MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017465	ATTCT	2	10	9115	9124	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017465	CCCAA	2	10	10081	10090	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017465	AAAGA	2	10	10266	10275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017465	TATGA	2	10	10615	10624	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017465	CGGCG	2	10	13536	13545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017465	CCGGT	2	10	13882	13891	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017465	CATGT	2	10	16491	16500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017465	GGAGA	2	10	23991	24000	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017465	TGGAG	2	10	26432	26441	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017465	TAGGA	2	10	31154	31163	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017465	AGTGA	2	10	39108	39117	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017465	GTCCT	2	10	41341	41350	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017465	GCGAA	2	10	42484	42493	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017465	TGACC	2	10	44140	44149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017465	GGGGC	2	10	44150	44159	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017465	AAGTT	2	10	57560	57569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017465	GCCCC	2	10	59222	59231	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_017465	CCAAA	2	10	64282	64291	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017465	GGTTT	2	10	66262	66271	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017465	GGCCT	2	10	66351	66360	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017465	TTTGG	2	10	70132	70141	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017465	CCAGC	2	10	73340	73349	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017465	GTAAT	2	10	74150	74159	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017465	ACCAG	2	10	76430	76439	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017465	AAAGA	2	10	83936	83945	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017465	GATTA	2	10	90283	90292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017465	ACTTT	2	10	90537	90546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017465	AAATT	2	10	93048	93057	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017465	ATTAA	2	10	96812	96821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017465	ATTAA	2	10	97444	97453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017465	CTTGG	2	10	97592	97601	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017465	TAAAA	2	10	98867	98876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017465	CGATG	2	10	105348	105357	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017465	ATGGC	2	10	109092	109101	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017465	GTAAC	2	10	112835	112844	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017465	AATTT	2	10	125769	125778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017465	TTCGT	2	10	126214	126223	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017465	AGGGG	2	10	128469	128478	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017465	TAGTT	2	10	129588	129597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017465	AGGTG	2	10	129658	129667	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017465	AAGGT	2	10	130193	130202	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017465	ATCAA	2	10	135202	135211	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017465	CGGTA	2	10	136781	136790	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017465	TCAAA	2	10	137367	137376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017465	GCGCT	2	10	137425	137434	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017465	GGACA	2	10	137756	137765	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017465	GTGAA	2	10	137968	137977	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017465	CGGTA	2	10	148895	148904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017465	CGAAC	2	10	152119	152128	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017465	GGCCA	2	10	152845	152854	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017465	CACCC	2	10	152857	152866	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
52	NC_017465	AAAGC	2	10	158367	158376	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017465	ATTAC	2	10	161415	161424	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017465	GCAAG	2	10	161896	161905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017465	AATTT	2	10	165533	165542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017465	GTATA	2	10	169189	169198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017465	TCGTG	2	10	170560	170569	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017465	GGGAG	2	10	171762	171771	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017465	AATTG	2	10	173265	173274	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017465	CTTTC	2	10	174350	174359	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017465	ACCAC	2	10	177940	177949	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_017465	GCCAA	2	10	180032	180041	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017465	CTCGG	2	10	192292	192301	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017465	TCGTG	2	10	194717	194726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017465	GGGAG	2	10	195919	195928	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017465	AATTG	2	10	197422	197431	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017465	TGCTT	2	10	205120	205129	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017465	ATCCG	2	10	206619	206628	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017465	GGACC	2	10	210277	210286	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017465	CACGA	2	10	217184	217193	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017465	CAAAT	2	10	218003	218012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017465	AATTT	2	10	224205	224214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017465	AGTGG	2	10	234352	234361	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017465	CAAGC	2	10	236654	236663	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017465	GCCGG	2	10	246908	246917	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017465	CCAAC	2	10	247099	247108	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_017465	CTTGT	2	10	251612	251621	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017465	ACGTC	2	10	251931	251940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017465	TCGTG	2	10	274480	274489	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017465	TAAGT	2	10	275342	275351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017465	GGGAG	2	10	275876	275885	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017465	AATTG	2	10	277380	277389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017465	AAGGG	2	10	278793	278802	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017465	TGGTG	2	10	284143	284152	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017465	GCCTG	2	10	284163	284172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017465	GCCTT	2	10	284676	284685	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017465	TAGCC	2	10	284912	284921	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017465	CGCTT	2	10	286142	286151	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017465	AAAGT	2	10	287762	287771	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017465	TCTGC	2	10	291015	291024	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017465	ACTTT	2	10	291128	291137	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017465	CCACG	2	10	307052	307061	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_017465	CGGAC	2	10	307594	307603	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017465	ATTGA	2	10	307761	307770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017465	GTCGG	2	10	307973	307982	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017465	GCCCA	2	10	322476	322485	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_017465	GGCCC	2	10	323801	323810	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_017465	AAATT	2	10	324031	324040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017465	GGATC	2	10	332964	332973	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017465	CGTTA	2	10	336878	336887	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017465	GGCCG	2	10	338228	338237	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017465	CCAAC	2	10	344515	344524	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_017465	GGGAA	2	10	357017	357026	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017465	CGGCT	2	10	357619	357628	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017465	AACAC	2	10	358821	358830	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017465	CAGTG	2	10	358886	358895	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017465	CGTGG	2	10	359260	359269	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017465	AACGT	2	10	368058	368067	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017465	GGACC	2	10	371764	371773	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017465	GGTAC	2	10	374727	374736	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017465	GCAAA	2	10	378900	378909	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017465	GAAGA	2	10	384659	384668	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017465	TTCAG	2	10	384787	384796	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017465	TTGAT	2	10	384997	385006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017465	GGGCC	2	10	389447	389456	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017465	AAAAG	2	10	389753	389762	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017465	CCACG	2	10	395908	395917	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_017465	GGCTA	2	10	398375	398384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017465	GAGGT	2	10	398833	398842	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017465	AAAGG	2	10	401344	401353	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017465	GGGAA	2	10	401669	401678	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017465	TGGGT	2	10	417134	417143	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017465	CCCGT	2	10	417178	417187	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_017465	CCGGG	2	10	419291	419300	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017465	ACTTA	2	10	422314	422323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017465	TGGGT	2	10	422842	422851	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017465	ACCAA	2	10	425438	425447	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017465	CGGGA	2	10	426191	426200	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017465	CAACG	2	10	428034	428043	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017465	GGGGA	2	10	434246	434255	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017465	AACTC	2	10	434738	434747	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017465	CGTCC	2	10	438068	438077	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_017465	GGGGT	2	10	457356	457365	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017465	TAGGT	2	10	460248	460257	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017465	CTATT	2	10	464721	464730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017465	ATCTG	2	10	465542	465551	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017465	TCCGT	2	10	466057	466066	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017465	GGTAA	2	10	489062	489071	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017465	AAGCC	2	10	489326	489335	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017465	CGCTA	2	10	489872	489881	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017465	GGAAC	2	10	490109	490118	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017465	CAACC	2	10	498255	498264	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_017465	TTTGG	2	10	506214	506223	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017465	GATGG	2	10	518407	518416	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017465	AGCCC	2	10	525455	525464	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_017465	TAAAC	2	10	533547	533556	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017465	TCCGC	2	10	534039	534048	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_017465	CGGTG	2	10	534334	534343	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017465	CAAAA	2	10	538974	538983	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017465	TGATA	2	10	541747	541756	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017465	AGAAA	2	10	551274	551283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_017465	CTGTA	2	10	587491	587500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_017465	CCGGA	2	10	604331	604340	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
166	NC_017465	CCCGG	2	10	606889	606898	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
167	NC_017465	CTGGC	2	10	608534	608543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
168	NC_017465	CGGGC	2	10	613466	613475	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
169	NC_017465	GCGGG	2	10	616285	616294	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
170	NC_017465	GTCCG	2	10	618739	618748	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
171	NC_017465	GTTCA	2	10	619067	619076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_017465	GAAAA	2	10	624103	624112	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017465	CGGGT	2	10	649002	649011	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
174	NC_017465	TTATA	2	10	650769	650778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_017465	CAAGC	2	10	684186	684195	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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193	NC_017465	CGTTA	2	10	716375	716384	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_017465	TATCA	2	10	750906	750915	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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242	NC_017465	GTATT	2	10	919447	919456	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_017465	GGCCA	2	10	937149	937158	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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264	NC_017465	GTAAG	2	10	977402	977411	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_017465	TGGCA	2	10	996573	996582	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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275	NC_017465	CTTTT	2	10	1020023	1020032	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_017465	CTTGG	2	10	1025082	1025091	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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280	NC_017465	AAGGT	2	10	1029851	1029860	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_017465	TGCCA	2	10	1054154	1054163	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_017465	GCCTA	2	10	1069844	1069853	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
286	NC_017465	ACGCC	2	10	1073849	1073858	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
287	NC_017465	ACCGG	2	10	1075922	1075931	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
288	NC_017465	AAATT	2	10	1078207	1078216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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