MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 17910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017465	ACC	2	6	470	475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811787
2	NC_017465	AGC	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811787
3	NC_017465	GTC	2	6	505	510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811787
4	NC_017465	CGC	2	6	590	595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811787
5	NC_017465	ATG	2	6	679	684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811787
6	NC_017465	AAC	2	6	796	801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811787
7	NC_017465	CCG	2	6	903	908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811787
8	NC_017465	CGA	2	6	939	944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811787
9	NC_017465	TTC	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811787
10	NC_017465	ACA	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811787
11	NC_017465	GAA	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811787
12	NC_017465	ACG	2	6	1193	1198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811787
13	NC_017465	TGA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811787
14	NC_017465	CCA	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811787
15	NC_017465	ACG	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811787
16	NC_017465	ACA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811787
17	NC_017465	TCG	2	6	1445	1450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811787
18	NC_017465	CGG	2	6	1524	1529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811787
19	NC_017465	AAG	2	6	1583	1588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811787
20	NC_017465	CAA	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811788
21	NC_017465	TTC	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811788
22	NC_017465	GTC	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811788
23	NC_017465	ACA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811788
24	NC_017465	AGA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811788
25	NC_017465	TTC	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811788
26	NC_017465	AAG	2	6	2061	2066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811788
27	NC_017465	CAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811788
28	NC_017465	CGG	2	6	2131	2136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811788
29	NC_017465	GCT	2	6	2196	2201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811788
30	NC_017465	GCG	2	6	2214	2219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811788
31	NC_017465	GAT	2	6	2441	2446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811788
32	NC_017465	ACG	2	6	2586	2591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811788
33	NC_017465	GGC	2	6	2618	2623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811788
34	NC_017465	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811788
35	NC_017465	CCA	2	6	2648	2653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811788
36	NC_017465	CGT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811788
37	NC_017465	GAA	2	6	2742	2747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811788
38	NC_017465	ACG	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811788
39	NC_017465	GAT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811789
40	NC_017465	CTG	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811789
41	NC_017465	GCG	2	6	3606	3611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811789
42	NC_017465	GCC	2	6	3630	3635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811789
43	NC_017465	CCA	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
44	NC_017465	ACC	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
45	NC_017465	CAG	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811789
46	NC_017465	CAA	2	6	3905	3910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811789
47	NC_017465	AGT	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811789
48	NC_017465	GGC	2	6	4012	4017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811789
49	NC_017465	ACC	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
50	NC_017465	AGA	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811789
51	NC_017465	GCC	2	6	4128	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811789
52	NC_017465	GAG	2	6	4148	4153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811789
53	NC_017465	ACC	2	6	4262	4267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
54	NC_017465	TGA	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811789
55	NC_017465	GAC	2	6	4340	4345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811789
56	NC_017465	GAC	2	6	4364	4369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811789
57	NC_017465	CAC	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
58	NC_017465	CAC	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
59	NC_017465	AGG	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811789
60	NC_017465	CAA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
61	NC_017465	GAA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811790
62	NC_017465	ACG	2	6	4565	4570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811790
63	NC_017465	CCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811790
64	NC_017465	CAC	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811790
65	NC_017465	TCG	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811790
66	NC_017465	CGA	2	6	4692	4697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811790
67	NC_017465	TGA	2	6	4716	4721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811790
68	NC_017465	TTG	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811790
69	NC_017465	ATC	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811790
70	NC_017465	TCC	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811790
71	NC_017465	CGG	2	6	4866	4871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811790
72	NC_017465	GTC	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811790
73	NC_017465	TAC	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811790
74	NC_017465	GAC	2	6	5023	5028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811790
75	NC_017465	ACA	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
76	NC_017465	AAC	2	6	5374	5379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
77	NC_017465	CCG	2	6	5519	5524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811790
78	NC_017465	ATG	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811790
79	NC_017465	TCG	2	6	5672	5677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811790
80	NC_017465	CGC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811790
81	NC_017465	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811790
82	NC_017465	CCT	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811790
83	NC_017465	GAA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811790
84	NC_017465	CGA	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811790
85	NC_017465	CAA	2	6	6012	6017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
86	NC_017465	ATC	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811790
87	NC_017465	TGT	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811790
88	NC_017465	GAT	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811790
89	NC_017465	GCC	2	6	6150	6155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811790
90	NC_017465	GGT	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811790
91	NC_017465	AAC	2	6	6293	6298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
92	NC_017465	GCC	2	6	6364	6369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811790
93	NC_017465	CGG	2	6	6412	6417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811790
94	NC_017465	GAA	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811790
95	NC_017465	AAG	2	6	6686	6691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811791
96	NC_017465	GCC	2	6	6848	6853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811791
97	NC_017465	TGC	2	6	6897	6902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811791
98	NC_017465	CAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811791
99	NC_017465	ACG	2	6	6942	6947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811791
100	NC_017465	TGA	2	6	7086	7091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811791
101	NC_017465	TGA	2	6	7119	7124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811791
102	NC_017465	GAG	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811791
103	NC_017465	TCG	2	6	7269	7274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811791
104	NC_017465	ACG	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811791
105	NC_017465	CGC	2	6	7415	7420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811791
106	NC_017465	AAC	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811791
107	NC_017465	TAC	2	6	7550	7555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811791
108	NC_017465	AAG	3	9	7566	7574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811791
109	NC_017465	CGG	2	6	7583	7588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811791
110	NC_017465	TCG	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811791
111	NC_017465	ATC	2	6	7670	7675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811791
112	NC_017465	CAT	2	6	7678	7683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811791
113	NC_017465	GAC	2	6	7727	7732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811791
114	NC_017465	GCC	2	6	7838	7843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811791
115	NC_017465	CCA	2	6	7870	7875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811791
116	NC_017465	GAA	3	9	7997	8005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811791
117	NC_017465	CAT	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811791
118	NC_017465	GAC	2	6	8117	8122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811791
119	NC_017465	CTT	2	6	8167	8172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811791
120	NC_017465	GCC	2	6	8231	8236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811791
121	NC_017465	CCT	2	6	8257	8262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811791
122	NC_017465	CCG	2	6	8289	8294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811791
123	NC_017465	AGA	2	6	8314	8319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811791
124	NC_017465	CTT	2	6	8338	8343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811791
125	NC_017465	TGA	2	6	8437	8442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811791
126	NC_017465	CGC	2	6	8506	8511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811791
127	NC_017465	CCG	3	9	8550	8558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811791
128	NC_017465	AAG	2	6	8660	8665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811791
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130	NC_017465	TGG	2	6	8787	8792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811791
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252	NC_017465	TAG	2	6	22157	22162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811797
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