MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 25424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	TGC	2	6	601	606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812839
2	NC_017467	ATT	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812839
3	NC_017467	TGG	2	6	658	663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812839
4	NC_017467	AGT	2	6	736	741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812839
5	NC_017467	TTA	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812839
6	NC_017467	TGC	2	6	837	842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812839
7	NC_017467	TGA	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812839
8	NC_017467	GAA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812839
9	NC_017467	GAA	2	6	1065	1070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812839
10	NC_017467	TGA	2	6	1096	1101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812839
11	NC_017467	AAG	2	6	1287	1292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812839
12	NC_017467	TCG	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812839
13	NC_017467	ATT	2	6	1302	1307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812839
14	NC_017467	CTG	2	6	1320	1325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812839
15	NC_017467	GTA	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812839
16	NC_017467	GGC	2	6	1436	1441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812839
17	NC_017467	TAC	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812839
18	NC_017467	AAT	2	6	1759	1764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812840
19	NC_017467	TTC	2	6	1779	1784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812840
20	NC_017467	AAT	2	6	2065	2070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812840
21	NC_017467	TGC	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812840
22	NC_017467	TTC	2	6	2203	2208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812840
23	NC_017467	ATT	2	6	2308	2313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812840
24	NC_017467	ATT	2	6	2344	2349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812840
25	NC_017467	ATT	2	6	2397	2402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812840
26	NC_017467	ACT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812840
27	NC_017467	GTA	2	6	2569	2574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812840
28	NC_017467	GAA	2	6	2644	2649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812840
29	NC_017467	TCA	3	9	2780	2788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812840
30	NC_017467	GAT	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812840
31	NC_017467	CAT	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812841
32	NC_017467	TTG	2	6	3099	3104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812841
33	NC_017467	AGA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812841
34	NC_017467	TCA	2	6	3152	3157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812841
35	NC_017467	ATC	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812841
36	NC_017467	CGG	2	6	3284	3289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812841
37	NC_017467	GAA	2	6	3339	3344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812842
38	NC_017467	TGG	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812842
39	NC_017467	AGA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812842
40	NC_017467	AAT	2	6	3778	3783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812842
41	NC_017467	TAT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812842
42	NC_017467	GTG	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812842
43	NC_017467	ACC	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812842
44	NC_017467	CTA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812842
45	NC_017467	GAT	2	6	4000	4005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
46	NC_017467	TAA	2	6	4050	4055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812842
47	NC_017467	TAC	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812842
48	NC_017467	GAT	2	6	4102	4107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
49	NC_017467	TCA	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812842
50	NC_017467	TGA	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
51	NC_017467	GTT	3	9	4233	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812842
52	NC_017467	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
53	NC_017467	TGA	2	6	4253	4258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812842
54	NC_017467	TAC	2	6	4326	4331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812842
55	NC_017467	AAG	2	6	4366	4371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812842
56	NC_017467	CAC	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812843
57	NC_017467	ATT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812843
58	NC_017467	TGA	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
59	NC_017467	GAT	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
60	NC_017467	GTC	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812843
61	NC_017467	GGT	2	6	4774	4779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812843
62	NC_017467	CGG	2	6	4785	4790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812843
63	NC_017467	GGT	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812843
64	NC_017467	TGT	2	6	4836	4841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812843
65	NC_017467	CCA	2	6	4853	4858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812843
66	NC_017467	ACT	3	9	5014	5022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812843
67	NC_017467	GGT	2	6	5143	5148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812843
68	NC_017467	TAT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812843
69	NC_017467	TGA	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
70	NC_017467	ACT	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812843
71	NC_017467	CAA	2	6	5295	5300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812843
72	NC_017467	GAT	2	6	5404	5409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
73	NC_017467	TGT	2	6	5448	5453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812843
74	NC_017467	CAG	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812843
75	NC_017467	CTT	2	6	5562	5567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812843
76	NC_017467	GCT	2	6	5635	5640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812843
77	NC_017467	ATA	2	6	5711	5716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812843
78	NC_017467	ATT	2	6	5742	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812843
79	NC_017467	GGT	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812843
80	NC_017467	ATT	2	6	5962	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812843
81	NC_017467	TGA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812843
82	NC_017467	TGT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812843
83	NC_017467	ACT	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812843
84	NC_017467	ATG	2	6	6455	6460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
85	NC_017467	AAG	2	6	6599	6604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812844
86	NC_017467	TTG	2	6	6615	6620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
87	NC_017467	TCA	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
88	NC_017467	CAA	2	6	6823	6828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812844
89	NC_017467	ATG	2	6	6855	6860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
90	NC_017467	AGT	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
91	NC_017467	TTG	2	6	6905	6910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
92	NC_017467	TGA	2	6	6999	7004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
93	NC_017467	ACT	2	6	7019	7024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
94	NC_017467	TGA	2	6	7032	7037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
95	NC_017467	TGG	2	6	7066	7071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812844
96	NC_017467	TAT	2	6	7072	7077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812844
97	NC_017467	GTT	2	6	7130	7135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
98	NC_017467	CAA	2	6	7210	7215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812844
99	NC_017467	TCG	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812844
100	NC_017467	GTT	2	6	7349	7354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
101	NC_017467	AAT	2	6	7358	7363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812844
102	NC_017467	TTG	2	6	7416	7421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
103	NC_017467	ACT	2	6	7434	7439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
104	NC_017467	TAC	2	6	7463	7468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
105	NC_017467	TGT	2	6	7486	7491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
106	NC_017467	ATA	2	6	7569	7574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812844
107	NC_017467	TGA	2	6	7654	7659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
108	NC_017467	ATT	2	6	7819	7824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812844
109	NC_017467	GTT	2	6	7880	7885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812844
110	NC_017467	GTG	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812844
111	NC_017467	GAT	2	6	8231	8236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
112	NC_017467	TTC	2	6	8246	8251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812844
113	NC_017467	TAC	2	6	8365	8370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
114	NC_017467	ATG	2	6	8433	8438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
115	NC_017467	CTG	2	6	8457	8462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812844
116	NC_017467	GAC	2	6	8528	8533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812844
117	NC_017467	GTG	2	6	8604	8609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812844
118	NC_017467	CAT	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812844
119	NC_017467	TAT	2	6	8713	8718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812844
120	NC_017467	GAT	2	6	8792	8797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
121	NC_017467	TGA	3	9	8851	8859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
122	NC_017467	ATG	2	6	8868	8873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812844
123	NC_017467	TGA	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812845
124	NC_017467	AAG	2	6	9164	9169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812845
125	NC_017467	GGT	2	6	9209	9214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812845
126	NC_017467	CGT	2	6	9245	9250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812845
127	NC_017467	CTG	2	6	9306	9311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812845
128	NC_017467	ACA	2	6	9357	9362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812845
129	NC_017467	TTG	2	6	9465	9470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812846
130	NC_017467	TAC	2	6	9499	9504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812846
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132	NC_017467	TGG	2	6	9790	9795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812846
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134	NC_017467	TGG	2	6	9853	9858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812846
135	NC_017467	AAT	2	6	9866	9871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812846
136	NC_017467	AAT	3	9	9878	9886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812846
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151	NC_017467	GAT	2	6	12534	12539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812848
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252	NC_017467	ATA	2	6	21964	21969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812857
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254	NC_017467	TAA	2	6	22022	22027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812857
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259	NC_017467	TGA	2	6	22373	22378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812857
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