MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Ignavibacterium album JCM 16511 chromosome

Total Repeats: 1841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017464	TTACTA	2	12	1751	1762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017464	ATTAAA	2	12	2249	2260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385808588
3	NC_017464	GTGATG	2	12	2584	2595	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385808588
4	NC_017464	TTGATG	2	12	3781	3792	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385808589
5	NC_017464	AGAGGA	2	12	4729	4740	50 %	0 %	50 %	0 %	385808591
6	NC_017464	GCAACC	2	12	11223	11234	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385808594
7	NC_017464	GCACCA	2	12	12111	12122	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385808594
8	NC_017464	TTTTAT	2	12	12788	12799	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808594
9	NC_017464	TGATTT	2	12	14540	14551	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808595
10	NC_017464	ATTTTT	2	12	15391	15402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808596
11	NC_017464	CTGCAA	2	12	25085	25096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808602
12	NC_017464	ATAAAA	2	12	30625	30636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017464	TGAATT	2	12	35089	35100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385808614
14	NC_017464	TCGCTT	2	12	39307	39318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385808620
15	NC_017464	TATGTT	2	12	39608	39619	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808620
16	NC_017464	GCAAGT	2	12	40780	40791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385808620
17	NC_017464	GAAATT	2	12	42852	42863	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808621
18	NC_017464	GGCGGA	2	12	43800	43811	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385808621
19	NC_017464	GAAGCT	2	12	45635	45646	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385808623
20	NC_017464	TTGCAT	2	12	46758	46769	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385808625
21	NC_017464	AAAAAG	2	12	47002	47013	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808626
22	NC_017464	GACGAA	2	12	48732	48743	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385808628
23	NC_017464	AAGATT	2	12	55992	56003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808633
24	NC_017464	AATTGA	2	12	56553	56564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808634
25	NC_017464	ACATCA	2	12	58256	58267	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385808637
26	NC_017464	CATTCA	2	12	59515	59526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385808639
27	NC_017464	TTTCTT	2	12	59543	59554	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385808639
28	NC_017464	ATCCTG	2	12	60955	60966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385808640
29	NC_017464	GCTTCT	2	12	61671	61682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385808640
30	NC_017464	ATCTTG	2	12	63051	63062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385808642
31	NC_017464	AATTTC	2	12	70557	70568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808651
32	NC_017464	ACATCA	2	12	71137	71148	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385808651
33	NC_017464	TGTACA	2	12	77886	77897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808658
34	NC_017464	TATTTT	2	12	78514	78525	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808658
35	NC_017464	CATAAC	2	12	79254	79265	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385808658
36	NC_017464	TTGAAA	2	12	80280	80291	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808658
37	NC_017464	ATCATA	2	12	81124	81135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385808658
38	NC_017464	TTGCAA	2	12	83011	83022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808659
39	NC_017464	AAGTTC	2	12	83315	83326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808659
40	NC_017464	ATTTGG	2	12	91465	91476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017464	TTGAAC	2	12	94303	94314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808675
42	NC_017464	TAAAGA	2	12	97344	97355	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385808677
43	NC_017464	ACTTTT	2	12	100796	100807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017464	GAACAA	2	12	108450	108461	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385808697
45	NC_017464	ATTTTT	2	12	114695	114706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808706
46	NC_017464	GTTGAT	2	12	116844	116855	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385808709
47	NC_017464	AACTTT	2	12	119016	119027	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808710
48	NC_017464	CGAATC	2	12	121493	121504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808713
49	NC_017464	GAGTTG	2	12	123051	123062	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385808715
50	NC_017464	AAAATA	2	12	123241	123252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385808715
51	NC_017464	GTTTAT	2	12	124747	124758	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808717
52	NC_017464	TGTTAT	2	12	124791	124802	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808717
53	NC_017464	AGTTTG	2	12	125289	125300	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385808717
54	NC_017464	AATTTT	2	12	128992	129003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385808720
55	NC_017464	ATTCAA	2	12	129160	129171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385808720
56	NC_017464	GGATTA	2	12	129329	129340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385808720
57	NC_017464	TAAAGT	2	12	131160	131171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808722
58	NC_017464	GTTTTT	2	12	133215	133226	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017464	ATTAGA	2	12	133298	133309	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017464	ATTATC	2	12	135397	135408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808725
61	NC_017464	AAATAT	2	12	136747	136758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385808726
62	NC_017464	CTCAAG	2	12	137251	137262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808726
63	NC_017464	TATAAA	2	12	138105	138116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385808728
64	NC_017464	GAAAAA	2	12	145252	145263	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808731
65	NC_017464	GCAGTT	2	12	147307	147318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385808735
66	NC_017464	ACTCAG	2	12	147427	147438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808735
67	NC_017464	TTATGT	2	12	148462	148473	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808737
68	NC_017464	CCTTCT	2	12	151050	151061	0 %	50 %	0 %	50 %	385808739
69	NC_017464	AAGAAA	2	12	153235	153246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808741
70	NC_017464	TCTTAC	2	12	153922	153933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385808742
71	NC_017464	ATAATT	2	12	157035	157046	50 %	50 %	0 %	0 %	385808744
72	NC_017464	GAAGTG	2	12	158799	158810	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385808746
73	NC_017464	ACTAAA	2	12	159067	159078	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385808746
74	NC_017464	AAGATG	2	12	160925	160936	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385808747
75	NC_017464	CAATTT	2	12	161600	161611	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808747
76	NC_017464	AAAGAC	2	12	162026	162037	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385808747
77	NC_017464	AATAAA	2	12	163039	163050	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385808748
78	NC_017464	TCTTTT	2	12	165763	165774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385808754
79	NC_017464	ACCTTT	2	12	166044	166055	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385808754
80	NC_017464	CTTGTT	2	12	166415	166426	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385808755
81	NC_017464	TTAAAT	2	12	172837	172848	50 %	50 %	0 %	0 %	385808757
82	NC_017464	ATTTAT	2	12	173273	173284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385808758
83	NC_017464	TGTTTG	2	12	173915	173926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385808759
84	NC_017464	TTGCAT	2	12	175808	175819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385808760
85	NC_017464	TTCAAC	2	12	176198	176209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385808761
86	NC_017464	TGGTTC	2	12	178053	178064	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385808762
87	NC_017464	CAAAAT	2	12	178435	178446	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385808763
88	NC_017464	AGCAAG	2	12	182443	182454	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385808765
89	NC_017464	TAATTT	2	12	182786	182797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017464	TGAAAT	2	12	183332	183343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808766
91	NC_017464	TTTAAT	2	12	184575	184586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385808766
92	NC_017464	CAATTG	2	12	186168	186179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808768
93	NC_017464	CTCAAA	2	12	187390	187401	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385808768
94	NC_017464	TGATTA	2	12	189068	189079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385808769
95	NC_017464	TATGTA	2	12	189189	189200	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385808769
96	NC_017464	GCTATT	2	12	189669	189680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385808769
97	NC_017464	ATGTTT	2	12	189850	189861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808769
98	NC_017464	TCGGAT	2	12	190063	190074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385808769
99	NC_017464	ATTTTT	2	12	192598	192609	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017464	TTTGGA	2	12	195503	195514	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385808772
101	NC_017464	TACAGA	2	12	198871	198882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385808775
102	NC_017464	AAATGT	2	12	202473	202484	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808777
103	NC_017464	TTTACT	2	12	203258	203269	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385808777
104	NC_017464	AATTGG	2	12	203534	203545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017464	TTCAGC	2	12	205373	205384	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385808779
106	NC_017464	TAAAAA	2	12	208881	208892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017464	TTCTTT	2	12	209607	209618	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385808783
108	NC_017464	GCCTGT	2	12	211610	211621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385808787
109	NC_017464	CTTTTT	2	12	213789	213800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385808789
110	NC_017464	GAAAAA	2	12	219147	219158	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808796
111	NC_017464	AAATAA	2	12	222726	222737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385808799
112	NC_017464	GTAATG	2	12	223781	223792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385808800
113	NC_017464	CAACTG	2	12	224096	224107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808800
114	NC_017464	ATCAAT	2	12	231011	231022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385808804
115	NC_017464	ATCTTT	2	12	231182	231193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385808804
116	NC_017464	AAAGAA	2	12	231600	231611	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808804
117	NC_017464	TAAAAA	2	12	232800	232811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017464	GAAATG	2	12	233159	233170	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385808806
119	NC_017464	TGAATT	2	12	234794	234805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385808807
120	NC_017464	TTTATC	2	12	238181	238192	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385808811
121	NC_017464	AAAGTA	2	12	240680	240691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385808814
122	NC_017464	ATTTTT	2	12	244074	244085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808817
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126	NC_017464	TTTTGC	2	12	253231	253242	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385808821
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152	NC_017464	AGAATA	2	12	289796	289807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385808861
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230	NC_017464	ATATGT	2	12	461742	461753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
231	NC_017464	ATATTG	2	12	463140	463151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385809010
232	NC_017464	ATCTAT	2	12	463598	463609	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385809010
233	NC_017464	GGTAAT	2	12	466085	466096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385809011
234	NC_017464	AAAACT	2	12	466979	466990	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385809011
235	NC_017464	TACAAC	2	12	467107	467118	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385809011
236	NC_017464	ATTGTC	2	12	469326	469337	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385809013
237	NC_017464	TTTTCC	2	12	477148	477159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385809020
238	NC_017464	CATTAA	2	12	480586	480597	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385809023
239	NC_017464	TTCTGT	2	12	481842	481853	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385809025
240	NC_017464	CTTGAG	2	12	485140	485151	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385809029
241	NC_017464	TGATAA	2	12	486969	486980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385809030
242	NC_017464	TCTAAT	2	12	489078	489089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
243	NC_017464	CGTATT	2	12	490581	490592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385809032
244	NC_017464	ATTTTT	2	12	490794	490805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_017464	TTGATG	2	12	500756	500767	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385809044
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247	NC_017464	TTAGTT	2	12	502905	502916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385809045
248	NC_017464	AGCTAA	2	12	504619	504630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385809046
249	NC_017464	ATATTC	2	12	505289	505300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385809046
250	NC_017464	GATTAA	2	12	507480	507491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385809048
251	NC_017464	AGAAAA	2	12	512831	512842	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385809054
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254	NC_017464	GATTTT	2	12	518831	518842	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385809059
255	NC_017464	GAAGTG	2	12	523055	523066	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385809062
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257	NC_017464	GAACAT	2	12	523425	523436	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385809062
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259	NC_017464	CCAATG	2	12	524698	524709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385809063
260	NC_017464	TTGAAT	2	12	525579	525590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385809064
261	NC_017464	GCTTCA	2	12	526261	526272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385809064
262	NC_017464	CAAGAC	2	12	527031	527042	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385809065
263	NC_017464	TTCTTT	2	12	527353	527364	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385809065
264	NC_017464	AGAGCA	2	12	530406	530417	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385809067
265	NC_017464	ATAATT	2	12	531435	531446	50 %	50 %	0 %	0 %	385809070
266	NC_017464	TGATTG	2	12	535684	535695	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385809071
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268	NC_017464	GAACTC	2	12	541669	541680	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385809074
269	NC_017464	TTCTTT	2	12	542296	542307	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385809074
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272	NC_017464	ATGCAA	2	12	548598	548609	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385809081
273	NC_017464	AGATTC	2	12	548643	548654	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385809081
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282	NC_017464	ATCTTT	2	12	574711	574722	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385809108
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284	NC_017464	GAAAAA	2	12	578559	578570	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385809108
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286	NC_017464	AATTGT	2	12	584457	584468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385809112
287	NC_017464	AAGAGG	2	12	586535	586546	50 %	0 %	50 %	0 %	385809114
288	NC_017464	AGTTCA	2	12	587868	587879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
289	NC_017464	GTTGAA	2	12	588126	588137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385809115
290	NC_017464	TGCTAT	2	12	591001	591012	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385809116
291	NC_017464	TTACTT	2	12	591735	591746	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385809116
292	NC_017464	GATGCA	2	12	593470	593481	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385809118
293	NC_017464	ACTTGT	2	12	594868	594879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385809119
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295	NC_017464	TTCCTG	2	12	596079	596090	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385809120
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298	NC_017464	AAATAA	2	12	605709	605720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385809128
299	NC_017464	ACTTGA	2	12	609917	609928	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385809133
300	NC_017464	AATTAT	2	12	613540	613551	50 %	50 %	0 %	0 %	385809135
301	NC_017464	GCAAGA	2	12	615873	615884	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385809136
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319	NC_017464	CTTTCT	2	12	654758	654769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385809170
320	NC_017464	AATGGG	2	12	660129	660140	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385809176
321	NC_017464	AATTGC	2	12	661029	661040	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385809176
322	NC_017464	CTGAAG	2	12	662380	662391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385809177
323	NC_017464	CTTGAG	2	12	664651	664662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385809181
324	NC_017464	ATATTT	2	12	665155	665166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385809181
325	NC_017464	ATTGAT	2	12	667643	667654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
326	NC_017464	TATAAG	2	12	670457	670468	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385809186
327	NC_017464	CTGTTG	2	12	672225	672236	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385809187
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329	NC_017464	CCGGAA	2	12	674536	674547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385809188
330	NC_017464	TCTTAA	2	12	675215	675226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385809189
331	NC_017464	CGAAAG	2	12	679968	679979	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385809192
332	NC_017464	TACATT	2	12	680406	680417	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385809192
333	NC_017464	ATCTGA	2	12	684126	684137	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385809194
334	NC_017464	AAATAA	2	12	684657	684668	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_017464	ATGCAG	2	12	684942	684953	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385809195
336	NC_017464	AGAAAA	2	12	685384	685395	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385809195
337	NC_017464	TTCAGA	2	12	686108	686119	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385809196
338	NC_017464	TGAAGT	2	12	687017	687028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385809197
339	NC_017464	AAGCAA	2	12	688199	688210	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385809199
340	NC_017464	GCTTTT	2	12	690494	690505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385809201
341	NC_017464	ATCGGA	2	12	692969	692980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385809204
342	NC_017464	AATATG	2	12	693617	693628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385809205
343	NC_017464	CATATC	2	12	698015	698026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385809209
344	NC_017464	TTGAAT	2	12	698708	698719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385809210
345	NC_017464	GAAAAT	2	12	700613	700624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385809211
346	NC_017464	TGTTGA	2	12	700971	700982	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385809212
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462	NC_017464	TCAAAG	2	12	915193	915204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385809410
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