MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ignavibacterium album JCM 16511 chromosome

Total Repeats: 398

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017464	AAATC	2	10	1511	1520	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017464	AAAAG	2	10	15980	15989	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017464	TTTTA	2	10	16602	16611	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017464	TAATT	2	10	20926	20935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017464	TAAAT	2	10	26518	26527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017464	TAATT	2	10	30727	30736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017464	TAAAA	2	10	33612	33621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017464	TTTTC	2	10	36461	36470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017464	AAATT	2	10	45799	45808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017464	TAAGT	2	10	48155	48164	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017464	AAATA	2	10	48314	48323	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017464	CAAAA	2	10	49966	49975	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017464	TTATG	2	10	52449	52458	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017464	CATTT	2	10	57300	57309	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017464	TCAAA	2	10	64846	64855	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017464	ATCTC	2	10	85449	85458	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017464	TGTTT	2	10	100238	100247	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017464	AAATT	2	10	108211	108220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017464	AGCGA	2	10	113985	113994	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017464	ACTTC	2	10	114115	114124	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017464	AAAAT	2	10	118058	118067	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017464	ATAAA	2	10	118362	118371	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017464	TCTTT	2	10	121317	121326	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017464	TAATT	2	10	121720	121729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017464	TGCTA	2	10	136023	136032	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017464	TAAAT	2	10	140325	140334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017464	TTCAT	2	10	142773	142782	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017464	TAGAA	2	10	146170	146179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017464	TAAGA	2	10	150246	150255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017464	TTGTT	2	10	155410	155419	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017464	ACTGC	2	10	168715	168724	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017464	TAATG	2	10	168767	168776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017464	ATTTT	2	10	176100	176109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017464	ATTAT	2	10	185714	185723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017464	TTCGG	2	10	224806	224815	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017464	AACAG	2	10	231786	231795	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017464	GAAAT	2	10	237141	237150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017464	ATTTT	2	10	273376	273385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017464	AAATT	2	10	279880	279889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017464	ATAAA	2	10	303882	303891	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017464	AATCA	2	10	306602	306611	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017464	TAGAT	2	10	307744	307753	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017464	TTAAA	2	10	312703	312712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017464	TAAAA	2	10	315654	315663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017464	GTGAT	2	10	327263	327272	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017464	AAATT	2	10	327353	327362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017464	TAAAA	2	10	327363	327372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017464	TTCAT	2	10	354074	354083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017464	TTCTG	2	10	362583	362592	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017464	CTTAT	2	10	367459	367468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017464	GCAAT	2	10	382743	382752	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017464	ATGAA	2	10	390391	390400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017464	ATGAA	2	10	410332	410341	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017464	GATTT	2	10	410347	410356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017464	AATTT	2	10	443119	443128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017464	TAATT	2	10	444397	444406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017464	ATGAA	2	10	452884	452893	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017464	ATTTT	2	10	467620	467629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017464	AATCC	2	10	467711	467720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017464	CATAG	2	10	486344	486353	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017464	TTAAA	2	10	490754	490763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017464	CAATT	2	10	508973	508982	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017464	TGATT	2	10	520191	520200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017464	ATTTT	2	10	553170	553179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017464	TTAAA	2	10	568174	568183	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017464	GTTTT	2	10	585037	585046	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017464	TTTGA	2	10	585296	585305	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017464	GATTT	2	10	595584	595593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017464	ATATT	2	10	635355	635364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017464	TAAAA	2	10	637475	637484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017464	TAAAA	2	10	640909	640918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017464	ATTTA	2	10	663765	663774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017464	GAAAA	2	10	724716	724725	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017464	AATAA	2	10	727130	727139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017464	TTAAA	2	10	748695	748704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017464	CATTA	2	10	756077	756086	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017464	TGAAA	2	10	757937	757946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017464	AGAAA	2	10	762707	762716	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017464	TAACT	2	10	773531	773540	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017464	GAAAG	2	10	774485	774494	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017464	AAAAT	2	10	776762	776771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017464	TTTAC	2	10	776999	777008	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017464	TGAGG	2	10	797634	797643	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017464	AGGGG	2	10	798733	798742	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017464	CCTAT	2	10	799495	799504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017464	AGCTC	2	10	799825	799834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017464	ATAAA	2	10	814899	814908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017464	ATAAA	2	10	824092	824101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017464	ATTGA	2	10	848812	848821	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017464	GTTTT	2	10	857863	857872	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017464	TTTCA	2	10	857922	857931	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017464	CAAAC	2	10	866138	866147	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017464	ATTTT	2	10	878037	878046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017464	CTTTT	2	10	878075	878084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017464	TAAAA	2	10	883121	883130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017464	GTTTT	2	10	899720	899729	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017464	ATGCT	2	10	909798	909807	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017464	ATAAA	2	10	928751	928760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017464	AATCA	2	10	934126	934135	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017464	TTATT	2	10	941206	941215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017464	ATTAA	2	10	941258	941267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017464	CAAAT	2	10	947119	947128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017464	TAATT	2	10	961609	961618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017464	TTTTG	2	10	970741	970750	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017464	TCTTT	2	10	974471	974480	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017464	AAAAG	2	10	975677	975686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017464	TTATT	2	10	977336	977345	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017464	AATAT	2	10	979556	979565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017464	ATTTT	2	10	1033104	1033113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017464	ATTTG	2	10	1039161	1039170	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017464	TTGAG	2	10	1039178	1039187	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017464	TTTTA	2	10	1053657	1053666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017464	GGTTT	2	10	1055020	1055029	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017464	TAATC	2	10	1061108	1061117	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017464	TATAA	2	10	1061780	1061789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017464	TTCAA	2	10	1082302	1082311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017464	ATTTT	2	10	1087274	1087283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017464	TGAAA	2	10	1105022	1105031	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017464	CTTAA	2	10	1144029	1144038	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017464	TAGTA	2	10	1150545	1150554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017464	GCTCA	2	10	1150625	1150634	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017464	AATTA	2	10	1160180	1160189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017464	AAATA	2	10	1160258	1160267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017464	ATTTG	2	10	1199506	1199515	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017464	ATTTT	2	10	1212822	1212831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017464	ATTTA	2	10	1238976	1238985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017464	AAATT	2	10	1252305	1252314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017464	ACTTT	2	10	1256342	1256351	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017464	TTTAC	2	10	1259253	1259262	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017464	TTATC	2	10	1264645	1264654	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017464	ATAAA	2	10	1312609	1312618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017464	TAATT	2	10	1318622	1318631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017464	AATTA	2	10	1319730	1319739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017464	ATAAA	2	10	1355333	1355342	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017464	TAACA	2	10	1374551	1374560	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017464	CTTCA	2	10	1374780	1374789	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017464	TGAAA	2	10	1377749	1377758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017464	CTTTG	2	10	1382635	1382644	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017464	GTATT	2	10	1385639	1385648	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017464	TATTT	2	10	1387124	1387133	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017464	AACGA	2	10	1389200	1389209	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017464	AACGA	2	10	1389632	1389641	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017464	AACGA	2	10	1389743	1389752	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017464	AACGA	2	10	1389841	1389850	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017464	AACGA	2	10	1389941	1389950	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017464	AACGA	2	10	1390207	1390216	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017464	AACGA	2	10	1390303	1390312	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017464	AACGA	2	10	1390401	1390410	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017464	AACGA	2	10	1390587	1390596	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_017464	TAATA	2	10	1464566	1464575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017464	TTAAT	2	10	1465254	1465263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017464	GAAAA	2	10	1465293	1465302	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017464	TGGAA	2	10	1471090	1471099	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017464	AAAAT	2	10	1482793	1482802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017464	ATTTT	2	10	1511377	1511386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_017464	AAAAT	2	10	1543156	1543165	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_017464	AAAGT	2	10	1646717	1646726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017464	AAAGT	2	10	1646850	1646859	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017464	AAAGT	2	10	1646983	1646992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017464	AAAGT	2	10	1647116	1647125	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017464	AAAGT	2	10	1647249	1647258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_017464	ATTTT	2	10	1705056	1705065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017464	ATAAA	2	10	1709367	1709376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017464	TAATT	2	10	1726943	1726952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_017464	TGAAA	2	10	2746348	2746357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.