TCAAA	2	10	183242	183251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017467	GGCAA	2	10	185418	185427	40 %	0 %	40 %	20 %	385813008
135	NC_017467	CTGTT	2	10	186286	186295	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017467	ATTAG	2	10	186574	186583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017467	GCTTG	2	10	188185	188194	0 %	40 %	40 %	20 %	385813011
138	NC_017467	ATCTA	2	10	190336	190345	40 %	40 %	0 %	20 %	385813013
139	NC_017467	AAAAG	2	10	191605	191614	80 %	0 %	20 %	0 %	385813013
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