MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 5563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	AAT	2	6	80	85	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017467	CAA	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017467	CTA	4	12	1663	1674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017467	AGG	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017467	GGC	2	6	4516	4521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017467	TAA	2	6	8941	8946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017467	AGG	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017467	ATT	2	6	10265	10270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017467	TGA	2	6	10305	10310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017467	GGA	2	6	10358	10363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017467	TAA	2	6	10376	10381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017467	CTA	2	6	10392	10397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017467	TAA	2	6	10437	10442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017467	AGC	2	6	10667	10672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017467	CAT	2	6	10800	10805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017467	GCT	2	6	10856	10861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017467	TCA	2	6	10968	10973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017467	AAG	2	6	11002	11007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017467	ACG	2	6	11068	11073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017467	GCT	2	6	11232	11237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017467	GCT	2	6	11471	11476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017467	GCG	2	6	11514	11519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017467	TAA	2	6	11754	11759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017467	CTT	2	6	11833	11838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017467	TAT	2	6	11920	11925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017467	GAT	2	6	11940	11945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017467	AGG	2	6	13639	13644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017467	TGA	2	6	13723	13728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017467	ATA	2	6	15834	15839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017467	TCA	2	6	15903	15908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017467	TCA	2	6	16348	16353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017467	ATA	2	6	16380	16385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017467	AAT	2	6	16488	16493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017467	CTT	2	6	16516	16521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017467	TCT	2	6	16618	16623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017467	TAC	2	6	16835	16840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017467	ACT	2	6	16909	16914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017467	ATT	2	6	17003	17008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017467	TTG	2	6	17074	17079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017467	ATT	3	9	17130	17138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017467	AGC	2	6	17192	17197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017467	ATC	2	6	17250	17255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017467	TCA	2	6	17268	17273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017467	TAA	2	6	17274	17279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017467	TAG	2	6	17308	17313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017467	TCT	2	6	17394	17399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017467	TTC	2	6	17481	17486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017467	TGT	2	6	17532	17537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017467	TCA	2	6	17538	17543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017467	ATC	2	6	17549	17554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017467	ACT	2	6	17649	17654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017467	TAA	2	6	17681	17686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017467	TCA	2	6	17787	17792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017467	TGA	2	6	17847	17852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017467	TAC	2	6	17880	17885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017467	ACA	2	6	17948	17953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017467	ATA	2	6	18191	18196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017467	TCC	2	6	18230	18235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017467	TAA	2	6	18934	18939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017467	TTA	2	6	23087	23092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017467	GGA	2	6	23120	23125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017467	ATC	2	6	26303	26308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017467	AAC	2	6	26321	26326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017467	CCT	2	6	26363	26368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017467	TGA	2	6	26635	26640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017467	CAT	2	6	26767	26772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017467	TGG	2	6	26778	26783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017467	AGC	2	6	26821	26826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017467	AAG	2	6	26833	26838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017467	CTC	2	6	26854	26859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017467	AAT	2	6	27350	27355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017467	AGT	2	6	27411	27416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017467	ATT	2	6	28987	28992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017467	GAT	2	6	29226	29231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017467	TAA	2	6	31699	31704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017467	TGT	2	6	31709	31714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017467	ATG	2	6	31773	31778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017467	GTT	2	6	31881	31886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017467	TTC	2	6	32450	32455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017467	ATA	2	6	32465	32470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017467	CTT	2	6	32506	32511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017467	AAG	2	6	32610	32615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017467	AGG	2	6	33246	33251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017467	ATA	2	6	34837	34842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017467	TTG	2	6	34854	34859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017467	GGT	2	6	34876	34881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017467	AGG	2	6	34900	34905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017467	CAA	2	6	36606	36611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017467	GGC	2	6	36646	36651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017467	GAA	2	6	36719	36724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017467	GAA	2	6	36935	36940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017467	ATT	2	6	37019	37024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017467	TGT	2	6	37150	37155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017467	TTA	2	6	37182	37187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017467	TGA	2	6	37243	37248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017467	GGA	2	6	38000	38005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017467	CTG	2	6	38716	38721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017467	TTA	2	6	39892	39897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017467	GGT	2	6	39916	39921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017467	TAA	2	6	40018	40023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017467	ATT	2	6	40033	40038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017467	GAA	2	6	40049	40054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017467	TTA	2	6	41450	41455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017467	TCC	2	6	41468	41473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017467	TCA	2	6	41522	41527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017467	CTT	2	6	41586	41591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017467	CCT	2	6	43159	43164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017467	CTA	2	6	43194	43199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017467	TAG	2	6	43227	43232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017467	ATA	2	6	44011	44016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017467	TGA	2	6	45619	45624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017467	AGG	2	6	45701	45706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017467	ACA	2	6	45756	45761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017467	ATG	2	6	45820	45825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017467	AAT	2	6	45842	45847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017467	TTC	2	6	45934	45939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017467	GAA	2	6	45979	45984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017467	CTT	2	6	45985	45990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017467	ATT	2	6	46200	46205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017467	AGC	2	6	46507	46512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017467	ATG	2	6	46566	46571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017467	ATC	2	6	46614	46619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017467	ACT	2	6	46953	46958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017467	TTG	2	6	48170	48175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017467	ATT	2	6	48200	48205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017467	AGA	2	6	48224	48229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017467	AAT	2	6	48821	48826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017467	AGA	2	6	48839	48844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017467	AAG	2	6	48845	48850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017467	TAA	2	6	48864	48869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017467	TAG	2	6	48877	48882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017467	GAT	3	9	48981	48989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017467	ATT	2	6	49000	49005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017467	ATT	2	6	49039	49044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017467	CTG	2	6	49069	49074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017467	ATT	3	9	49086	49094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017467	ATT	2	6	49171	49176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017467	ATA	2	6	49183	49188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017467	TTG	2	6	49233	49238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017467	CTG	2	6	49285	49290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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